AmpliSeq for Illumina BRCA Panel

BRCA1BRCA2의 체세포 및 생식세포 변이를 조사하는 표적화된 연구 패널입니다.

5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음)

Assay 시간

<1.5시간

수작업 시간

1~100 ng(풀당 10 ng 권장)

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel은 BRCA1 및 BRCA2 유전자의 체세포 및 생식세포 변이 연구를 위한 표적 재시퀀싱 assay입니다.

주요 기능

  • 관련 유전자 콘텐츠 - BRCA1 및 BRCA2의 모든 엑손 영역 및 플랭킹 인트론 시퀀스를 표적으로 함

  • 빠르고 간소화된 워크플로우 - 고품질 샘플 최소 1 ng 또는 포르말린에 고정한 파라핀 포매(FFPE) 입력 샘플 10 ng로도 하루 만에 바로 시퀀싱 가능한 라이브러리 준비

  • 정확한 데이터 - 로컬 또는 클라우드 기반 분석을 사용하여 5% 대립유전자 빈도까지 체세포 돌연변이 검출

 BRCA Panel은 AmpliSeq for Illumina 중합효소 연쇄 반응(PCR) 기반 라이브러리 준비, Illumina sequencing by synthesis(SBS) 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 기술 및 자동 분석이 포함되어 있는 통합된 워크플로우의 일부입니다.

BRCA1 및 BRCA2 는 특정 돌연변이를 보유할 때 유방암 및 난소암의 위험 증가에 관여하는 것으로 시사된 인간 종양 억제 유전자입니다. 바로 사용 가능한 이 패널은 연구자들이 표적 식별, 프라이머 설계 및 패널 최적화에 소요되는 시간과 노력을 절약해 줍니다.

사양

필수 제품

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel 워크플로우에는  BRCA Panel, Library PLUS 키트와 인덱스 어댑터가 필요합니다.

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애플리케이션

워크플로우 예시

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
iSeq 100 시스템

런당 샘플 수 12개(최소 커버리지 500배 가정)
런당 샘플 수 96개(최소 커버리지 50배 가정)

2 × 150 bp
2 × 150 bp

MiniSeq 시스템

런당 샘플 수: Mid-output: 24개, High-output: 80개(최소 커버리지 500배 가정)

2 × 150 bp

MiSeq 시스템

최소 커버리지 500배 가정 시 런당 샘플 수(시약 키트 버전별): v2 나노: 3개, v2 마이크로: 12개, v2: 48개, v3: 80개
최소 커버리지 50배 가정 시 런당 샘플 수(시약 키트 버전별): v2 나노: 32개, v2 마이크로: 96개

2 × 150 bp
2 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

비교하기

AmpliSeq for Illumina BRCA Panel TruSight Cancer
Assay 시간 5시간(라이브러리 준비만 해당, 라이브러리 정량화, 표준화 또는 풀링 시간은 포함되지 않음) 1.5일
암 종류 고형암 전체 고형암
콘텐츠 사양 BRCA1BRCA2의 엑손 영역 및 플랭킹 인트론 시퀀스 일반 및 희귀 암과 연관된 94개 유전자와 284개 SNP에 대해 인리치하는 고정된 프로브 세트.
설명 BRCA1BRCA2에 대한 생식세포 및 체세포 분석 연구용입니다. 일반 및 희귀 암에 대한 생식세포 돌연변이 검출 연구입니다.
수작업 시간 <1.5시간 5시간
사용량 1~100 ng(풀당 10 ng 권장) DNA 50 ng
기기 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템
작용 기전 Multiplex PCR
방법 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 이중 인덱스 조합 96개 최대 96플렉스
핵산 종류 DNA DNA
앰플리콘 수 총 265개. 풀 2개. (풀 1: 132개 앰플리콘. 풀 2: 133개 앰플리콘).
특수 샘플의 종류 혈액, FFPE 조직 FFPE 호환 불가, FFPE 호환 불가
종 카테고리 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel) 생식세포 변이

선택 도구:

패널 (1)

AmpliSeq™ BRCA Panel for Illumina®

20019168

BRCA1 및 BRCA2 유전자의 모든 엑손을 평가하는 표적 패널. 키트에는 24개의 반응이 포함되어 있습니다. Library PLUS 및 인덱스 별도 판매.

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라이브러리 프렙 (3)

AmpliSeq™ Library PLUS (24 Reactions) for Illumina®

20019101

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (96 Reactions) for Illumina®

20019102

96개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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AmpliSeq™ Library PLUS (384 Reactions) for Illumina®

20019103

384 라이브러리를 준비하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. AmpliSeq for Illumina 패널 및 인덱스 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (6)

AmpliSeq™ UD Indexes for Illumina® (24 Indexes, 24 Samples)

20019104

24개의 검체 라벨링에 충분한 24개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A for Illumina®

20019105

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set B for Illumina®

20019106

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 색인을 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set C for Illumina®

20019107

96개의 검체 라벨링에 충분한 96개의 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set D for Illumina®

20019167

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 8 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 시약과 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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AmpliSeq™ CD Indexes Set A-D for Illumina® (384 Indexes, 384 Samples)

20031676

Illumina, 세트 A, 세트 B, 세트 C 및 세트 D용 AmpliSeq CD 인덱스 4세트가 포함됩니다. 각 세트에는 96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 8bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 프로브 패널을 별도로 구입합니다.

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액세서리 제품 (2)

AmpliSeq™ for Illumina® Direct FFPE DNA

20023378

파라핀 제거 또는 DNA 정제 없이 Illumina 프로토콜용 AmpliSeq를 사용하여 라이브러리 구성을 위해 비염색 슬라이드 장착 FFPE 조직으로부터 DNA를 준비하는 24가지 반응을 포함합니다.

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AmpliSeq™ Library Equalizer for Illumina®

20019171

시퀀싱을 위해 Illumina 라이브러리용 AmpliSeq를 준비할 때 라이브러리 정규화를 위한 비드 및 시약이 포함됩니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq 시약 키트 v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.

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