면역유전체학 연구
면역 관련 유전자 변이
유전체학 분석 기술은 면역 세포 기능과 신호전달을 설명함으로써 면역학 연구를 발전시킬 수 있습니다. 복잡한 자가면역 질환(루푸스, 류마티스 관절염, 다발성 경화증 등)과 기타 면역학적 장애의 원인은 아직 잘 알려져 있지 않습니다.
Illumina의 면역유전체학 솔루션은 면역학 연구자들이 잠재적 자가면역 질환 기전, 면역 레퍼토리, 면역 관련 유전자 변이의 기능적 결과에 대한 인사이트를 얻는 데 도움이 될 수 있습니다. 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)은 연구 커뮤니티가 높은 해상도에서 면역 반응을 매핑하는 데 필요한 품질, 처리량, 리드 길이를 제공합니다. 마이크로어레이(microarray)는 인간 면역계의 유전자 변이에 대한 대규모 연구를 위해 고밀도 콘텐츠를 제공합니다.
면역 레퍼토리 분석에서의 NGS
차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)은 겉으로 보기에는 무한한 표적 배열을 인식할 수 있는 면역 세포의 방대한 레퍼토리를 매핑하는 고성능 면역유전체학 연구 도구인 것으로 입증되고 있습니다.1 레퍼토리 시퀀싱을 통해 연구자들은 자가면역 질환, 혈액암, 기타 질병에 취약성이 있는 개인에서 발견되는 고유한 수용체 변이를 식별할 수 있었습니다.2
자가면역의 미스터리 조사
면역학 교수인 Carola Vinuesa 박사는 NGS 연구가 항체 반응과 자가면역을 조절하는 세포와 분자 간의 복잡한 상호작용을 어떻게 규명할 수 있는지 논의합니다.
면역학 연구자들의 의견 듣기
RNA-Seq을 사용한 면역유전체학 분석의 교훈
다양한 세포 유형이 항종양 면역반응에 관여하여 복잡한 종양 미세환경을 형성합니다. 인스브루크 의과대학의 Zlatko Trajanoski 교수는 RNA-Seq이 종양 미세환경을 해독하는 데 어떻게 도움이 될 수 있는지 설명합니다.
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주요 면역학 연구 제품
AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta Panel: T세포 수용체(T-cell receptor, TCR) 베타 사슬 재배열을 시퀀싱하여 T세포 다양성 및 클론 확장 조사.
AmpliSeq for Illumina TCR beta-SR (Short Read) Panel: TCR 베타 사슬 재배열을 시퀀싱하여 종양 샘플에서 T세포 다양성 및 클론 확장을 측정하기 위한 FFPE 적합 패널입니다.
AmpliSeq for Illumina Immune Response Panel: 종양-면역 체계 상호작용에 관여하는 395개의 유전자를 조사하는 표적 RNA 발현 패널입니다.
NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템: 이러한 벤치탑 시퀀싱 시스템은 면역 레퍼토리를 자세히 살펴보는 데 필요한 판독 자료를 제공하고 광범위한 애플리케이션에서의 유연성을 제공합니다.
Partek Flow 소프트웨어: 이 소프트웨어는 사용이 용이하며 V(D)J 시퀀싱 데이터를 포함한 멀티오믹스 데이터의 분석 및 시각화를 지원합니다.
Infinium Immunoarray: 단일 마이크로어레이(microarray)에서 자가면역 질환 및 면역 기능 관련 유전자 변이를 평가해 보세요.
Infinium 글로벌 스크리닝-24 키트: 확장 가능하고 비용 효과적인 집단 유전학 연구를 수행하고 HLA 및 KIR 유전자 변이와 같은 면역학 관련 변이를 연구합니다.
단일세포 오믹스 및 세포 면역학 연구
Illumina Genomics Podcast의 에피소드 45에서 Shalin Naik 박사는 면역계를 이해하기 위한 단일세포 유전체학의 사용에 대해 논의합니다.
NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템의 전장 IR-Seq
NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템이 전장 V(D)J 시퀀싱을 포함한 복잡한 면역 레퍼토리 시퀀싱 연구를 어떻게 가능하게 하는지 알아보세요.
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NGS는 연구자들이 종양이 면역반응을 회피할 수 있는 돌연변이와 T세포 매개 면역을 강화할 수 있는 신생항원을 식별하는 데 도움이 될 수 있습니다.
복합 질환 연구
Illumina의 시퀀싱 기술은 분자 수준에서 자가면역 질환 및 류마티스 질환, 죽상동맥경화증, 정신 질환 및 기타 질환의 이해를 돕는 새로운 연구 방법을 제시하고 있습니다.
면역 반응 프로파일링
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멀티오믹스
유전체학, 전사체학, 후성유전학, 단백질체학의 데이터를 결합함으로써, 연구자들은 발달, 세포 반응 및 질병의 원인이 되는 분자 변화를 보다 포괄적으로 이해할 수 있습니다.
추가 리소스
참고 문헌(References)
- Woodsworth D.J., Castellarin M., and Holt R.A. Sequence analysis of T-cell repertoires in health and disease. Genome Med. 2013; 5:98.
- Robins H. Immunosequencing: applications of immune repertoire deep sequencing. Curr Opin Immunol. 2013; 25: 646-652.