제품

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2

집중적이고 포괄적인 엑솜 인리치먼트를 제공하는 최고 성능의 인간 전장 엑솜 시퀀싱 솔루션입니다.

  • Data Sheet PDF 1 MB
    2 버전
6.5시간

Assay 시간

약 2시간

수작업 시간

DNA 50~1000 ng 

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 키트는 신뢰할 수 있는 인간 전장 엑솜 시퀀싱(WES)을 위한 빠르고, 높은 성능 및 비용 효과적인 워크플로우를 제공합니다.

  • 보고된 공개 데이터베이스의 변이에 대해 높은 커버리지를 제공하는 이 집중적인 패널로 인간 엑솜의 포괄적인 커버리지를 확보하십시오.

  • GC 드롭아웃을 줄이고 커버리지 균일성을 향상하도록 업데이트된 워크플로우로 GC 함량이 높은 표적에 대한 커버리지를 개선하십시오.

     

  • 내장된 수율 표준화와 절편화 및 인덱싱 단계를 결합한 빠른 프로토콜을 제공하는 신속하고 사용하기 쉬운 전장 엑솜 시퀀싱(WES) 워크플로우로 시간과 노력을 절약하십시오.

  • 스파이크인 패널로 손쉽게 표적 커버리지를 추가하거나 강화하고 미토콘드리아 유전체 커버리지를 선택하거나 관심 표적에 초점을 맞춘 맞춤형 패널을 설계할 수 있습니다.

엑솜 콘텐츠를 맞춤 설정하기

추가적인 맞춤형 인리치먼트 패널을 통해 손쉽게 WES 실험에  표적을 추가하거나  중요한 표적의 커버리지를 강화할 수 있습니다. 맞춤형 Illumina Custom Enrichment Panel v2를 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 하이브리드화 반응에 스파이크인으로 추가해 보세요. Illumina DesignStudio 도구, 무료 시퀀싱 assay 설계 도구 또는 Illumina Concierge 설계 팀의 도움을 받아 맞춤형 WES 스파이크인 패널을 설계할 수 있습니다. 추가 미토콘드리아 유전체 커버리지는 Twist Bioscience for Illumina 미토콘드리아 패널을 사용하여 독립적으로 통합하거나 맞춤형 스파이크인 패널과 결합하여 통합할 수 있습니다.

Illumina Custom Enrichment Panel v2 보기

단일 공급업체의 전장 엑솜 시퀀싱 워크플로우

키트에는 라이브러리 준비 및 하이브리드화 시약, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel, 클린업, 크기 선별용 비드 및 인덱싱 구성 요소가 포함되어 있습니다. 라이브러리 프렙, 시퀀싱 및 DRAGEN 분석을 직접 Illumina에서 제공받아 WES 워크플로우를 완료하십시오.

사양

Assay 시간 6.5시간
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇
Content specifications Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Exome 2.5 Panel 
37.5 Mb coding content (≥ 99% of RefSeq, CCDS, ClinVar and ACMG pathogenic/likely pathogenic variants, COSMIC Cancer Gene Census), OMIM Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel covers the circular mitochondrial genome ChrM (16,659 bp, 37 genes)
수작업 시간 약 2시간
사용량 DNA 50~1000 ng 
기기 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
작용 기전 BLT(Bead-Linked Transposome) 및 하이브리드 캡처 chemistry
방법 표적 DNA 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱, 표적 인리치먼트
Multiplexing Pre-enrichment pooling of up to 12-plex is tested. Kit configuration supports multiplexing up to 192 samples, up to 384 samples is possible with added unique dual index sets.
핵산 종류 DNA
On-target reads >90% based on performance during internal testing 
특수 샘플의 종류 혈액, 타액
종 카테고리 인간
기술 시퀀싱
Uniformity >97% based on average performance from internal testing on control gDNA samples
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 생식세포 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

필수 제품

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 키트에는 라이브러리 프렙, 인리치먼트, 인리치먼트 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터 시약이 포함되어 있습니다. 원하는 경우 다른 인덱스 세트를 선택해 보세요.

Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel은 미토콘드리아 DNA 변이의 인리치먼트 및 시퀀싱을 가능하게 하는 선택형 기성 콘텐츠 스파이크인 패널입니다.  

Illumina Custom Enrichment v2 프로브 패널은 선택사항으로 제공되는 맞춤형 인리치먼트 패널로, 표적 커버리지를 확장하거나 강화하기 위해 스파이크인으로 엑솜 워크플로우에 추가할 수 있습니다.

직접 혈액 투입의 경우, Flex Lysis 시약 키트가 필요합니다. 

Infinium MIDI Heatblock Insert는  SciGene HybEx Microheating 시스템에 적합하며 인리치먼트 단계에 필요합니다 .

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 키트 에는 Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 패널 이 포함되어 있습니다. 커버리지를 강화시키거나 연장하기 위해 선택형 패널을 하이브리드화 반응에 추가할 수 있습니다. 

Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel 또는 Illumina Custom Enrichment Panel v2는 스파이크인 패널로  사용될 수 있습니다.  사용자 가이드는 엑솜 하이브리드화 반응에서 최대 2개의 스파이크인 패널 사용을 지원합니다.  

커스텀 인리치먼트 패널은 DesignStudio 설계 도구 또는 Illumina Concierge 설계 팀을 통해 설계할 수 있습니다.

/ 건

애플리케이션

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2는 샘플 준비부터 데이터 분석 및 해석에 이르기까지 전장 엑솜 시퀀싱을 지원하는 포괄적인 워크플로우의 일부입니다. 

