DRAGEN 2차 분석

정확하고 포괄적이고 효율적인 분석

NGS 데이터를 처리하고 유전체 발견을 극대화하기 위한 바이오인포매틱스(bioinformatics ) 파이프라인 제품군입니다.

축소판

Illumina DRAGEN 소개

Illumina DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics) 2차 분석을 사용하면 규모와 분야에 관계없이 대부분의 검사실에서 강력한 첨단 데이터 분석 도구로 유전체의 가치를 극대화할 수 있습니다. DRAGEN 2차 분석(이전 명칭: DRAGEN Bio-IT Platform)은 연구 요구 사항을 충족하는 여러 배포 옵션, 애플리케이션 및 파이프라인을 통해 정확하고 포괄적이며 매우 효율적인 바이오인포매틱스를 제공합니다. 

주요 기능 및 이점

정확한 결과

매우 정확한 결과로 자신 있게 분석해 보세요. DRAGEN은 Precision FDA Truth Challenge v2 벤치마크 데이터를 사용하여 99.84% 정확도 점수를 달성했습니다.1 

포괄적인 솔루션

최대 30개의 오픈 소스 SW 도구를 대체할 수 있는 하나의 솔루션으로 전장 유전체, 엑솜, 메틸롬, 전사체를 분석해 보세요. 

효율적인 분석

모든 지원된 콜러로 40배 유전체를 약 34분 만에 처리해 보세요.2 DRAGEN ORA 압축으로 FASTQ 파일 크기를 5배로 줄여 보세요. DRAGEN Secondary Analysis는 유전체 분석 속도 부문에서 두 차례 세계 기록을 세웠습니다.3,4

비용 효율성

내장된 무손실 데이터 압축으로 보관 비용 80%를 절감합니다5. 사전 구성된 워크플로우로 분석 파이프라인 개발 및 유지를 위한 시간과 비용을 절감할 수 있습니다.


멀티플랫폼 접근성

데이터와 전문성에 따라 맞춤형으로 설정됩니다. DRAGEN 2차 분석은 온프레미스 서버, 클라우드 또는 직접 온보드에 탑재된 NovaSeq X 시리즈, NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템, MiSeq i100 시리즈를 통해 사용할 수 있습니다.

간소화된 통합

Illumina 시퀀싱 기기와 손쉽게 통합하여 시퀀싱부터 다운스트림 3차 분석까지 간소화된 워크플로우를 지원합니다.

배포 옵션

온프레미스 서버, 클라우드 기반 또는 기기 내 솔루션을 통해 DRAGEN 2차 분석에 접속해 보세요. 여러 배포 옵션으로 정확성, 속도 또는 유연성을 저하시키지 않고도 분석 요구 사항을 지원합니다. 

주요 분석 앱 및 파이프라인

DRAGEN 2차 분석은 광범위한 애플리케이션을 지원하여 여러 실험 유형에 대해 하나의 솔루션으로 포괄적인 커버리지를 제공합니다. 주요 애플리케이션 포함 사항:  

  • 생식세포(전장 유전체 및 인리치먼트)
  • 체세포(전장 유전체 및 인리치먼트, Tumor-only 및 tumor-normal)
  • RNA
  • 메틸화

DRAGEN 2차 분석에는 입력 데이터 파일을 수용할 수 있는 일련의 다용도 파이프라인이 포함되며 파이프라인의 다양한 단계에서 결과 파일을 생성합니다. 

woman on a computer

DRAGEN IGG: 인구집단 규모의 변이 발견 지원

DRAGEN Iterative gVCF Genotyper(IGG)는 대규모 코호트 전반에서 소규모 생식세포 변이의 빠르고 효율적인 응집 및 유전형 분석을 가능하게 하는 모집단 규모의 변이 분석을 위한 획기적인 솔루션을 제공합니다. 속도, 정확성 및 확장성을 위해 설계된 IGG는 증분 분석을 지원하므로 전체 데이터 세트를 재처리하지 않고도 새로운 샘플 배치를 추가할 수 있습니다.

우리는 DRAGEN [2차] 분석을 사용하여 약 50%의 비용 절감을 실현했습니다. 계산 시간을 기준으로 하면, 수동 방법과 비교했을 때 거의 두 배의 속도입니다.

DRAGEN 2차 분석을 사용하여 이룬 발전

유전 질환부터 종양학, 약리유전체학 등에 이르기까지, DRAGEN 2차 분석은 대다수 분야의 검사실이 NGS 운영을 확장하고 판도를 바꾸는 유전체 분석을 현실로 바꾸는 데 도움을 줄 수 있습니다.

주요 리소스

첨단 혁신을 통한 포괄적인 커버리지

DRAGEN v4.4는 유전체학 및 다중체학 분석을 위한 강력한 혁신을 제공합니다.

이 릴리스에서는 Heme WGS, 고형 WGS 종양 정상 및 미세 잔존 질환(MRD)을 위한 간소화된 파이프라인에 대한 새로운 종양학 애플리케이션을 소개합니다. 또한 개선된 구조적 변이 검출을 포함하여 생식세포 및 체세포 파이프라인에서 최신 분석 및 주요 정확도 향상을 위해 최적화된 이차 분석을 제공합니다.

주문형 웨비나를 시청하여 모든 새로운 기능을 살펴보고 DRAGEN v4.4가 샘플에서 인사이트로의 여정을 어떻게 가속화하는지 알아보십시오.

더 알아보기 및 문의하기

DRAGEN secondary analysis에 대한 자세한 내용과 주문 방법을 알아보고, 제품 설명서를 확인해 보세요. 또한 전문가와 상담하여 질문에 대한 답을 얻을 수 있습니다. 

참고 문헌

  1. Illumina. DRAGEN sets new standard for data accuracy in PrecisionFDA benchmark data. Optimizing variant calling performance with Illumina machine learning and DRAGEN graph. illumina.com/science/genomics-research/articles/dragen-shines-again-precisionfda-truth-challenge-v2.html. 2023년 3월 22일에 접속.
  2. Illumina internal data on file, 2024. DRAGEN Server v4에서 DRAGEN v4.3을 사용하여 계산된 런 타임. 구조적 변이, 반복 확장 및 표적 콜러에 대한 전체 콜러 제품군 콜이 포함됩니다.
  3. BioIT World. Children’s Hospital of Philadelphia, Edico set world record for secondary analysis speed. bio-itworld.com/ news/2017/10/23/children-s-hospital-of-philadelphia-edico-set-world-record-for-secondary-analysis-speed. 2017년 10월 23일에 출간. 2022년 3월 14일에 접속.
  4. San Diego Union Tribune. Rady Children’s Institute sets Guinness world record. sandiegouniontribune.com/95899028-132.html. 2018년 2월 12일 출간. 2022년 3월 14일에 접속.