| 리드 길이(read length) | NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 | NextSeq 550 시스템 High-Output 키트 |
|---|---|---|
| 1 × 75bp | 해당 없음 | 25~30Gb |
| 2 × 75bp | 16.25~19.5Gb | 50~60Gb |
| 2 × 150bp | 32.5~39Gb | 100~120Gb |
NextSeq 550 Sequencing System 사양
고정밀 시퀀싱 및 어레이 스캐닝
조정 가능한 리드 길이 및 다중 출력 구성
리드 길이에 따른 플로우 셀 출력a
a. 지원되는 클러스터 밀도(필터 통과 클러스터 129~165k/mm²)에서 Illumina PhiX Control 라이브러리를 근거로 함. 실제 성능 파라미터는 샘플의 종류, 샘플 품질, 필터를 통과하는 클러스터에 따라 다양할 수 있음. 모든 NextSeq 550 시스템에는 페어드 엔드(paired-end) 리드 사용이 가능함.
주요 애플리케이션별 예상 샘플 처리량
| NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 | NextSeq 550 시스템 High-Output 키트 |
|---|---|
| 엑솜 3개 | 인간 전장 유전체 1개 |
| 인리치먼트 패널 12개 | 엑솜 12개 |
| 앰플리콘 패널 96개 | 전사체 16개 |
플로우 셀당 필터 통과 리드
| NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 | NextSeq 550 시스템 High-Output 키트 | |
|---|---|---|
| 싱글 리드 | ≤ 130M | ≤ 400M |
| 페어드 엔드 리드 | ≤ 260M | ≤ 800M |
Q-Scorea
| 리드 길이(read length) | NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 | NextSeq 550 시스템 High-Output 키트 |
|---|---|---|
| 1 × 75bp | 해당 없음 | Q30 이상의 염기 > 80% |
| 2 × 75bp | 2 × 75bp에서 Q30을 넘는 염기 > 80% | Q30 이상의 염기 > 80% |
| 2 × 150bp | 2 × 150bp에서 Q30을 넘는 염기 > 75% | Q30 이상의 염기 > 75% |
a. quality score는 베이스 콜링에서 오류가 발생할 확률을 예측한 것입니다. 실행 전체에 걸쳐서 > Q30인 염기의 백분율의 평균값을 계산함.
런 타임
| 리드 길이(read length) | NextSeq 550 시스템 Mid-Output 키트 | NextSeq 550 시스템 High-Output 키트 |
|---|---|---|
| 1 × 75bp | 해당 없음 | 11시간 |
| 2 × 75bp | 15시간 | 18시간 |
| 2 × 150bp | 26시간 | 29시간 |
어레이 스캐닝 매개변수
| 어레이 | 어레이당 스캔 시간 | 샘플당 스캔 시간 |
|---|---|---|
| Infinium MethylationEPIC BeadChip | 40분 | 5분 |
| Infinium CytoSNP-850K BeadChip | 40분 | 5분 |
기기 사양
-
발광 다이오드(LED)
파장
(레이저 다이오드 780nm, 클래스 IIIb)녹색 510~525nm, 적색 645~655nm
-
규격
넓이 × 깊이 × 높이53.3cm × 63.5cm × 58.4cm
(21.0in × 25.0in × 23.0in) -
무게
83kg(183lb)
-
포장된 중량
151.5kg(334lb)