Illumina Rapid RNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
cDNA 합성과 어댑터 태깅을 단일 단계로 결합한 RNA 엑솜 분석을 위한 빠르고 간단한 라이브러리 프렙 워크플로우.
cDNA 합성과 어댑터 태깅을 단일 단계로 결합한 코딩 전사체 분석을 위한 빠르고 간단한 mRNA 라이브러리 프렙 워크플로우
Assay 시간
수작업 시간
사용량
Illumina Rapid mRNA Prep은 Illumina 포트폴리오에서 가장 빠르고 쉬운 mRNA-Seq 라이브러리 프렙 솔루션을 제공합니다. 간소화된 30분 단일 튜브 반응은 cDNA 합성과 온비드 태그멘테이션을 결합합니다. 신속한 워크플로우는 낮은 RNA 샘플 투입(1~1,000 ng)을 지원하고 고정확도 비가닥 유전자 발현 데이터를 제공합니다.
| Assay time | 3 hr |
|---|---|
| 자동화 기능 | 리퀴드 핸들링 로봇 |
| Description | A fast and easy workflow for coding transcriptome analysis |
| 수작업 시간 | < 1.5시간 |
| Input quantity | 1–1000 ng RNA |
| 기기 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 |
| 방법 | mRNA 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | FFPE 호환 불가, 사용량이 적은 샘플 |
| 종 카테고리 | 포유류, 마우스, 인간, 래트 |
| 가닥 특이성 | 비가닥(Non-stranded) |
| 기술 | 시퀀싱 |
| 변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 새로운 전사물, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV) |
완전한 Illumina Rapid mRNA Prep 워크플로우에는 Rapid RNA 라이브러리 프렙 시약, mRNA 캡처 키트 및 인덱스(각각 별도 판매)가 필요합니다.
Illumina Rapid mRNA Prep을 사용하면 1.5시간 미만의 수작업 시간으로 3시간 내에 코딩 전사체 분석을 위한 바로 시퀀싱 가능한 mRNA-Seq 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
Illumina Rapid mRNA Prep
| 기기 | 권장 샘플 수 | 리드 길이 |
|---|---|---|
| MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 | 샘플당 10~25M 클러스터: 25M: 1~2, 50M: 1~5, 100M: 1~10 |
유전자 발현의 경우 1 × 100 bp 또는 2 × 50 bp, 변이 검출의 경우 최대 2 × 100 bp |
| NextSeq 1000 시스템, NextSeq 2000 시스템 | 샘플당 10M 클러스터: P1: 10, P2: 40, P3: 120, P4: 180 샘플당 25M 클러스터: P1: 4, P2: 16, P3: 48, P4: 72 |
유전자 발현의 경우 1 × 100 bp 또는 2 × 50 bp, 변이 검출의 경우 최대 2 × 100 bp |
| NovaSeq X 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 | 샘플당 10M 클러스터: 1.5B: 150(75/레인), 5B: 500(62/레인), 10B: 1,000(125/레인), 25B: 2,500(312/레인) 샘플당 25M 클러스터: 1.5B: 60(30/레인), 5B: 200(25/레인), 10B: 400(50/레인), 25B: 1,000(125/레인) |
유전자 발현의 경우 1 × 100 bp 또는 2 × 50 bp, 변이 검출의 경우 최대 2 × 100 bp |
| Illumina Rapid mRNA Prep | ||
|---|---|---|
| Assay time | 3 hr | |
| 자동화 기능 | 리퀴드 핸들링 로봇 | |
| Description | A fast and easy workflow for coding transcriptome analysis | |
| 수작업 시간 | < 1.5시간 | |
| Input quantity | 1–1000 ng RNA | |
| 기기 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 | |
| 방법 | mRNA 시퀀싱 | |
| 핵산 종류 | RNA | |
| 특수 샘플의 종류 | FFPE 호환 불가, 사용량이 적은 샘플 | |
| 종 카테고리 | 포유류, 마우스, 인간, 래트 | |
| 가닥 특이성 | 비가닥(Non-stranded) | |
| 기술 | 시퀀싱 | |
| 변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 새로운 전사물, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV) |
Illumina Rapid mRNA Prep을 통한 높은 라이브러리 복잡성
1, 10, 25 및 100 ng의 범용 인간 참조(UHR) RNA의 Illumina Rapid mRNA Prep 데이터는 1M~32M 클러스터(2M~64M 페어드 엔드 리드)로 다운샘플링된 시퀀싱 뎁스 전반에서 검출된 고유한 유전자(5개 이상의 매핑된 리드)의 수를 보여줍니다.
