Infinium Mouse Methylation BeadChip

다양한 뮤린 균주의 고해상도 후성유전학 분석을 위해 메틸롬 전반에서 > 285k 표지자를 특징으로 합니다.

어레이당 샘플 12개

샘플 수

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit는 전문가가 선택한 포괄적인 커버리지(coverage)와 높은 샘플 처리량의 고유한 조합을 제공합니다.

  • 전장 유전체 DNA 메틸레이션 연구 지원 

  • 연구 검사실에서 사용되는 거의 모든 쥐 균주(strain)의 후성유전학적 분석 가능

  • 단일 뉴클레오티드 분해능에서 샘플당 285,000개의 메틸레이션 부위 조사

  • 후성유전학 연구를 위한 고성능 Infinium HD Assay를 사용하여 PCR이 없는 프로토콜 제공

유전자 영역 전반에 걸친 포괄적인 커버리지

Infinium Mouse Methylation BeadChip은 CpG 섬(island), 번역 시작 부위, 인핸서(enhancer), 각인된 유전자좌 및 기타 영역에 대한 균형 잡힌 커버리지를 제공합니다. Infinium HD chemistry를 통해 종종 메틸화된 DNA 캡처 방법과 관련된 편향 제한과 무관하게 콘텐츠를 선택할 수 있습니다.

높은 Assay 재현성

Infinium Mouse Methylation BeadChip은 기술적 복제에 대해 >98%의 재현성을 달성하며 전장 유전체 바이설파이트 시퀀싱 데이터와 밀접한 상관관계를 보여줍니다.

광범위한 애플리케이션

전후성유전체 연관성 연구, 이종이식 실험, 전임상 연구 등을 가능하게 합니다. 

사양

필수 제품

필요에 맞는 샘플 처리량을 제공하는 Infinium Mouse Methylation BeadChip 키트 구성을 선택하세요.

/

애플리케이션

Infinium Mouse Methylation BeadChip은 전후성유전체 연관성 연구, 전임상 연구, 이종이식 연구 등을 포함한 다양한 영역의 쥐 후성유전학적 분석 연구를 지원합니다.

워크플로우 예시

1
콘텐츠 선정

Infinium Mouse Methylation BeadChip

2
처리 및 스캔
3

관련 애플리케이션 및 방법

주요 Application Notes

그림 자료

broad coverage using infinium

Infinium I 및 Infinium II assay 설계를 사용한 광범위한 커버리지

어레이는 Infinium I 및 Infinium II assay를 모두 사용합니다. Infinium I assay 설계는 CpG 유전자좌당 2개의 비드 유형을 사용하며, 메틸화 및 비메틸화 상태에 대해 각각 1개씩 사용합니다. Infinium II 설계는 1가지 비드 유형을 사용하며, 혼성화 후 단일 염기 연장 단계에서 메틸화 상태를 결정합니다.

data analysis with GenomeStudio

Illumina GenomeStudio 소프트웨어를 사용한 통합 데이터 분석

GenomeStudio 소프트웨어는 모든 플랫폼에서 DNA 메틸레이션 분석을 지원합니다. 데이터는 히트맵과 같은 직관적인 그래픽으로 표시됩니다.

비교하기

Infinium Mouse Methylation BeadChip Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit
Assay 종류 Infinium HD Methylation Infinium HD Methylation
자동화 기능 자동 어레이 로더 자동 어레이 로더
사용량 DNA 250 ng DNA 250 ng
기기 iScan System NextSeq 550 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), iScan System
방법 메틸레이션 어레이 메틸레이션 어레이
핵산 종류 DNA DNA
Number of markers Fixed markers: 285k ~ 930k
샘플 수 어레이당 샘플 12개 어레이당 8개 샘플
샘플의 종류 세부 사항 신선/냉동 조직과 함께 사용할 수 있습니다. DAC를 포함한 외인성 화학물질에 의해 유도된 DNA 메틸화의 변화를 분석한다.
특수 샘플의 종류 혈액 혈액, FFPE 조직
종 카테고리 마우스 인간
기술 Microarray Microarray
변이 클래스 차등 메틸화된 사이토신 차등 메틸화된 사이토신

선택 도구:

자원

축소판

Infinium Mouse Methylation BeadChip에 대해 알아야 할 10가지 사항

Wanding Zhou 박사가 생쥐 연구자를 위해 이 강력한 도구의 개요를 제시합니다.

Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (24 samples)

20041558

2개의 12-샘플 BeadChip과 24개의 DNA 샘플을 증폭, 조각화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.

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Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (48 samples)

20041559

4개의 12-샘플 BeadChip 및 48개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.

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Infinium Mouse Methylation BeadChip Kit (96 samples)

20041560

8개의 12-샘플 BeadChip과 96개의 DNA 샘플을 증폭, 조각화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.

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Infinium Mouse Methylation275k-12+ v1.0 Kit (24 Samples)

20041561

2개의 12-샘플 BeadChip과 24개의 DNA 샘플을 증폭, 조각화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. DesignStudio를 사용하여 추가 3K – 10K 마커로 콘텐츠를 사용자 지정하거나 컨소시엄 부스터로 사용할 수 있는 추가 콘텐츠 목록에서 선택합니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.

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Infinium Mouse Methylation 275k-12+ v1.0 Kit (48 Samples)

20041562

4개의 12-샘플 BeadChip 및 48개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. DesignStudio를 사용하여 추가 3K – 10K 마커로 콘텐츠를 사용자 지정하거나 컨소시엄 부스터로 사용할 수 있는 추가 콘텐츠 목록에서 선택합니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.

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Infinium Mouse Methylation275k-12+ v1.0 Kit (96 Samples)

20041563

8개의 12-샘플 BeadChip 및 96개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. DesignStudio를 사용하여 추가 3K – 10K 마커로 콘텐츠를 사용자 지정하거나 컨소시엄 부스터로 사용할 수 있는 추가 콘텐츠 목록에서 선택합니다. 입력에 ≥ 250 ng DNA 필요. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

표준 Infinium 메틸레이션 프로토콜을 사용하면 샘플당 최소 250 ng의 사용량에서 고품질의 손상되지 않은 유전체 DNA를 가정할 때 어레이(array)에서 96% 이상의 부위를 GenomeStudio 메틸레이션 모듈 소프트웨어로 검출해야 합니다.

GenomeStudio 메틸레이션 모듈은 베타 값을 추출하고 Infinium Mouse Methylation BeadChip 데이터에 대한 클러스터링을 제공합니다. GenomeStudio는 현재 Mouse Methylation BeadChip을 이용한 표준화 제어를 지원하지 않습니다. 또한 BeadArray Controls Reporter 소프트웨어 도구는 현재 지원되지 않습니다.

Bioconductor에는 SeSAMe와 같이 향상된 표준화 및 시각화 옵션을 제공하는 많은 프리웨어 애플리케이션이 있습니다. Illumina는 이러한 프리웨어 솔루션에 대한 지원을 직접 제공하지 않습니다.

BeadChip에는 SNP가 포함되어 있으므로 검사자가 추가 품질 관리 수준으로 샘플의 DNA 지문을 생성할 수 있습니다. 구체적으로 Mouse Methylation BeadChip의 경우, 분석 중인 DNA의 균주 기원을 식별하는 데 도움이 되는 SNP 프로브가 포함됩니다. 자세한 내용은 Infinium HD Methylation Assay 참조 가이드를 참조하세요. BeadChip의 SNP assay는 assay 가이드에 언급되어 있지 않으며 GenomeStudio 메틸레이션 모듈에 간략하게만 설명되어 있습니다.

Illumina는 5-hMc용 어레이를 검증하지 않았습니다. 그러나 출판물에서는 5-hMc 분석을 위해 Infinium HumanMethylation450K 및 MethylationEPIC BeadChip을 사용했으며, 이 프로토콜이 Infinium Mouse Methylation BeadChip에 적용될 가능성이 있습니다.

자세한 내용은 다음을 참조하세요. Nazor KL, Boland MJ, Bibikova M, et al. Application of a low cost array-based technique—TAB-Array—for quantifying and mapping both 5mC and 5hmC at single base resolution in human pluripotent stem cells. Genomics. 2014;104(5):358-367. doi: 10.1016/j.ygeno.2014.08.014

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.

Infinium MethylationEPIC v2.0 Kit

CpG 섬, 유전자, 인핸서(enhancer) 등 폭넓은 커버리지를 제공하는 강력한 메틸레이션 프로파일링 마이크로어레이(microarray)입니다. 유전 및 희귀 질환 연구, 암 연구 및 분류에 이상적입니다.

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