고도로 민감하고 포괄적인 호흡기 병원체 식별 및 항균제 내성 인사이트를 제공하는 라이브러리 준비 및 강화 키트.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
호흡기 병원체 ID/AMR 농축 패널(RPIP) 키트는 단일 분석에서 > 280개의 호흡기 병원체와 > 2000개의 항미생물 내성(AMR) 표지자를 표적으로 하는 차세대 염기서열분석(NGS) 기반 호흡기 병원체 패널과 라이브러리 준비 및 농축 키트로, 병원체 식별과 관련 AMR 정보를 모두 제공합니다.
Illumina 시퀀싱 시스템 및 Explify RPIP Data Analysis App과 함께, 유연하고 확장 가능한 샘플 대 결과 워크플로우는 임상 연구 환경에서 호흡기 감염과 관련된 병원균을 식별하기 위한 신속하고 비용 효과적인 솔루션을 제공합니다.
| Assay 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 시간 |
|---|---|
| 자동화 기능 | 리퀴드 핸들링 로봇 |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 | 호흡기 병원체 DNA와 RNA를 동시에 검출하고 항균 내성(AMR) 유전자 발현을 동시에 프로파일링합니다. |
| 설명 | 호흡기 감염 및 동시 감염을 식별하고, 항균제 내성 표지자를 검출하며, 바이러스 진화 및 전파를 연구하기 위해 주요 병원체(SARS-CoV-2 및 Flu A/B 바이러스)의 균주 유형 분석을 실시한다. |
| 수작업 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 시간 |
| 사용량 | 용량 기준(농도 의존적 아님) |
| 기기 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 |
| 작용 기전 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 |
| 멀티플렉싱 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 |
| 핵산 종류 | DNA, RNA |
| 종 카테고리 | 진균, 바이러스, 세균 |
| 종 세부 사항 | 호흡기 병원체(180+ 세균, 50+ 진균, SARS-CoV-2를 포함한 40+ 바이러스) 및 항균 내성 대립유전자(1200+)를 검출한다. |
| 기술 | 시퀀싱 |
호흡기 병원체 ID/AMR 농축 패널 키트 외에도, 시퀀싱 기기, 호환 가능한 시퀀싱 시약, 문서 섹션의 사용자 가이드에 나열된 추가 제품이 필요합니다.
호흡기 병원체 ID/AMR 농축 패널 키트는 임상 연구 검체에서 > 280개의 호흡기 병원체(인플루엔자 및 SARS-CoV-2 포함) 및 > 2000개의 항균제 내성 표지자를 식별하거나 폐수와 같은 검체에서 호흡기 병원체/AMR의 일반 감시에 사용합니다.
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
| 기기 | 권장 샘플 수 | 리드 길이 |
|---|---|---|
| MiniSeq 시스템 | MiniSeq Rapid Kit: 20 samples per run based on 1M single reads per sample. MiniSeq High-Output Kit: 25 samples per run based on 1M single reads per sample. |
Rapid Kit: 1 × 100 bp. High-Output Kit: 1 × 75 bp |
| MiSeq 시스템 | MiSeq v3 Kit: 25 samples per run based on 2M paired-end reads per sample. MiSeq v2 Kit: 15 samples per run based on 2M paired-end reads per sample. |
MiSeq v3 Kit: 2 × 75 bp MiSeq v2 Kit: 2 × 150 bp |
| NextSeq 550 시스템 | NextSeq 550 High-Output Kit: 384 (available indexes) samples per run based on 2M paired-end reads per sample. NextSeq 550 Mid-Output Kit: 130 samples per run based on 2M paired-end reads per sample. |
NextSeq 550 High-Output Kit: 2 × 75 bp. NextSeq 550 High-Output Kit: 2 × 150 bp. NextSeq 550 Mid-Output Kit: 2 × 75 bp. NextSeq 550 Mid-Output Kit: 2 × 150 bp. |
NGS can identify novel coronavirus variants, track COVID-19 transmission, and more. Compare NGS methods for various coronavirus sequencing goals.
차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)은 코로나바이러스의 새로운 균주 및 기타 새로운 감염병 제제의 식별을 통해 효과적인 유전체 감시 시스템 전략을 제공합니다.
| Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit | |
|---|---|---|
| Assay 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 시간 |
| 자동화 기능 | 리퀴드 핸들링 로봇 | 리퀴드 핸들링 로봇 |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 | 호흡기 병원체 DNA와 RNA를 동시에 검출하고 항균 내성(AMR) 유전자 발현을 동시에 프로파일링합니다. | SARS-CoV-2, 인플루엔자 A 및 B 바이러스, 아데노바이러스, 리노바이러스, 호흡기 세포융합 바이러스, 기타 흔한 호흡기 바이러스를 포함한 약 40종의 흔한 호흡기 바이러스를 표적으로 하고 특성을 규명한다. |
| 설명 | 호흡기 감염 및 동시 감염을 식별하고, 항균제 내성 표지자를 검출하며, 바이러스 진화 및 전파를 연구하기 위해 주요 병원체(SARS-CoV-2 및 Flu A/B 바이러스)의 균주 유형 분석을 실시한다. | SARS-CoV-2 및 기타 흔한 호흡기 바이러스를 검출하고 분석하기 위한 간소화된 워크플로우. 독립적 설계는 여러 관심 대상 검체 유형 전반에서 병원성 바이러스의 광범위한 식별을 가능하게 한다. |
| 수작업 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 시간 |
| 사용량 | 용량 기준(농도 의존적 아님) | 10~100 ng |
| 기기 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 |
| 작용 기전 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 | 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 |
| 멀티플렉싱 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 |
| 핵산 종류 | DNA, RNA | DNA, RNA |
| 종 카테고리 | 진균, 바이러스, 세균 | 인간, 바이러스 |
| 종 세부 사항 | 호흡기 병원체(180+ 세균, 50+ 진균, SARS-CoV-2를 포함한 40+ 바이러스) 및 항균 내성 대립유전자(1200+)를 검출한다. | 최근 인플루엔자 바이러스 균주 및 SARS-CoV-2 등 일반적인 호흡기 바이러스를 검출합니다. 패널에는 품질 기능으로 인간 표적에 대한 프로브가 포함되어 있으므로 분석된 모든 샘플의 인간 표적을 검출합니다. |
| 기술 | 시퀀싱 | 시퀀싱 |
표적 인리치먼트 프로브 및 Respiratory Pathogen ID/AMR Panel Kit 워크플로우는 프로브로 완전히 타일링된 패널에 있는 두 바이러스의 균일한 커버리지를 제공합니다.
