AmpliSeq for Illumina Custom Panel

연구 목표에 최적화된 맞춤형 표적 재시퀀싱 패널을 형성하세요

컴퓨터 화면을 검토하는 과학자

NGS 연구를 위한 맞춤형 콘텐츠를 설계 및 주문하세요

ready-to-use 패널에서 사용할 수 없는 특정 유전자와 관심 대상 표적에 초점을 맞추기 위해 맞춤형 패널을 생성하세요. 웹 기반의 무료 DesignStudio Assay Design Tool을 사용하여 표적 관심 영역을 제출하고 귀하의 연구에 개인화된 패널 콘텐츠를 받아 보세요.

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AmpliSeq for Illumina Custom Panels 주요 특징

주요 기능 및 이점

간소화된 맞춤화

간단한 사용자 인터페이스, 견고한 알고리즘 및 동적 피드백을 제공하는 DesignStudio Assay Design Tool을 사용하여 맞춤형 패널을 빠르고 쉽게 구축하세요.

콘텐츠 유연성

완전한 맞춤형 패널을 만들거나 사전 설계된 Ready-to-Use 또는 Community Panel에 관심 대상을 추가해 보세요.

맞춤형 DNA 옵션

기준 DNA 또는 FFPE 조직 분석을 위해 풀당 최대 3,072개의 앰플리콘과 패널당 12,288개의 앰플리콘으로 패널을 설계하세요.

맞춤형 RNA 옵션

2만개의 RefSeq 유전자 중에서 선발하여 단일 assay에서 12개에서 만2천개까지 표적의 유전자 발현을 측정할 수 있습니다.

저사용량 샘플의 종류

포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직과 같은 까다로운 샘플의 종류에서 최소한의 사용량만으로도 높은 커버리지 균일성을 지닌 고품질 데이터를 얻으세요.

빠른 라이브러리 준비

단 1.5시간의 수작업 시간을 포함해 5시간의 짧은 시간 내에 균일성이 높은 표적적중 증폭 라이브러리를 준비하세요.

AmpliSeq for Illumina Custom DNA Panel 설계 작용 방법

Illumina 맞춤형 패널용 AmpliSeq을 생성하려면 DesignStudio Assay Design Tool을 사용하여 분석 유형, 종, 샘플 유형 및 최대 앰플리콘 길이와 같은 매개변수를 선택합니다. 관심 대상 유전자 또는 좌표를 사용하여 표적을 추가합니다. 표적은 사전에 로드된 참조 유전체를 기반으로 선발하거나 맞춤형 참조 유전체를 업로드할 수 있습니다.

앰플리콘을 설계하기 위해서는, 최적화된 알고리즘은 GC 함량, 특이도 및 커버리지를 포함한 다양한 요소를 고려합니다. 후보 앰플리콘은 추정 성공 점수를 사용하여 시각화되고 평가됩니다. 설계로부터 앰플리콘을 필터링, 추가 또는 제거할 수 있습니다. 시각화 및 QC 후 패널을 주문할 수 있습니다.

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맞춤형 분석법 설계 서비스

커버리지를 개선하고 추가 기능 또는 비인간 종(species) 설계를 Illumina Concierge 설계 지원을 통해 사용하세요. 컨시어지 팀은 엔드투엔드 프로젝트 관리, 인실리코 서비스 커버리지 및 설계 지원을 제공합니다.

Research design team in collaboration

AmpliSeq for Illumina 온디맨드 패널 자주 묻는 질문

DesignStudio Assay Design Tool에 등록하거나 로그인하여 새로운 설계를 시작하세요. 사전에 로드한 참조 유전체를 선발한 다음 관심 유전체 영역에 추가합니다. AmpliSeq for Illumina Ready-to-Use 또는 커뮤니티 패널의 콘텐츠가 마음에 드는 경우, 추가 맞춤화를 위한 출발점으로 DesignStudio 도구에 제품 manifest 파일을 직접 업로드할 수 있습니다. 자세히 알아보기.

통합 샘플 바코드로 시퀀싱 런당 최대 96개의 샘플을 풀링할 수 있습니다. 풀링할 수 있는 실제 샘플의 수는 앰플리콘의 수 및 원하는 커버리지 깊이에 따라 달라집니다. DesignStudio Assay Design Tool에는 이러한 파라미터를 알려주는 온라인 계산기가 있습니다.

BaseSpace Public Data에서 AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panels 및 기타 AmpliSeq for Illumina Panel용 BaseSpace Sequence Hub 데모 데이터 세트를 볼 수 있습니다.

아니요. DesignStudio Assay Design Tool은 전례 없는 앰플리콘 멀티플렉싱 성능을 제공하는 높은 신뢰도의 앰플리콘 설계를 도출해내지만 설계 및 샘플 사용량이 다를 수 있으므로 각 설계의 성능을 경험적으로 테스트해야 합니다. >5천개 이상의 사전에 검사한 유전자의 카탈로그로부터 맞춤형 패널을 생성하려면 AmpliSeq for Illumina On-Demand Panel을 사용하세요.

에는 DesignStudio Assay Design Tool 사용에 대한 단계별 가이드가 포함되어 있습니다. DesignStudio와 관련하여 도움이 더 필요한 경우 Illumina 기술 지원 부서에 문의하세요. 주문과 관련하여 도움이 필요한 경우 영업 담당자에게 문의하세요.

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추가 자원

Amplicon sequencing

하나의 assay에서 최대 수백 개의 표적 유전체 영역을 비용 효율적으로 분석하여 PCR 앰플리콘의 초심층 시퀀싱을 수행합니다.

Cancer panels for targeted sequencing

집중 유전자 패널로 표적 암 시퀀싱을 수행하고, 이렇게 하여 비용을 절감하고 연구를 신속하게 완료할 수 있습니다.

Targeted resequencing

유전자 프로파일링 연구를 위해 사전 설계된 또는 맞춤형으로 설계된 패널을 사용하여 관심 대상 특정 유전자 또는 관심 유전체 영역을 선택 및 시퀀싱해 보세요.

전문가와 상담하기

Illumina용 AmpliSeq 제품에 대해 자세히 알아보려면 Illumina 전문가에게 문의하세요.