인포매틱스 인프라 및 파이프라인 설정
적합한 인프라가 마련되어 있을 때 발견 가능
바이오인포매틱스와 데이터 분석 파이프라인을 간소화하여 중요한 일에 집중할 수 있습니다.
바이오인포매틱스 인프라 및 파이프라인 고려 사항
차세대 큰 혁신이 유전체학과는 관련이 없지만 유전체학 데이터를 이해하기 위해 사용하는 기본 바이오인포매틱스 파이프라인과는 관련이 있다면 어떨까요? Illumina는 시퀀서부터 사용하는 분석 도구에 이르기까지 사용자가 설정한 바이오인포매틱스 인프라가 성공에 중요한 역할을 한다고 믿습니다.
바이오인포매틱스 및 유전체학 데이터 분석의 학제간 특성은 협업을 촉진하고 현재와 미래에 유전체 데이터를 가장 효율적이고 안정적으로 처리하고 분석할 수 있는 방법을 반영하는 바이오인포매틱스 파이프라인을 요구합니다. 새로운 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 파이프라인을 설정하거나 기존 파이프라인에 단순히 구성요소를 추가하는 것은 신중한 사고와 계획이 필요합니다.
인포매틱스 도구를 구축하거나 구매하시나요?
검사실은 종종 평판이 좋은 공급업체로부터 바이오인포매틱스 도구를 구매하는 데 대한 고려 사항을 사내 맞춤화의 이점과 비교합니다. DIY 도구 개발 비용은 종종 도구 구매 비용을 초과하며, 사용자를 염두에 두고 개발된 상용 소프트웨어는 직원이 사용하기 더 쉬운 경향이 있습니다.
많은 검사실은 대부분의 요구 사항을 충족하고, 커스터마이징을 위한 유연성을 가지며, 잘 지원되는 도구를 찾을 수 있다면 구매가 더 나은 리소스 사용이라는 데 동의합니다. 최근 LIMS를 구매하기로 결정한 여러 검사실의 경험에 대해 자세히 알아보세요.
기사 읽기: LIMS를 구매해야 하는 네 가지 주요 이유
검사실 자동화의 이점
자동화 도입은 일관성 및 재현성 보장과 같이 고처리량 유전체 검사실이 직면한 몇 가지 일반적인 문제를 해결합니다. 검사실 정보 관리 시스템(LIMS)은 다음을 제공합니다.
- 샘플 추적 및 표준화된 보고
- 자동화된 라이브러리 준비
- 기기 및 액체 처리 로봇을 워크플로우에 통합
- 샘플, 검사 및 결과의 엔드투엔드 관리
인포매틱스 워크플로우 운영
시퀀싱 시스템 통합, 확장 가능한 처리량 및 직관적인 인터페이스를 통해 바이오인포매틱스 운영을 혁신하여 데이터 분석 워크플로우를 선택하고 맞춤화해 보세요. Illumina Connected Analytics를 사용하면 즉시 사용 가능한 분석 파이프라인 또는 맞춤형 파이프라인을 사용하여 데이터를 자동으로 분석할 수 있습니다. DRAGEN 2차 분석은 NGS 데이터를 처리하고 발견을 극대화하기 위한 바이오인포매틱스 파이프라인 제품군을 제공합니다. 다음 사항에 대해 더 알아보세요.
Illumina Connected AnalyticsDRAGEN 2차 분석
바이오인포매틱스 파이프라인 업그레이드
Jackson Laboratory의 데이터 분석 파이프라인 업그레이드가 검사실의 연구를 가속화하여 크고 복잡한 유전체 및 엑솜 데이터 세트를 신속하게 이해하는 능력을 어떻게 개선했는지 알아보세요.
기사 읽어 보기시퀀싱 실험실 자동화
자동화된 라이브러리 준비부터 고처리량 시퀀싱 기기, 대용량 데이터 분석 및 관리, 멀티플렉싱 등에 이르기까지 생산 규모 시퀀싱 실험실의 요구 사항을 충족하도록 설계된 솔루션을 살펴보세요. 고용량 시퀀싱 검사실을 설정한 과학자들의 의견을 들어 보세요. 다음 사항에 대해 더 알아보세요.
고처리량 시퀀싱라이브러리 준비 자동화
마이크로어레이 검사실 자동화
마이크로어레이 기반 유전형 분석 및 메틸레이션 연구를 수행하는 실험실을 위한 액체 처리 로봇, 어레이 로더 및 기타 자동화 패키지를 제공합니다. 이러한 패키지는 assay 워크플로우를 간소화하고 샘플 준비 및 어레이 스캐닝을 통합하는 데 도움이 됩니다. 다음 사항에 대해 더 알아보세요.
고처리량 유전형 분석어레이 자동화 패키지
유전체학 실험실에 맞춤화된 LIMS
Clarity LIMS는 검사실 정보 관리 시스템입니다. 유전체학 검사실을 위해 특별히 설계되고 NGS에 최적화된 Clarity LIMS(이전 명칭: BaseSpace Clarity LIMS)는 기기와 통합되고 검사실이 샘플을 추적 및 관리하는 데 도움이 되며 검사실의 전체 운영을 간소화합니다. 복잡한 자체 개발 시스템과 달리, Clarity LIMS는 최종 사용자를 염두에 두고 설계되어 검사실 직원의 광범위한 채택을 장려합니다.
