여러 고형암 유형에 걸쳐 48개의 유전자를 조사하는 견고한 DNA NGS assay입니다.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel은 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 샘플에서 비소세포폐암(NSCLC), 대장암, 흑색종, 자궁내막암, 췌장암, 위장관 간질성 종양(GIST), 방광암, 갑상선암 및 신경교종 등 고형암의 DNA에 존재하는 주요 변이를 동시에 검사하는 견고한 48개 유전자 assay입니다. 또한 POLD1 및 POLE과 같이 면역 종양학에서 잠재적으로 중요한 유전자를 분석합니다.
이 패널은 FFPE 조직에서 분리한 DNA에서 단일 염기서열 변이(SNV) 및 삽입/결실(indel)을 검출하도록 설계되었습니다.
이 assay는 효율적인 단일 튜브 표적 인리치먼트를 위한 타일링된 앰플리콘 기반 라이브러리 프렙 chemistry인 Illumina의 독자적인 Stem Loop Inhibition-Mediated 증폭(SLIMamp) 기술을 사용합니다.
이 워크플로우를 통해 실험실은 모든 NGS 실험실에서 자체적으로 수행 가능한 단일 튜브, 타일링된 증폭 방식으로 샘플과 결과를 직접 관리할 수 있습니다.
| Assay 시간 | 샘플에서 보고까지 48시간 |
|---|---|
| 암 종류 | 전체 고형암, 고형암 |
| 콘텐츠 사양 | 48개 유전자 |
| 설명 | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel은 다양한 고형암 유형에서 48개 유전자를 분석하는 견고한 DNA 차세대 시퀀싱(NGS) assay입니다. |
| 수작업 시간 | 약 3시간 |
| 사용량 | DNA 20~80ng |
| 기기 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템 |
| 작용 기전 | 타일링된 앰플리콘을 사용하는 Multiplex PCR |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | DNA |
| 앰플리콘 수 | 풀 1개: 앰플리콘 246개 |
| 반응 수 | 키트당 반응 24개 |
| 표적적중 리드 | 98% |
| 특수 샘플의 종류 | FFPE 조직 |
| 종 카테고리 | 인간 |
| 표적 삽입 크기 | 154bp |
| 기술 | 시퀀싱 |
| 균일성 | 98% |
| 변이 클래스 | 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel) |
또한 Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel에는 Pillar 인덱스 키트, 시퀀싱 시약 및 DRAGEN Amplicon 또는 PiVAT 2차 분석 소프트웨어를 사용해야 합니다. 추가적인 변이 해석이 필요한 경우 Illumina Connected Insights를 권장합니다.
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel은 고형암 샘플에서 생식세포 및 FFPE DNA의 시퀀스를 탐색하고자 하는 연구자를 위해 수많은 관심대상 유전자 영역의 NGS 기반 표적 시퀀싱을 지원합니다.
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel
| Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel | TruSight Oncology 500 v2 | Pillar oncoReveal Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel | Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel | |
|---|---|---|---|---|
| Assay 시간 | 샘플에서 보고까지 48시간 | 3–4 days from sample input to final results | 샘플에서 보고까지 48시간 | 48 hr from sample to report |
| 암 종류 | 전체 고형암, 고형암 | 전체 고형암, 고형암 | 전체 고형암, 고형암 | 전체 고형암, 고형암 |
| 콘텐츠 사양 | 48개 유전자 | 78개 유전자 작은 전체 종양 종양학 패널 | 18 driver genes and 83 fusion partners | |
| 설명 | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel은 다양한 고형암 유형에서 48개 유전자를 분석하는 견고한 DNA 차세대 시퀀싱(NGS) assay입니다. | Enables comprehensive genomic profiling of solid tumors using DNA and RNA from FFPE tissue. Provides variant detection and biomarker assessment from a single sample for broad tumor characterization. | DNA 및 RNA 함량이 있는 78- 유전자 앰플리콘 기반 패널, 간단한 단일 튜브 워크플로 | RNA fusion panel interrogating 18 driver genes and 83 fusion partners from FFPE tissue |
| 수작업 시간 | 약 3시간 | ~7 hrs for manual workflow | 약 3시간 | 약 3시간 |
| 사용량 | DNA 20~80ng | 30 ng DNA (as low as 10 ng), 40 ng RNA (as low as 20 ng) | DNA 5~80 ng, RNA 10~50 ng | 10–50 ng RNA |
| 기기 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템 |
| 작용 기전 | 타일링된 앰플리콘을 사용하는 Multiplex PCR | 타일링된 앰플리콘을 사용하는 Multiplex PCR | ||
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱 | 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 | 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 | 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA | RNA |
| 앰플리콘 수 | 풀 1개: 앰플리콘 246개 | Pool 1 (DNA): 341 amplicons. Pool 2 (RNA): >80 amplicons plus MET exon 14 skipping | Pool 1: 83 amplicons | |
| 반응 수 | 키트당 반응 24개 | DNA 24개/RNA 24개 | 24 reactions per kit | |
| 표적적중 리드 | 98% | 99.5% ± 0.1% | ||
| 특수 샘플의 종류 | FFPE 조직 | FFPE 조직 | 혈액, 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 | FFPE 조직 |
| 종 카테고리 | 인간 | 인간 | 인간 | 인간 |
| 표적 삽입 크기 | 154bp | 평균: 120 bp(범위 86~185 bp) | 120 bp | |
| 기술 | 시퀀싱 | 시퀀싱 | 시퀀싱 | 시퀀싱 |
| 균일성 | 98% | 98.2% ± 0.7% | ||
| 변이 클래스 | 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel) | 유전자 융합, 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV), Tumor mutational burden (TMB), Genomic instability score (GIS), Microsatellite instability (MSI) | 유전자 융합, 체세포 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) | 유전자 융합 |
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유전자 목록
Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel은 48개의 유전자를 포함합니다.
패널 사양
FFPE 조직에서 분리한 DNA 조사를 위한 Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel 사양입니다.
OncoReveal Solid Tumor Panel v2 24 Rxn
HDA-CH-3003-24
SLIMamp™ 워크플로우의 48개 유전자(24개 샘플) 고형암 DNA 패널
List Price:
Discounts:
Indices PI501-8, PI701-4 (32 combinations, 96 reactions)
IDX-PI-1001-96
인덱스 PI501-8, PI701-4(조합 32개, 반응 96개)
List Price:
Discounts:
Kit D, indices PI501-8, PI701-12
IDX-PI-1004-192
Kit D, indices PI501-8, PI701-12
List Price:
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간소화된 운영, 고급 화학 및 온보드 인포매틱스는 광범위한 애플리케이션을 지원하는 사용하기 쉽고 빠르며 유연한 기기를 제공합니다.
MiSeq i100 시리즈용 시약은 사용하기 쉬운 카트리지와 유연한 시퀀싱 옵션을 위한 다중 플로우 셀 구성을 갖추었습니다.
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A pan-cancer panel with combined DNA/RNA content, utilizing the single-tube SLIMamp workflow for fast library prep and turnaround time.
A targeted BRCA1/2 gene panel, utilizing the single-tube SLIMamp workflow for fast library prep and turnaround time.
A robust assay targeting key mutations in MPL, JAK2, and CALR genes, utilizing single-tube SLIMamp workflow for fast library prep and turnaround time.
A 58-gene pan-cancer panel with combined DNA content, utilizing the single-tube SLIMamp workflow for fast library prep and turnaround time.
여러 고형암 유형에 걸쳐 FFPE 조직으로부터 83개의 RNA fusion을 표적으로 하는 표적 패널입니다.
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
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