워크플로우 예시

1
프렙

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2

2
시퀀스
3
분석

일부 국가에서는 판매되지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 출처에 API 콜을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NextSeq 2000 시스템

런당 샘플 수(플로우 셀 종류별): P2: 19, P3: 57(50× 평균 표적 커버리지, 42M 리드, 4.2 Gb 데이터 기준)

2 × 101 bp
NovaSeq 6000 시스템

런당 샘플 수(플로우 셀 종류별): SP: 34, S1: 69, S2: 176, S4: 428 50× 평균 표적 커버리지, 42M 리드, 4.2 Gb 데이터 기준 참고: S4: 428에는 NovaSeq Xp Workflow 또는 추가 인덱스가 필요합니다.

2 × 101 bp

관련 애플리케이션 및 방법

전장 엑솜 시퀀싱

Whole-exome sequencing is used to investigate protein-coding regions of the genome to uncover genetic influences on disease and population health.

유전 질환 및 복합 질환 연구

다양한 유전적 복합 질환에 대한 연구를 가속화하기 위한 포괄적인 어레이 및 차세대 시퀀싱 솔루션입니다.

암 유전체학 연구

Illumina의 시퀀싱 및 마이크로어레이 기술은 DNA부터 RNA 분석, 후성유전학 등에 이르기까지 다양한 암 유전체학 연구 애플리케이션을 지원합니다.

문서

제품 관련 자료
  • Data Sheet PDF 1 MB
    2 버전
지원 문서

그림 자료

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2의 향상된 성능

라이브러리는 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment 또는 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 중 하나를 사용하여 생성되고 농축되었습니다. 강화된 라이브러리를 NovaSeq 6000 시스템에서 시퀀싱하고  DRAGEN Enrichment 앱을 사용하여 분석했습니다.

질병 관련 표적의 일관된 커버리지

1.5시간(주황색) 또는 16시간(파란색)의 하이브리드화 시간을 사용하는 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 는 공공 데이터베이스 표적의 20× 이상에서 높은 평균 커버리지를 보여줍니다.

성능 지표

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2는 1.5 시간 (주황색) 및 16 시간 (파란색) 하이브리드화 시간 모두에서 높은 인리치먼트 및 커버리지 지표 를 보여줍니다.

맞춤형 스파이크인 패널로 선별된 표적의 커버리지 증가

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 프로토콜은 Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel이 커버하는 영역을 표적화하는 커스텀 스파이크인 패널을 사용하는 조건과 사용하지 않는 조건 모두에서 진행되었습니다. 그 후, 스파이크인 패널로 표적화된 영역 전반에서 커버리지를 평가하였습니다.

리소스

비디오 리소스

축소판

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 - 과학자의 관점

엑솜 균일성은 생각보다 더 중요합니다. 이탈리아 베로나 대학교의 유전학 교수인 Massimo Delledonne이 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2를 평가하여 얻은 실무 통찰력을 공유합니다. 그는 실제 연구에서 엑솜 균일성, 재현성 및 워크플로우 간소함이 중요한 이유에 대해 이야기합니다.

라이브러리 프렙 (2)

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2, (S) Tagmentation Set B (96 Samples, 12-plex)

20155541

Includes Illumina DNA Prep with Enrichment library preparation and enrichment reagents, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel, Illumina Purification Beads, and Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation for whole exome enrichment of 96 libraries (eight, 12-plex enrichment reactions).

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2, (S) Tagmentation Set D (96 Samples, 12-plex)

20155543

Includes Illumina DNA Prep with Enrichment library preparation and enrichment reagents, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel, Illumina Purification Beads, and Illumina DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation for whole exome enrichment of 96 libraries (eight, 12-plex enrichment reactions).

Sign in to add to cart or see pricing.

List Price:

Discounts:

표시 /

선택 품목 요약

제품

수량

단가

합 ( 품목)

아직 선택하신 품목이 없습니다

페이지를 나가시기 전에 장바구니에 해당 제품을 담아주세요.

자주 묻는 질문

예, 10~49 ng의 gDNA 투입량을 사용할 수 있습니다. 그러나, 본 프로토콜은 최종 사전 인리치먼트 라이브러리 수율이 < 50 ng인 경우 표준화하지 않으며, 따라서 인리치먼트 전과 후에 라이브러리의 정량화 및 표준화가  필요합니다.

혈액 샘플의 경우, 본 프로토콜은 EDTA 채취 튜브에 채취한 신선 혈액으로  검증되었습니다 . 다른 항응고제를 사용할 수 있지만 이 키트에 사용 시, 성능을 보장할 수 없습니다.

타액 샘플의 경우, 본 프로토콜은  Oragene DNA 타액 채취 튜브에서 채취한 타액에 대해서만  검증되었습니다 . 

이전에 Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment라고 알려진 제품은 이제 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment(카탈로그 번호 20077595 및 20077596)라는 이름으로 선보입니다. Exome Panel의 올리고는 변경되지 않았지만 포함된 인덱스는 Illumina DNA/RNA UD Indexes로 업데이트되었습니다.

새로운 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment v2 키트 (카탈로그 번호 20155541 및 20155543)는  또한   GC가 풍부한 표적 영역에서 더 나은 커버리지를 가능하게 하는 개선된 시약과 동일한 Exome Panel 콘텐츠를 포함합니다. 

/ 건

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

Illumina DNA Prep with Enrichment

맞춤형 및 고정 인리치먼트 패널을 위한 빠른 통합 워크플로우 및 옵션을 갖춘 광범위한 애플리케이션을 위한 완벽한 표적 재시퀀싱 솔루션입니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

전문가와 상담하기

Illumina의 제품 및 서비스에 대한 정보 또는 Illumina의 기술 관련 질문에 대한 답변을 원하신다면 연락해 주시기 바랍니다.