Infinium Custom Methylation 키트에는 Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip과 시약이 포함되어 있어 연구자와 상용 사용자가 중요한 후성유전학 연구 애플리케이션을 위한 획기적인 assay를 개발할 수 있습니다.
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip
대규모의 표적 후성유전학적 애플리케이션을 위한 완전 맞춤형 메틸레이션 마이크로어레이.
5760 samples per week max (with 2 iScan systems, 1 AutoLoader 2x, and 2 Tecan robots over an 8-hour day)
샘플 처리량
어레이당 24개 샘플
샘플 수
500-100,000 user defined CpGs add-on capacity
표지자의 수
개요
고처리량 워크플로우
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip은 업데이트된 Infinium 자동화 프로토콜과 중아황산염 전환을 위한 자동화된 워크플로우를 갖춘 24샘플 형식으로 제공됩니다. 이러한 기능을 통해 워크플로우 효율성을 개선하고, 샘플 처리 비용을 절감하며, 사용자가 운영을 연간 최대 수십만 개의 샘플까지 확장할 수 있습니다.
맞춤형 콘텐츠
최대 10만 개의 추가 마커로 어레이를 사용자 지정하여 고유한 연구 도구를 만들 수 있습니다. 기존 상용 어레이 또는 후성유전학 데이터베이스에서 콘텐츠를 선택합니다.
입증된 Infinium chemistry
Infinium BeadChip 설계는 높은 수준의 메틸레이션 프로브 복제를 가능하게 하여, 메틸레이션 시퀀싱 실험에서 100배 커버리지(coverage)와 비교할 수 있는 높은 재현성을 제공합니다.1
Infinium Custom Methylation 키트의 주요 특징
사양
| Assay 종류 | Infinium HTS |
|---|---|
| 자동화 기능 | 자동 어레이 로더 |
| Description | Using the DesignStudio Assay Design Tool, this product allows labs to create high-throughput, custom, 24- or 48-sample BeadChips to efficiently and accurately assess methylation for up to 100,000 CpG sites in human and select nonhuman samples. |
| 사용량 | DNA 250 ng |
| 기기 | iScan System |
| 방법 | 메틸레이션 어레이 |
| 핵산 종류 | DNA |
| Number of markers | 500-100,000 user defined CpGs add-on capacity |
| 샘플 수 | 어레이당 24개 샘플 |
| Sample throughput | 5760 samples per week max (with 2 iScan systems, 1 AutoLoader 2x, and 2 Tecan robots over an 8-hour day) |
| 특수 샘플의 종류 | 혈액, 세포유리 DNA, 타액 |
| 종 카테고리 | 마우스, 인간 |
| Species details | Select non-human species available on DesignStudio only |
| 기술 | Microarray |
| 변이 클래스 | 차등 메틸화된 사이토신 |
필수 제품
Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip-24 키트를 구매해야 합니다. 각 키트에는 48개의 DNA 샘플을 증폭, 절편화, 하이브리드화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약과 함께 2개의 BeadChip이 포함되어 있습니다.
iScan 시퀀싱 시스템이 필요합니다.
샘플 및 BeadChip 준비, 샘플 스캐닝, 어레이 분석 소프트웨어를 사용한 1차 데이터 평가 및 분석을 포함하여 Infinium 프로토콜의 모든 필수 단계를 다루는 3일간의 실습 교육을 위한 선택적 소개 과정을 구매할 수 있습니다.
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건
애플리케이션
사용자는 Infinium Custom Methylation 키트를 사용하여 흔한 질병 연구, 암 연구, 후성유전학적 노화 및 영양유전학을 포함한 학술적 후성유전학 애플리케이션을 위해 유전체의 표적 영역에서 DNA 메틸레이션을 측정하는 맞춤형 고처리량 assay를 생성할 수 있습니다.
