Illumina Single Cell 3' RNA Prep

복잡한 워크플로우나 미세유체공학 없이 mRNA 포획, 바코드 및 라이브러리 준비를 가능하게 하는 접근성 높고 확장성이 우수한 단일세포 RNA-Seq 솔루션

~15 hr from cell capture to library prep

Assay 시간

10 mins for cell capture

수작업 시간

100 to 200,000 cells

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina Single Cell 3' RNA Prep는 손쉽고 확장 가능하며 미세유체공학 없는 워크플로우를 통해 보다 많은 실험실에서 단일세포 RNA-Seq(scRNA-Seq)를 사용 가능하게 해 줍니다. 연구자들은 다른 단일세포 접근 방식에서 발생하는 예산이나 기술적 제약 없이 보다 큰 규모의 다양한 멀티오믹스 연구를 수행할 수 있습니다.

확장 가능하고 유연한 솔루션

Illumina Single Cell 3' RNA Prep는 수백에서 수십만 개의 세포에 이르는 광범위한 처리 범위로 손쉽게 확장 가능합니다. 이처럼 세포 처리량이 증가하면 희귀한 세포 유형을 발견할 수 있습니다. 또한 이 시험법은 뛰어난 유연성으로 하나의 샘플을 실행하거나 샘플 멀티플렉싱을 병행하여 최대 96개의 샘플을 실행할 수 있습니다.

높은 수준의 성능

Illumina Single Cell 3' RNA Prep는 Illumina를 통해 얻을 수 있는 고품질 데이터로 높은 전사물 및 유전자 민감도를 제공합니다. 섬세한 분리 기법을 바탕으로 종종 다른 방법으로는 놓치기 쉬운 세포를 감지할 수 있습니다. 이 시험법은 확장된 멀티오믹스 응용법을 위한 맞춤형 단일세포 측정과 호환됩니다.

손쉬운 워크플로우

Illumina Single Cell 3' RNA Prep에는 값비싼 미세유체공학 장비나 노동 집약적인 프로토콜이 필요하지 않습니다. 유연한 중단 시점이 적용된 간단한 수동 워크플로우를 사용하여 벤치탑에서 단일세포 연구를 수행할 수 있습니다.

간단하며 확장 가능한 워크플로우

3' RNA sample prep

샘플 준비

볼텍스 믹서를 사용하여 템플릿화된 유화액을 생성해 단일세포 mRNA를 포획하고 바코드화합니다.

3' RNA library prep

라이브러리 준비

cDNA를 생성하고 시퀀싱을 위한 단일세포 라이브러리를 준비합니다.

3' RNA sequencing

시퀀싱

연구 규모에 맞춰 NGS 시스템에서 시퀀스를 구성합니다.

3' RNA analysis

분석

DRAGEN 및 Partek 소프트웨어를 사용하여 단일세포 데이터를 분석하고 시각화합니다.

사양

필수 제품

Illumina Single Cell 3' RNA Prep에는 세포 포획 및 라이브러리 준비 시약이 모두 포함되어 있습니다. 분석하려는 세포 수에 맞는 크기의 키트를 선택합니다. Illumina Single Cell 3' RNA Capture 및 Illumina Single Cell Library Prep 키트도 별도로 구매 가능합니다. 

 

8개 이상의 실행당 샘플 수로 멀티플렉싱하는 경우, Illumina 단일 세포 UDI(Unique Dual Index)를 사용하세요. 단일 핵을 입력하려면 Illumina 단일 세포 핵 분리 키트를 사용하세요. 맞춤형 RNA 태그 시퀀스 인리치먼트를 위해서는 Illumina 단일 세포 보충 인리치먼트 및증폭 키트를 사용하세요. 

 

신규 사용자는 필요한 부속 장비로 Illumina 단일 세포 준비 스타터 장비를 주문해야 합니다.

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응용법

신경과학을 위한 단일세포 RNA-Seq

신경세포 조직은 생물의 생애 전반에 걸쳐 지속적으로 재구성되고 리모델링되는 다양한 세포 유형의 복잡한 조직으로 구성되어 있습니다. scRNA-Seq는 전사 민감도를 통해 신경세포 집단의 진정한 다양성을 분류하는 귀중한 도구로, 다음에 대한 인사이트를 제공합니다.

  • 신경발달 및 신경퇴행성 질환
  • 이전에 알려지지 않았던 특정 신경세포 집단의 역할
  • 신경면역세포가 질병 및 발달에 미치는 영향

암 연구를 위한 단일세포 RNA-Seq

암은 복잡한 세포 집단이 관련된 역동적이고 다양한 질병입니다. 암을 유발하는 세포 유형과 돌연변이를 이해하려면 정교한 방법이 필요합니다. scRNA-Seq는 다음을 위한 중요한 도구입니다.