Illumina Rapid mRNA Prep을 통한 높은 매핑 효율성
Illumina Rapid mRNA Prep 데이터는 20M 클러스터(40M 페어드 엔드 리드)로 다운샘플링된 1, 10, 25 및 100 ng의 범용 인간 참조(UHR) RNA 투입량 전반에서 매핑된 리드의 비율이 높음을 보여줍니다.
Illumina Rapid mRNA Prep을 통한 전사물 전반에 걸친 균일한 커버리지
Illumina Rapid mRNA Prep 데이터는 20M 클러스터(40M 페어드 엔드 리드)로 다운샘플링된 1, 10, 25 및 100 ng의 범용 인간 참조(UHR) RNA 투입량 전반에서 전사물의 길이를 따라 분포된 일관된 표준화 커버리지를 보여줍니다.
고/저 RNA 투입 전반에서 높은 재현성
Illumina Rapid mRNA Prep은 1 ng와 100 ng 투입량 사이에서 표준화된 유전자 카운트의 높은 상관관계를 보여줍니다(R2 = 0.99). DRAGEN RNA v4.4에서 생성된 백만 개당 전사물(TPM)입니다.
온비드 태그멘테이션 라이브러리 프렙 chemistry는 DNA 추출, 절편화, 라이브러리 프렙 및 라이브러리 표준화 단계를 통합합니다.
Illumina Rapid RNA Prep, (S) Tagmentation (96 samples)
20158824
Includes reagents for preparing 96 samples of Rapid RNA libraries with Illumina Purification Beads. UD Indexes sold separately. Compatible with mRNA Capture kit for complete mRNA library prep workflow or RiboZero Plus kits for complete Total RNA library prep workflow or RNA Fast Hyb Enrichment kits for complete RNA Enrichment workflow, each sold separately.
List Price:
Discounts:
Illumina Rapid RNA Prep, (S) Tagmentation (16 samples)
20158823
Includes reagents for preparing 16 samples of Rapid RNA libraries with Illumina Purification Beads. UD Indexes sold separately. Compatible with mRNA Capture kit for Rapid mRNA library prep workflow or RiboZero Plus kits for Rapid Total RNA library prep workflow or Fast Hyb Enrichment kits for Rapid RNA Enrichment library prep workflow, each sold separately.
List Price:
Discounts:
Illumina mRNA Capture Kit (96 samples)
20158830
Includes reagents for capture and purification of polyadenylated mRNA for 96 samples. Compatible with Illumina Rapid RNA Prep, sold separately. for a complete Rapid mRNA library prep workflow.
List Price:
Discounts:
Illumina mRNA Capture Kit (16 samples)
20158829
Includes reagents for capture and purification of polyadenylated mRNA for 16 samples. Compatible with Illumina Rapid RNA Prep, sold separately. for a complete Rapid mRNA library prep workflow.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개의 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10bp 인덱스가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Beads 30 ml
20119944
Illumina Purification Beads 30 ml
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
라이브러리 클린업 및 크기 선발을 위한 비드 100 ml 컨테이너 1개가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약, 프로브 패널 및 인덱스를 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
라이브러리 클린업 및 크기 선발을 위한 비드 100 ml 컨테이너 4개가 포함됩니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약, 프로브 패널 및 인덱스를 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
표시 /
제품
수량
단가
제품
카탈로그 ID
수량
단가
1단계: Illumina mRNA Capture Kit로 폴리(A) RNA 캡처
2단계: Illumina Rapid RNA Prep이 단일 튜브에서 30분 반응으로 cDNA 합성과 온비드 태그멘테이션을 결합
3단계: PCR이 인덱스 어댑터를 추가
4단계: 포함된 Illumina Purification Beads로 클린업
Illumina Rapid RNA Prep은 96개 샘플 및 16개 샘플 구성으로 제공됩니다. Illumina mRNA Capture는 96개 샘플 또는 16개 샘플 구성으로도 제공됩니다.
두 방법 모두 올리고(dT) 자성 비드를 사용한 폴리(A) mRNA 캡처로 시작합니다. 그런 다음 Illumina Rapid mRNA Prep은 태그멘테이션(총 워크플로우 시간 3시간 및 수작업 시간 < 1.5시간)을 사용하여 비가닥 라이브러리를 생성하는 반면, Illumina Stranded mRNA Prep은 라이게이션(총 워크플로우 시간 6.5시간 및 수작업 시간 < 3시간)을 사용하여 가닥 라이브러리를 생성합니다.
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