워크플로우 예시
방법
스캔
분석
관련 애플리케이션 및 방법
비교하기
| Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip | ||
|---|---|---|
| Assay 종류 | Infinium HTS | |
| 자동화 기능 | 자동 어레이 로더 | |
| Description | Using the DesignStudio Assay Design Tool, this product allows labs to create high-throughput, custom, 24- or 48-sample BeadChips to efficiently and accurately assess methylation for up to 100,000 CpG sites in human and select nonhuman samples. | |
| 사용량 | DNA 250 ng | |
| 기기 | iScan System | |
| 방법 | 메틸레이션 어레이 | |
| 핵산 종류 | DNA | |
| Number of markers | 500-100,000 user defined CpGs add-on capacity | |
| 샘플 수 | 어레이당 24개 샘플 | |
| Sample throughput | 5760 samples per week max (with 2 iScan systems, 1 AutoLoader 2x, and 2 Tecan robots over an 8-hour day) | |
| 특수 샘플의 종류 | 혈액, 세포유리 DNA, 타액 | |
| 종 카테고리 | 마우스, 인간 | |
| Species details | Select non-human species available on DesignStudio only | |
| 기술 | Microarray | |
| 변이 클래스 | 차등 메틸화된 사이토신 |
선택 도구
그림
Infinium I 및 II assay를 통해 CpG 영역의 커버리지 확대 가능
Illumina methylation BeadChip은 Infinium I 및 Infinium II assay를 모두 활용하여 전체 커버리지 범위 향상. (A) Infinium I 프로브 설계는 CpG 유전자좌당 2개의 비드 유형을 사용하며, 메틸화 및 비메틸화 상태에 대해 각각 1개씩 사용합니다. (B) Infinium II 프로브 설계는 두 상태 모두에 대해 1개의 비드 유형을 사용합니다.
설계 및 제조 프로세스
연구자들은 Illumina 기술 설계 및 고객 서비스 팀과 협력하여 BeadChip 표지자 콘텐츠를 개선하고 주문 및 생산 프로세스를 조정합니다.
- Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI, et al. 고처리량 전장 유전체 중아황산염 시퀀싱을 위한 라이브러리 준비 방법 및 시퀀싱 플랫폼의 체계적 평가. Sci Rep. 2019;9(1):10383. Published 2019 Jul 17. doi:10.1038/s41598-019- 46875-5
자원
유연하고 확장 가능한 Infinium 워크플로우 발견하기
커스텀 HTS 키트 (1)
Infinium Methyl Custom-24 Kit (48 Spl)
20042146
Infinium HTS iSelect Methyl Custom Beadchip, 48 samples
커스텀 EX 키트 (5)
Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (48 Spl)
20139002
This kit contains 1 custom BeadChip and reagents to process 48 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (96 Spl).
20139003
This kit contains 2 custom BeadChips and reagents to process 96 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-48 Kit (1152 Spl).
20139004
This kit contains 24 custom BeadChip and reagents to process 1152 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-24 Kit (48 Spl).
20139005
This kit contains 2 custom BeadChip and reagents to process 48 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
Inf Methyl EX iSelect-24 Kit (96 Spl).
20139006
This kit contains 4 custom BeadChip and reagents to process 96 samples throught the Infinium EX Methylation workflow.
서비스 (1)
Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site
20015273
Three-day, hands-on instruction at customer site to familiarize users with the essential steps in the Infinium protocol. Course provides hands-on training in sample and BeadChip preparation, sample scanning using the iScan System, and primary data evaluation and analysis using array analysis software.
표시 /
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요약
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자주 묻는 질문
Infinium HTS iSelect Custom BeadChip에는 Methylation EPIC BeadChip에서 사용할 수 있는 표준 SNP 컨트롤이 포함되어 있습니다.
메틸레이션 QC의 경우 GenomeStudio 2011, Methylation Module 또는 DRAGEN Array Methyl QC를 인간 종에 사용할 수 있습니다.
다운스트림 메틸레이션 분석 또는 비인간 종 분석의 경우, SeSAMe(https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/sesame.html) 또는 기타 타사 Bioconductor 도구가 현재 권장됩니다.
아니요, Illumina LIMS는 현재 Infinium HTS iSelect Methyl Custom BeadChip을 지원하지 않습니다.
아니요, FFPE 샘플은 현재 지원되지 않습니다.
수동 및 자동 형식의 Zymo Research EZ-96 Methylation-Lightning MagPrep 키트는 Infinium Methylation assay에 업스트림 사용하도록 지원합니다. 자세한 내용은 이 기술 노트의 결과를 검토하세요.
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건
참고 문헌
Zhou L, Ng HK, Drautz-Moses DI, et al. 고처리량 전장 유전체 중아황산염 시퀀싱을 위한 라이브러리 준비 방법 및 시퀀싱 플랫폼의 체계적 평가. Sci Rep. 2019;9(1):10383. Published 2019 Jul 17. doi:10.1038/s41598-019- 46875-5
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