Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment

cDNA 합성과 어댑터 태깅을 단일 단계로 결합한 RNA 엑솜 분석을 위한 빠르고 간단한 라이브러리 프렙 워크플로우.

6.5시간

Assay 시간

< 1.5시간

수작업 시간

1–1000 ng RNA

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina Papid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 Illumina 포트폴리오에서 가장 빠르고 손쉬운 RNA-Seq 엑솜 라이브러리 프렙 솔루션을 제공합니다. 간소화된 30분 단일 튜브 반응은 cDNA 합성과 온비드 태그멘테이션을 결합합니다. 신속한 워크플로우는 저투입 또는 저하된 RNA 샘플을 지원하고 고정밀 표적 데이터를 제공합니다.

주요 기능

빠르고 간소화된 라이브러리 프렙

인리치먼트를 포함한 간소화된 전체 워크플로우는 바로 시퀀싱 가능한 엑솜 인리치된 RNA 라이브러리를 생성하는 데 6.5시간밖에 걸리지 않으며, 수작업 시간은 1.5시간 미만입니다.

최적화된 인리치먼트 성능

90분 하이브리드화로 포괄적이고 최신의 Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel을 사용하여 코딩 전사체의 집중적인 커버리지를 제공합니다.

저사용량 샘플에서 고품질 데이터

우수한 표적 커버리지를 달성하면서 소량의 1 ng의 고품질 RNA 또는 20 ng의 FFPE* RNA만으로도 재현 가능한 결과를 얻을 수 있습니다.

*FFPE, 포르말린 고정, 파라핀 포매 샘플.

사양

필수 제품

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment 키트에는 Illumina Rapid RNA Prep 키트, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel, 하이브리드화 시약 및 Illumina Purification Beads가 포함됩니다. 인덱스 세트는 별도로 판매됩니다.

/ 건

애플리케이션

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment를 사용하면 1.5시간 미만의 수작업 시간으로 최소 6.5시간 내에 전장 전사체 분석을 위한 바로 시퀀싱 가능한 RNA-Seq 라이브러리를 준비할 수 있습니다.

워크플로우 예시

1
프렙

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment

2
시퀀스
3
분석

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
MiSeq i100 Plus 시스템

플로우 셀당 샘플: 샘플당 25M 클러스터, 25M: 1, 50M: 2, 100M: 4

2 × 100bp

NextSeq 2000 시스템

플로우 셀당 샘플: 샘플당 25M 클러스터; P1: 4, P2: 16, P3: 48, P4: 72

2 × 100bp

NovaSeq X 시스템

플로우 셀당 샘플: 샘플당 25M 클러스터; 1.5B: 60(30/레인), 5B: 200(25/레인), 10B: 400(50/레인), 25B: 1,000(125/레인)

2 × 100bp

관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
Assay 시간 6.5시간
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
Description A fast and easy workflow for RNA exome analysis
수작업 시간 < 1.5시간
Input quantity 1–1000 ng RNA or 20–1000 ng FFPE RNA
기기 NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템
Mechanism of action Bead-linked transposome tagmentation, hybrid-capture enrichment
방법 엑솜 시퀀싱, mRNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 최대 384개의 고유한 듀얼 인덱스(UDI)
핵산 종류 RNA
특수 샘플의 종류 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직
종 카테고리 인간
가닥 특이성 비가닥(Non-stranded)
기술 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV)

그림 자료

illumina-rapid-total-rna-exome-2.5-figure2

코딩 전사물의 효율적인 인리치먼트

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment의 매핑 지표는 1 ng, 10 ng 및 100 ng의 범용 인간 참조(UHR) RNA와 FFPE RNA 참조 및 융합 RNA 믹스 상용 샘플 각각 25 ng의 다양한 투입량 전반에서 표적 리드 비율이 98% 이상임을 보여줍니다.

illumina-rapid-total-rna-exome-2.5-figure3

긴 하이브리드화 시간과 짧은 하이브리드화 시간에서 동등한 인리치먼트 지표

90분(주황색) 및 12시간(파란색)의 하이브리드화 소요 시간에서 Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment의 정렬된 리드 비율, 패딩된 고유 리드 인리치먼트, 절편 길이 중앙값, 복제율 및 평균 표적 커버리지를 1 ng, 10 ng 및 100 ng 범용 인간 참조(UHR) RNA의 다양한 투입량 전반에 걸쳐 보여줍니다. DRAGEN Enrichment v4.3.13에서 생성된 Picard 인리치먼트 지표입니다.

illumina-rapid-total-rna-exome-2.5-figure4

고/저 RNA 투입 전반에서 높은 재현성

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 1 ng 및 100 ng 범용 인간 참조(UHR) RNA 투입량 간 표준화된 유전자 수의 높은 상관관계(R2 = 0.99)를 보여줍니다. DRAGEN RNA v4.4에서 생성된 백만 개당 전사물(TPM)입니다.

리소스

DNA 추출, 절편화, 라이브러리 프렙 및 라이브러리 표준화를 간소화된 워크플로우로 통합하는 새로운 chemistry인 온비드 태그멘테이션에 대해 자세히 알아보세요. 이 접근법은 광범위한 투입량을 지원하여 다양한 샘플 종류에 걸쳐 유연성을 제공합니다.

라이브러리 프렙 (1)

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation (96 samples)

20158825

Includes reagents for preparing and enriching 96 samples of Rapid RNA libraries (32 hybridization reactions with 3 libraries each), with Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel, and Illumina Purification Beads. UD Indexes sold separately.

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인덱스 어댑터 (4)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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액세서리 제품 (3)

Illumina Purification Beads 30 ml

20119944

Illumina Purification Beads 30 ml

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Illumina Purification Bead, 100mL

20060057

라이브러리 클린업 및 크기 선발을 위한 비드 100 ml 컨테이너 1개가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약, 프로브 패널 및 인덱스를 별도로 구매해 보세요.

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Illumina Purification Bead, 400mL

20060058

라이브러리 클린업 및 크기 선발을 위한 비드 100 ml 컨테이너 4개가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약, 프로브 패널 및 인덱스를 별도로 구매해 보세요.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

1단계—Illumina Rapid RNA Prep이 cDNA 합성과 온비드 태그멘테이션을 단일 튜브에서 30분 반응으로 결합

2단계—인덱스 PCR 및 클린업

3단계—90분 하이브리드화로 RNA 엑솜 인리치

4단계—PCR 증폭 및 클린업

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 96개 샘플 구성으로 제공됩니다. 이 키트는 3-플렉스 인리치먼트를 32회 반응하도록 설계되었습니다.

Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment에는 Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel이 포함되며 Illumina RNA Prep with Enrichment에 비해 총 assay 시간이 30% 더 빠릅니다.

/ 건

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