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TruSight RNA Pan-Cancer Panel

혈액, 골수, FFPE 조직을 포함한 많은 RNA 샘플의 종류에서 유전자 발현, 변이, 유전자 융합 검출 연구를 위한 1,385개의 암 유전자를 표적으로 합니다.

2.5일

Assay 시간

11시간

수작업 시간

Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

MiniSeq System에 사용 가능한 시약 및 Library Prep Kit 번들

추가 비용 절감과 편의성을 위해 MiniSeq 시약과 Library Prep Kit를 함께 주문하세요(카탈로그 번호 20005611).

개요

TruSight RNA Pan-Cancer Panel은 벤치탑 시퀀싱 시스템에서 제한되고 품질이 저하된 샘플의 암 관련 RNA 전사물에 대해 심층적이고 비용 효율적인 평가를 제공합니다.

  • 암 경로와 연관된 1,385개 유전자에 대해 종합적인 관점을 제시하기 위한 업계에서 검증된 콘텐츠

  • 유전자 발현 수준, 변이 및 유전자 융합(gene fusion) 조사를 지원하는 암 경로에 대한 종합적인 관점

  • 포르말린에 고정한 파라핀 포매(FFPE) 샘플을 포함한 대부분의 샘플의 종류를 위한 저사용량 프로토콜

까다로운 샘플의 효율적인 분석

라이브러리는 Total RNA 사용량 10 ng(또는 FFPE 샘플은 20 ng)만으로 준비할 수 있습니다. 관련 유전자의 부분집합에 중점을 두어 높은 민감도로 RNA-Seq을 지원합니다.

직관적인 클라우드 기반 데이터 분석

유전자 발현 프로필을 제공하고, 유전자 융합을 식별하며, 단일 염기서열 변이와 small indel을 보고하여 암 연구자들에게 포괄적이고 직관적인 솔루션을 제공하는 BaseSpace RNA-Seq Alignment 앱을 사용하여 분석을 수행할 수 있습니다.

샘플 데이터 세트

BaseSpace Sequence Hub에 등록 또는 로그인하여 MiSeq System 데이터 및 MiSeq System 데이터(런 보기 또는 프로젝트 보기)에 액세스해 보세요.

사양

Assay 시간 2.5일
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
암 종류 전체 고형암, 혈액학, 고형암
콘텐츠 사양 1,385개의 표적 유전자와 21,043개의 표적 엑손 영역이 포함된 전체 고형암 패널. 암 유전자 융합과 관련된 유전자 507개 포함.
설명 다양한 암 유형의 유전자 융합, 변이 및 유전자 발현 변화에 대한 연구를 지원하는 암 관련 RNA 전사물의 포괄적인 평가를 수행합니다.
수작업 시간 11시간
사용량 Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템
방법 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트, 커스텀 시퀀싱
핵산 종류 RNA
특수 샘플의 종류 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직
종 카테고리 인간
기술 시퀀싱
변이 클래스 유전자 융합, 체세포 변이, 새로운 전사물, 전사물 변이

필수 제품

TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A 및/또는 B 구매가 필요합니다. 각 세트에는 12개의 인덱스가 있는 48개의 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고가 포함되어 있습니다. 각 인덱스는 4개의 개별 샘플에 사용하기에 충분합니다. 두 세트 모두 함께 사용하여 최대 24개의 샘플을 풀링할 수 있습니다.

MiniSeq System을 사용하는 경우 시약 및 Library Prep Kit를 TruSight Pan-Cancer Set A MiniSeq Kit와 함께 주문할 수 있습니다.

/ 건

애플리케이션

TruSight RNA Pan-Cancer Panel은 연구용 FFPE 조직 및 기타 종양학 샘플에서 암 관련 RNA 전사물 및 유전자 융합 검출에 대한 포괄적인 평가를 제공합니다.

워크플로우 예시

1
준비
2
시퀀싱
3
분석

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
MiniSeq 시스템

Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 3 million reads per sample)

2 × 75 bp(최대 권장)
MiSeq 시스템

8 samples per run with v3 reagents (based on 3 million reads per sample)

2 × 75 bp(최대 권장)

관련 애플리케이션 및 방법

전체 고형암 분석

차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)을 이용한 전체 고형암 분석은 종양 기원과 관계없이 많은 흔한 암과 연관된 유전자 변이 및 이상을 포괄적으로 평가합니다.

Cancer RNA 시퀀싱

암 유전자 발현 및 전사체(transcriptome) 변화를 검출하고 RNA 차세대 시퀀싱(RNA-Seq)으로 새로운 암 전사물(transcript)을 식별합니다.

Low-Quality/FFPE RNA-Seq 솔루션

Find FFPE RNA sequencing solutions that yield high-quality results from degraded FFPE tissues and other low-quality samples.