Respiratory Pathogen ID/AMR Panel Kit를 사용하여, 병원체는 A. fumigatus를 제외하고 100개의 유전체 복제까지 검출 가능했습니다. 인플루엔자 A의 검출은 보다 민감했으며 10개의 유전체 복제본에 대해 검출되었습니다.
Respiratory Pathogen ID/AMR Panel Kit를 사용하면 스파이크인 대조군을 사용한 후 Explify RPIP Data Analysis App앱을 사용한 분석을 통해 병원체 수치를 정량화할 수 있습니다. 이 그림은 qPCR과 NGS로 측정한 임상 연구 샘플에서 SARS-CoV-2 바이러스 부하의 비교를 보여줍니다. 두 가지 방법인 Spearman r = 0.87은 유의한 상관관계를 보이며, 중요한 점은 이 NGS 접근법이 qPCR과 같은 표준 곡선 생성을 필요로 하지 않는다는 것입니다.
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set A (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20047050
Illumina RNA Prep with Enrichment 키트 시약, Illumina DNA/RNA UD 인덱스 세트 A용 IDT, 96개의 샘플에서 라이브러리를 준비한 후 32개의 3-플렉스 증균 반응을 준비하기 위한 호흡기 병원체 ID/AMR 패널을 포함하여 라이브러리 준비 및 증균에 필요한 모든 시약을 포함합니다.
List Price:
Discounts:
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set B (RUO) (96 indexes, 96 samples)
20046969
Illumina RNA Prep with Enrichment 키트 시약, Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B용 IDT, 96개 샘플에서 라이브러리를 준비한 후 32개 3중 증균 반응을 준비하기 위한 호흡기 병원체 ID/AMR 패널을 포함하여 라이브러리 준비 및 증균에 필요한 모든 시약을 포함합니다.
List Price:
Discounts:
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set C (RUO) (96 indexes, 96 Samples)
20047051
Illumina RNA Prep with Enrichment 키트 시약, IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set C, 호흡기 병원체 ID/AMR 패널을 포함하여 라이브러리 준비 및 농축에 필요한 모든 시약이 포함되어 96개의 샘플에서 라이브러리를 준비한 후 32개의 3-플렉스 농축 반응을 준비합니다.
List Price:
Discounts:
Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Kit Set D (RUO) (96 indexes, 96 Samples)
20047052
Illumina RNA Prep with Enrichment 키트 시약, IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set D, Respiratory Pathogen ID/AMR 패널을 포함하여 라이브러리 준비 및 농축에 필요한 모든 시약이 포함되어 96개의 샘플에서 라이브러리를 준비한 후 32개의 3-플렉스 농축 반응을 준비합니다.
List Price:
Discounts:
표시 /
제품
수량
단가
제품
카탈로그 ID
수량
단가
결과에는 샘플에 존재할 수 있음을 나타내는 최소 수준의 지지가 있는 표적 호흡기 병원체가 나열되어 있습니다. 이 결정은 뒷받침하는 리드 및 머신 러닝의 수에 기초하여 생성되고 해석된 병원체 시퀀스 데이터에 기초합니다.
AMR 유전자는 내성을 부여할 수 있는 관련 세균 및 항생제와 함께 열거되어 있습니다.
Illumina는 일반적으로 최소 1 × 100 bp 또는 2 × 75 bp 시퀀싱 화학물질을 사용하여 샘플당 1M 싱글 리드 또는 2M 페어드 엔드 리드로 시작하는 것을 권장합니다. 이러한 수치는 시작점이며 샘플의 종류 및 표적 풍부도에 기반하여 최적화되어야 합니다.
이 저처리량 내지 중간 처리량 NGS assay를 통해 모든 규모의 검사실은 새로운 SARS-CoV-2 변이의 출현 및 유병률을 식별하고 추적할 수 있습니다.
발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.
이 저처리량 내지 중간 처리량 NGS assay를 통해 모든 규모의 검사실은 새로운 SARS-CoV-2 변이의 출현 및 유병률을 식별하고 추적할 수 있습니다.
Reagent v2.5 키트는 시작 형광 강도를 유지하는 탄성 플로우 셀을 사용하여 이전 버전에 비해 안정성과 성능을 개선합니다.
MiniSeq System Reagent 키트에는 샘플 수가 적더라도 비용 효율적인 시퀀싱을 위한 2채널 SBS 화학 물질이 포함된 즉시 사용 가능한 카트리지가 있습니다.
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
검사실에서는 이 고처리량 차세대 시퀀싱 assay를 통해 SARS-CoV-2 돌연변이를 검출하여 새로운 변이의 출현과 유행을 식별하고 추적할 수 있습니다.
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