TruSight Tumor 15

간단하고 빠른 워크플로우로 고형암에서 일반적으로 돌연변이되는 15개 유전자를 평가하는 데 초점을 맞춘 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 패널입니다.

7시간

Assay 시간

3.5시간

수작업 시간

20 ng FFPE DNA 

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

TruSight Tumor 15는 고형암에서 일반적으로 발생하는 15개 돌연변이 유전자를 평가하는 NGS assay입니다. 

  • 단일 assay에서 15개의 유전자에 대한 정확하고 경제적이며 신속한 평가 1 

  • FFPE 조직에서 20 ng DNA를 사용하여 5% 대립유전자 빈도로 체세포 변이체 검출1

  • 최소한의 바이오인포매틱스 리소스를 필요로 하는 해석하기 쉬운 보고서 

  • 기존 검사실 관행에 완벽하게 통합 

관련 유전자 콘텐츠

콘텐츠는 업계 내 조직에서 인용되고 독립 컨소시엄의 출판물 및 후기 단계의 제약 연구에 의해 알려진 유전자 및 유전자 영역을 포함하도록 신중하게 선택됩니다. 콘텐츠에는 단일 염기서열 변이(single nucleotide variants, SNV) 및 고형암에 관여하는 것으로 입증된 삽입/결실이 포함됩니다.

포괄적인 워크플로우

TruSight Tumor 15는 단일 반복 유전자 검사를 중합효소 연쇄 반응(polymerase chain reaction, PCR)으로 대체하는 간단하고 신속한 워크플로우에서 15개의 유전자를 평가합니다. 기기 내 보고 소프트웨어 또는 TruSight Tumor 15 BaseSpace Sequence Hub 앱으로 데이터를 분석해 보세요.  

가속 종양 프로파일링

3.5시간의 수작업 시간으로 최대 36시간 내에 DNA에서 데이터를 얻어 보세요. 여러 종양 유형에서 샘플 성공률을 극대화하여 제한된 샘플과 리소스를 보존해 보세요. 

사양

필수 제품

TruSight Tumor 15 MiSeq 또는 MiniSeq Kit를 구매하거나 TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)를 구입해야 합니다. 모든 제품은 24개의 샘플에 사용하기에 충분합니다. TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)만 구입하기로 선택하는 경우, 해당 시스템에 대한 시퀀싱 시약도 별도로 구입해야 합니다. 

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit에는 MiSeq 소프트웨어 v2.6 이상 및 Illumina Annotation Engine이 필요합니다. 파일 다운로드

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애플리케이션

TruSight Tumor 15는 단일 assay에서 고형암과 흔히 연관된 15개 유전자의 체세포 변이체를 평가하는 포괄적 워크플로우 솔루션으로, 검사실에서 NGS의 역량을 사용하여 종양 형성 역할을 할 가능성이 가장 높은 유전자에 초점을 맞추고 FFPE DNA의 저주파 변이를 자신있게 분석할 수 있도록 합니다. 

워크플로우 예시

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
MiniSeq 시스템

Samples per run: mid output: 2-3, high output: 8 (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 150 bp(최대 권장)

MiSeq 시스템

8 samples per run with v3 reagents (based on 93.5% of the bases covered at 500x minimum)

2 × 151 bp(최대 권장)

관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

TruSight Tumor 15 TruSight Tumor 170
Assay 시간 7시간 약 2일
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
암 종류 전체 고형암, 고형암 고형암
콘텐츠 사양 고형 종양과 관련된 15개의 유전자로부터 250개의 앰플리콘을 증폭 프로브는 170개의 유전자의 전체 코딩 시퀀스를 강화합니다. 단일 염기서열 변이, 151개 유전자의 작은 삽입 및 결실, 59개 유전자의 증폭 및 55개 유전자의 유전자 융합과 스플라이스 변이체를 검출합니다.
설명 20 ng DNA를 사용하여 고형암에서 흔히 돌연변이된 15개 유전자에 대한 NGS 분석.  DNA와 RNA의 변이 검출(variant calling) 정보를 사용하여 고형 종양에서 포괄적인 체세포 변이 검출 연구를 수행합니다.
수작업 시간 3.5시간 ~10.5시간
사용량 20 ng FFPE DNA  DNA 및/또는 RNA 40 ng
기기 MiSeq 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 500 시스템, HiSeq 2500 시스템
방법 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 1~24플렉스 두 인덱스 세트를 모두 사용하는 DNA의 경우 최대 32플렉스, RNA의 경우 최대 16플렉스
핵산 종류 DNA DNA, RNA
특수 샘플의 종류 FFPE 조직 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직
종 카테고리 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 체세포 변이, 삽입 결실(Indel) 유전자 융합, 체세포 변이, 구조적 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

선택 도구:

그림 자료

TruSight Tumor 15 chemistry

TruSight Tumor 15 assay는 멀티플렉스 PCR 접근법을 사용하여 높은 정확도와 민감도를 제공합니다.

TruSight Tumor 15 유전자 목록
AKT1 GNA11 NRAS
BRAF GNAQ PDGFRA
EGFR KIT PIK3CA
ERBB2 KRAS RET
FOXL2 MET TP53

TruSight Tumor 15 MiSeq Kit

OP-101-1001

1개의 라이브러리 준비 키트와 24개의 샘플에 충분한 3개의 MiSeq 시약이 포함되어 있습니다.

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TruSight Tumor 15 (Library Prep Only)

OP-101-1002

24개의 샘플에 충분한 1개의 라이브러리 준비 키트 포함.

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TruSight Tumor 15 MiniSeq Kit

20005610

1개의 라이브러리 준비 키트와 24개의 샘플에 충분한 3개의 MiniSeq 시약이 포함되어 있습니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

TruSight Tumor 15는 MiniSeq System 및 MiSeq System(v3 chemistry)과 MiSeqDx 기기(연구 모드, v3 chemistry)에서 지원됩니다. 다른 Illumina 시스템에서의 시퀀싱은 가능하지만 테스트되지 않았습니다.

TruSight Tumor 15 키트와 함께 사용할 것을 권장하는 열 순환기는 다음과 같습니다. TruSight Tumor 15 참조 가이드에 나와 있는 권장 램프 속도 설정을 따라 보세요.

  • Bio-Rad C1000

  • Bio-Rad S1000 

  • Applied Biosystems GeneAmp PCR 시스템 9700

  • Applied Biosystems Veriti 열 순환기 

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient

  • Eppendorf Mastercycler ep Gradient-S 

  • Bio-Rad C1000, Applied Biosystems GeneAmp PCR System 9700 및 Eppendorf MasterCycler ep Gradient는 내부적으로 검증되었습니다.

TruSight Tumor 15는 MiniSeq, MiSeq 및 MiSeq Dx(v3 chemistry) 시스템에서 앰플리콘 시퀀싱 및 표적 DNA 시퀀싱을 사용하여 고형암에서 일반적으로 발생하는 15개의 돌연변이 유전자를 표적으로 합니다. TruSight Tumor 170은 NextSeq 500 및 NextSeq 550 시스템에서 표적 인리치먼트(target enrichment)와 표적 DNA 및 RNA 시퀀싱을 사용하여 170개의 유전자를 표적으로 합니다. 

그렇습니다. 샘플 런(run)샘플 프로젝트를 볼 수 있습니다.  이 데이터에 액세스하려면 BaseSpace Sequence Hub 로그인이 필요합니다.

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.

참고 문헌

1. 데이터 산출은 기록에 기재되어 있습니다. Illumina, Inc. 2016.

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