  • 종양 미세환경의 세부 이질성을 발견하세요
  • 새로운 암 생체표지자를 식별하세요
  • 면역요법 및 약제 내성의 작용 기전을 이해하세요

면역학을 위한 단일세포 RNA-Seq

면역 체계는 병원체를 식별, 표적화 및 제거하기 위해 함께 작용하는 다양한 세포 유형으로 된 복잡한 계층으로 구성되어 있습니다. scRNA-Seq를 통해 연구자들은 다음을 수행할 수 있습니다.

  • 면역 세포 집단의 발달 및 분화 경로를 이해하세요
  • 면역 세포 집단의 역할 및 기능을 평가하세요
  • 병원체에 대한 면역반응을 연구하세요

워크플로우 예시

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NextSeq 2000 시스템

Samples per run:  
P1: 1 T2 sample 
P2: 4 T2 samples or 1 T10 sample 
P3: 12 T2 samples, 3 T10 samples, or 1 T20 sample 
P4: 18 T2 samples, 5 T10 samples, or 2 T20 samples

2 × 100 bp

NovaSeq 6000 시스템

Samples per run (dual flow cell):  
SP: 18 T2 samples, 4 T10 samples, or 2 T20 samples 
S1: 36 T2 samples, 8 T10 samples, or 4 T20 samples 
S2: 82 T2 samples, 24 T10 samples, 10 T20 samples, or 2 T100 samples. 
S4: 200 T2 samples, 68 T10 samples, 24 T20 samples, or 4 T100 samples

2 × 100 bp

NovaSeq X Plus 시스템

Samples per run (dual flow cell):  
1.5B: 36 T2 samples, 8 T10 samples, or 4 T20 samples 
10B: 200 T2 samples, 68 T10 samples, 24 T20 samples, or 4 T100 samples 
25B: 520 T2 samples, 152 T10 samples, 64 T20 samples, or 12 T100 samples

2 × 100 bp

관련 응용법 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

선택 도구:

그림 자료

Single-cell mRNA capture and barcoding with PIPseq chemistry

PIPseq 화학 반응을 이용한 단일세포 mRNA 포획 및 바코드화

볼텍스 믹서를 사용하여 템플릿화된 유화액을 생성해 단일세포 mRNA를 포획하고 바코드화합니다. cDNA를 생성하고 시퀀싱을 위한 단일 세포 라이브러리를 준비합니다. 연구 규모에 맞춰 NGS 시스템에서 시퀀스를 구성합니다. DRAGEN 및 Partek 소프트웨어를 사용하여 scRNA-Seq 데이터를 분석합니다.

High-resolution scRNA-Seq at a scale of thousands of cells

수천 개의 세포 규모에서의 고해상도 scRNA-Seq

바코드 순위 도표(왼쪽)와 반야드 산점도(오른쪽)는 NIH3T3(마우스)와 HEK 293(인간) 세포주의 혼합 배양체를 효과적으로 분리하는 모습을 보여줍니다. Illumina 단일 세포 3ʹ RNA 준비 T2 키트를 사용하여 5% 미만의 다중항을 갖는 4,106개의 세포를 포획했습니다.

High-resolution scRNA-Seq at a scale of thousands of cells

수만 개의 세포 규모에서의 고해상도 scRNA-Seq

냉동 보존된 인간 말초혈액 단핵세포(PBMC)에 대한 단일세포 RNA-Seq. Illumina 단일 세포 3’ RNA 준비 T20 키트를 사용하여 포획한 31,613개 세포의 UMAP으로 다양한 면역 세포 집단을 파악할 수 있습니다.

High-resolution scRNA-Seq at a scale of thousands of cells

수십만 개의 세포 규모에서의 고해상도 scRNA-Seq

냉동 조직에서 추출한 생쥐 뇌 핵에 대한 단일세포 RNA-Seq. Illumina 단일 세포 3’ RNA 준비 T100 키트를 사용하여 포획한 155,000개의 핵에 대한 UMAP 분석을 통해 다양한 뇌 세포 집단을 파악할 수 있습니다.