제품 보기데이터 공유 및 협업
출판을 위한 데이터 준비
시퀀싱 데이터는 전통적으로 비바이오인포매틱스 전문가가 이해하기가 어려웠습니다. Illumina 솔루션은 생물학자에게 맞춤화된 직관적인 보고서 형식을 제공하며, 출판 준비 형식으로 제공됩니다.
연구자들은 버튼 클릭 한 번으로 워크플로우를 시작하고 협업자 또는 공개 데이터베이스와 쉽게 공유할 수 있는 사용자 친화적인 보고서를 출력할 수 있습니다.
협업
대규모 데이터 세트를 공유하면 arcane FTP 프로토콜, 하드 드라이브 제한 및 호환되지 않는 장치 인터페이스와 관련된 장애물이 발생할 수 있습니다.
Illumina는 Illumina Connected Analytics 및 BaseSpace Sequence Hub와 같은 솔루션을 제공하여 신뢰할 수 있는 협업자와 데이터를 그 어느 때보다 간단하게 공유할 수 있습니다. 버튼 클릭 한 번으로 개별 시퀀싱 런 또는 전체 프로젝트를 공유할 수 있습니다. 공유는 즉각적으로 이루어지며 어디서나 액세스할 수 있습니다.
주요 솔루션
Illumina Connected Analytics
확장성이 뛰어난 데이터 관리, 분석, 탐색을 위한 모듈식 보안 데이터 플랫폼입니다. 공유된 데이터 세트를 통해 빠르게 인사이트를 생성해 보세요.
제품 보기
BaseSpace Sequence Hub
NGS 데이터 관리 및 분석을 위한 Illumina 클라우드 기반 유전체학 컴퓨팅 환경. 간소화된 데이터 공유를 통해 협업과 혁신을 촉진합니다.
제품 보기
Clarity LIMS
검사실에서 샘플을 추적하고 워크플로우를 최적화하는 데 도움이 되는 LIMS. 검사실 관리자는 모바일 기기에서 실시간 데이터에 액세스하여 이해관계자 또는 협업자를 업데이트할 수 있습니다.
제품 보기샘플 관리
손쉬운 샘플 관리 및 실험 설정
고처리량 유전체학 실험실은 샘플을 관리/추적하고 맞춤형 assay를 설계하는 데 어려움을 겪고 있습니다. 당사는 시퀀싱 또는 마이크로어레이 프로젝트를 시작하고 관리하는 데 도움이 되는 사용자 친화적인 도구를 제공합니다.
인포매틱스 도구는 생물학적 샘플 정보를 가져오고, 라이브러리를 설계 및 풀링하고, 시퀀싱 런을 준비하고, 맞춤형 표적 시퀀싱 패널을 생성하고, 샘플 시트를 생성하는 데 도움이 됩니다.
고처리량 검사실을 위한 샘플 관리
최신 유전체학 연구는 전례 없는 양의 데이터를 생성합니다. 데이터 볼륨과 샘플 처리량 증가에 직면하여 검사실 운영을 간소화하고 비용을 절감하고자 하는 검사실은 접근 방식을 현대화해야 합니다.
Laboratory Information Management System(LIMS)은 샘플 및 관련 데이터를 효과적으로 관리할 수 있는 소프트웨어입니다. 이 시스템을 사용하면 검사실에서 워크플로우를 자동화하고 기기와 통합하여 검사실 효율성을 개선할 수 있습니다.
LIMS에 대해 더 알아보기간단한 시퀀싱 실험 설정
Illumina 시퀀싱 시스템용으로 설계된 소프트웨어를 사용하면 시퀀싱 실험을 쉽게 설정하고 실행할 수 있습니다. 사용할 특정 소프트웨어 도구는 사용되는 Illumina 시퀀서에 따라 다릅니다.
표준 및 QC의 중요성
빠르게 발전하는 NGS 기술을 통해 생성되는 대량의 데이터를 품질 관리(QC)에서 확인하는 것이 중요합니다. Illumina는 시퀀싱 실험에서 컨트롤 및 표준을 사용하기 위한 지침을 제공하여 연구자가 데이터 및 실험 결과의 품질에 대한 확신을 유지할 수 있도록 지원합니다.
- 고품질 시퀀싱 데이터가 어떻게 보여야 하는지 알아보세요. 데이터 예시 보기
- 시퀀싱 품질 점수에 대해 자세히 알아보세요. 품질 점수 이해
- Illumina 시퀀싱 실험에 사용되는 표준 대조 DNA인 PhiX에 대해 자세히 알아보세요. PhiX 컨트롤 보기
더 알아보기
유전체학에서의 AI
AI가 어떻게 서열 변이 해석을 가속화하고 변이 검출 정확도를 향상시키며 연구 워크플로우 전반에서 멀티오믹스 발견을 가능하게 하는지 알아보세요.
시퀀싱 데이터 분석
사용이 용이한 도구는 시퀀싱 데이터 분석 프로세스를 원활하게 하여 연구에 더 많은 시간을 할애하고 워크플로우 구성에 소요되는 시간을 줄일 수 있습니다.
NGS용 LIMS 선택
NGS용 LIMS를 선택할 때 어떤 기능을 찾아야 하는지 알아보세요. 기기 통합 및 NGS별 기능이 구현을 어떻게 지원하는지 알아보세요.