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법
소아 백혈병의 암 경로에 대한 새로운 관점

문서

제품 관련 자료
Support documentation

비교하기

TruSight RNA Pan-Cancer Panel TruSight RNA Fusion Panel
Assay 시간 2.5일 2.5일
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
암 종류 전체 고형암, 혈액학, 고형암 전체 고형암, 혈액학, 고형암
콘텐츠 사양 1,385개의 표적 유전자와 21,043개의 표적 엑손 영역이 포함된 전체 고형암 패널. 암 유전자 융합과 관련된 유전자 507개 포함.
설명 다양한 암 유형의 유전자 융합, 변이 및 유전자 발현 변화에 대한 연구를 지원하는 암 관련 RNA 전사물의 포괄적인 평가를 수행합니다. 암 연구를 위한 비용 효과적인 NGS 솔루션을 제공하여 고형 종양, 육종, 혈액암을 포함한 여러 암 유형에 관여하는 507개의 유전자를 심층적으로 포괄합니다. 
수작업 시간 11시간 11시간
사용량 Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템
방법 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트, 커스텀 시퀀싱 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
핵산 종류 RNA RNA
특수 샘플의 종류 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직
종 카테고리 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 유전자 융합, 체세포 변이, 새로운 전사물, 전사물 변이 유전자 융합

선택 도구:

Library Prep and Array Kit Selector

Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs. Filter by method, species, and more. Compare, share, and order kits.

그림 자료

TruSight Pan-Cancer 캡처 chemistry

TruSight RNA PanCancer Panel은 Total RNA로부터 표적 관심 영역을 분리하기 위한 단순하고 간소화된 방법을 제공합니다.

새로운 유전자 fusion partner 식별

(A) 흑색종에서 추출된 3개의 서로 다른 FFPE 샘플의 Total RNA 크기 분포는 Bioanalyzer에 표시됩니다. (B) 표에는 융합 쌍 중 하나의 유전자(강조 표시됨)만을 표적으로 했을 때FFPE 샘플에서 유전자 fusion partner의 검출이 표시.

TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A

RS-303-1002

12개 인덱스가 있는 48개 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고가 포함되어 있습니다. 각 인덱스는 4개의 개별 샘플에 사용하기에 충분합니다. TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B와 함께 사용하면 최대 24개의 샘플을 풀링할 수 있습니다.

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TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set B

RS-303-1003

12개 인덱스가 있는 48개 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고가 포함되어 있습니다. 각 인덱스는 4개의 개별 샘플에 사용하기에 충분합니다. TruSight RNA Pan-Cancer Panel Set A와 함께 사용하면 최대 24개의 샘플을 풀링할 수 있습니다.

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TruSight RNA Pan-Cancer Set A MiniSeq Kit

20005611

12개의 인덱스가 있는 48개의 샘플에 대한 라이브러리 준비 시약 및 올리고와 6개의 MiniSeq High Output Kit(150사이클)가 포함되어 있습니다.

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Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel

20046104

Trusight RNA Pan-Cancer Oligo Panel에는 1플렉스 인리치먼트를 사용하는 경우 시퀀싱을 위한 총 96개의 RNA 샘플에 충분한 올리고가 포함되어 있고, 3플렉스* 인리치먼트를 사용하는 경우 시퀀싱을 위한 288개의 총 RNA 샘플에 충분한 올리고가 포함되어 있습니다. 이 패널에는 라이브러리 준비가 포함되어 있지 않습니다. *멀티플렉싱 인리치먼트를 허용하는 라이브러리 준비 워크플로우에만 적용됩니다.

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자주 묻는 질문

TruSight RNA Pan-Cancer 워크플로우는 여섯 개의 주요 단계를 포함합니다.

  • 가닥 RNA-Seq 라이브러리 생성
  • 표적 영역에 대해 바이오틴화된 프로브 혼성화
  • 스트렙타비딘 비드를 사용한 표적 캡처
  • 비드에서 캡처된 절편 용출
  • 클러스터 및 시퀀싱 생성
  • BaseSpace RNA Alignment 앱으로 데이터 분석 및 유전자 융합 검출

더 알아보기.

프로브는 1,385개의 암 유전자를 표적으로 하고 모든 유전자의 모든 엑손에 걸쳐 유전자 융합을 검출하도록 설계되었습니다.

MiSeq System에서 RNA-Seq 워크플로우(FASTQ만 해당)를 실행하고 BaseSpace Sequence Hub에 데이터를 스트리밍합니다. BaseSpace RNA-Seq Alignment 앱은 TruSight RNA Pan-Cancer Panel에서 받은 데이터를 분석하여 유전자 융합 표, 변이 표 및 유전자 발현 표가 포함되어 있는 간략한 결과 요약을 제공합니다. 분석을 위해 자체 파이프라인을 사용할 수도 있습니다.

/ 건

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq 시약 키트 v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에서 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.

NextSeq 500/550 v2.5 Kits

Reagent v2.5 키트는 시작 형광 강도를 유지하는 탄성 플로우 셀을 사용하여 이전 버전에 비해 안정성과 성능을 개선합니다.

Nextera XT DNA Library Preparation Kit

낮은 DNA 사용량 요구 사항에 따라 작은 유전체, PCR 앰플리콘, 플라스미드, cDNA 시퀀싱을 위한 DNA 라이브러리를 준비하는 90분 워크플로우를 제공합니다.

MiSeq 시약 키트 v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

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