리소스

축소판

The Illumina 3' Single Cell RNA Prep Workflow

Illumina 3' 단일 세포 RNA 준비 워크플로우가 어떻게 단일 세포 시퀀싱을 간소하게, 저렴하게, 미세유체공학 없이 수행하는지 알아보세요. 다양한 세포 유형에서 입증된 성능과 신뢰할 수 있는 고품질 데이터를 통해 단일 세포 분해능으로 디코딩하고 다음 혁신에 힘을 실어주는 것이 그 어느 때보다 쉬워졌습니다.

Complete prep workflow products (4)

Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T2 (8 samples, 2000 cells/sample)

20135689

Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T2 (8 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 2000 cells per sample.

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Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T10 (8 samples, 10,000 cells/sample)

20135691

Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T10 (8 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 10,000 cells per sample.

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Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T20 (4 samples, 20,000 cells/sample)

20135692

Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T20 (4 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 20,000 cells per sample.

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Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T100 (2 samples, 100,000 cells/sample)

20135693

Illumina Single Cell 3' RNA Prep, T100 (2 samples), includes Illumina Single Cell Library Prep plus reagents for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 100,000 cells per sample.

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Prep component products (5)

Illumina Single Cell Library Prep (8 reactions)

20132789

Illumina Single Cell Library Prep (8 reactions), used following Illumina Single Cell 3' RNA Capture.

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Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 samples, 2000 cells/sample)

20132790

Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T2 (8 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 2000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.

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Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 samples, 10,000 cells/sample)

20132791

Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T10 (8 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 10,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.

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Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4 samples, 20,000 cells/sample)

20132792

Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T20 (4 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 20,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.

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Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2 samples, 100,000 cells/sample)

20132793

Illumina Single Cell 3' RNA Capture, T100 (2 samples), for single-cell mRNA capture, barcoding, and cDNA synthesis of up to 100,000 cells per sample, used prior to Illumina Single Cell Library Prep.

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액세서리 제품 (4)

Illumina Single Cell Unique Dual Indexes (96 indexes, 96 samples)

20132788

Illumina Single Cell Unique Dual Indexes (96 indexes, 96 samples), optional accessory for use with the Illumina Single Cell Library Prep for high-plex pooling of libraries.

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Illumina Nuclei Isolation Kit (4 samples)

20132795

Illumina Nuclei Isolation Kit (4 samples), optional reagents for nuclei isolation, washing, and resuspension for input into Illumina Single Cell 3' RNA Prep.

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Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification Kit

20132794

Illumina Single Cell Supplemental Enrichment and Amplification (SEA) Kit, optional reagents for use with Illumina Single Cell 3' RNA Capture and Illumina Single Cell Library Prep for custom single-cell applications.

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Illumina Single Cell Prep Starter Equipment

20132796

Illumina Single Cell Prep Starter Equipment, one-time purchase accessory equipment required to prepare Illumina Single Cell 3' RNA kits and Illumina Single Cell Library Prep kits.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

Illumina Single Cell 3' RNA Prep은 사전 템플릿화된 인스턴트 분할(PIP)과 함께 PIPseq 기술을 사용합니다. PIP는 복잡한 세포 혼합물을 바코드가 붙은 템플릿 입자를 사용해 분할하여 단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA-Seq)과 같은 단일세포 응용법에서 손쉽게 처리할 수 있게 해 줍니다.

예, 신뢰할 수 있는 결과를 얻으려면 볼텍스 믹서와 건식 수조가 필요합니다. 볼텍스 믹서는 일관된 유화를 위해 설계되었습니다. 건식 수조는 정밀한 온도 프로필을 보장합니다. 일반적인 건식 수조의 경우 당사의 용해 프로토콜에 설명된 빠른 온도 변화를 허용하지 않습니다.

예, Fluent DSP/메탄올 고정을 사용하여 세포 또는 핵에 대한 프로토콜을 입증했습니다. 파라포름알데히드(PFA) 고정은 현재 호환되지 않습니다.

아니요, 현재 3’ mRNA 캡쳐만 가능합니다.

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NextSeq 1000/2000 Reagents

NextSeq 1000/2000 시스템용 시약은 사용하기 쉬운 카트리지와 유연한 시퀀싱 옵션을 위한 다중 플로우 셀 구성을 갖추었습니다.

NovaSeq X Series Reagent Kit

NovaSeq X 시리즈용 시약 키트에는 시약 카트리지, 버퍼 카트리지, 플로우 셀, Lyo 인서트(insert), 사전 로드 버퍼 및 라이브러리 튜브 스트립이 포함되어 있습니다.

NovaSeq 6000 Reagent Kits

즉시 사용 가능한 사전 충전 시약 카트리지와 플로우 셀로 구성된 NovaSeq 6000 System용 시약 키트입니다.

Illumina DRAGEN 2차 분석 주문

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