NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Infinium Global Diversity Array (GDA) with Enhanced PGx-8 v1.0 BeadChip은 다양한 모집단에서의 약리유전체학(PGx) 연구뿐만 아니라 다유전성 위험도 개발, 혈통 결정 및 유전병 연구를 지원합니다.
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx
Infinium Global Diversity Array (GDA) with Enhanced PGx는 약리유전체학 연구를 위한 시중에서 가장 포괄적인 유전형 분석 마이크로어레이입니다.
주당 최대 1,728개 샘플
샘플 처리량
어레이당 8개 샘플
샘플 수
표지자 총 1,933,117개, 맞춤형 추가 용량 175,000개
표지자의 수
개요
포괄적인 커버리지
GDA with Enhanced PGx는 CYP2D6, CYP2B6, TPMT와 같이 식별하기 어려운 유전자를 포함하여 PharmGKB1, CPIC2, PharmVar3, ClinVar4와 같은 공공 PGx 데이터베이스에서 6,000개를 초과하는 주석이 달린 변이의 커버리지를 제공합니다.
모집단 전반에서 탁월한 엑손 함량
GDA with Enhanced PGx는 엑손 영역의 태그 지정 기능이 개선되었으며, 강화된 커버리지를 특징으로 이전에 확인된 질병 또는 형질 연관성을 갖는 유전체 차원의 연관성 연구(GWAS)의 유전자좌를 매핑할 수 있습니다.
샘플 식별을 위한 QC 표지자
BeadChip에는 대규모 연구를 위한 품질 관리(QC) 표지자가 포함되어 있어 샘플 식별, 추적, 혈통 결정, 계층화 등이 가능합니다.
사양
| Assay 종류 | Infinium LCG |
|---|---|
| 자동화 기능 | 자동 어레이 로더, 리퀴드 핸들링 로봇 |
| 설명 | Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx는 8-sample BeadChip에 구축되었으며 > 1.9M 마커를 포함합니다. 이는 약물유전체학(PGx) 연구를 위해 시판되는 가장 포괄적인 유전형 마이크로어레이이며, 질병 및 다양성 연구와 기타 응용 분야를 지원합니다. |
| 사용량 | 200 ng |
| 기기 | iScan System |
| 방법 | 전장 유전체 지노타이핑 어레이 |
| 핵산 종류 | DNA |
| 표지자의 수 | 표지자 총 1,933,117개, 맞춤형 추가 용량 175,000개 |
| 샘플 수 | 어레이당 8개 샘플 |
| 샘플 처리량 | 주당 최대 1,728개 샘플 |
| 특수 샘플의 종류 | 혈액 |
| 종 카테고리 | 인간 |
| 기술 | Microarray |
| 변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 염색체 이상, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) |
필수 제품
선택한 키트 크기를 한 번에 실행하는 샘플 수에 맞춰 보세요. 각 키트는 단일 배치로 처리되며 여러 실험에 걸쳐 분할되도록 설계되지 않았습니다. 처리량이 적은 배치를 여러 개 처리하는 경우 여러 개의 소형 키트를 주문해 보세요. 고정 콘텐츠 키트에는 스타 대립유전자 호출 및 대사자 상태가 포함된 해석 보고서가 포함됩니다.
맞춤형 추가 콘텐츠를 사용할 수 있습니다.
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건
애플리케이션
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx는 약리유전체학(PGx) 연구, 다유전성 위험도 개발, 혈통 결정 및 유전병 연구를 지원하도록 설계되었습니다.
워크플로우 예시
콘텐츠 선발
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx
어레이 처리 및 스캔
관련 애플리케이션 및 방법
Pharmacogenomics, the study of how variations in the human genome affect our response to medications, may help reduce adverse drug reactions and medical costs.
Polygenic risk scores represent the total number of genetic variants an individual has that increase their risk of developing a particular disease.
신약 개발 노력을 알리고 표적 치료제 개발을 지원하도록 설계된 혁신적인 유전체 분석 솔루션을 살펴보세요.
다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법
비교하기
| Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx | Infinium Global Diversity Array-8 Kit | Infinium Global Screening Array-24 Kit | |
|---|---|---|---|
| Assay 종류 | Infinium LCG | Infinium LCG | Infinium HTS |
| 자동화 기능 | 자동 어레이 로더, 리퀴드 핸들링 로봇 | 자동 어레이 로더, 리퀴드 핸들링 로봇 | 자동 어레이 로더, 리퀴드 핸들링 로봇 |
| 설명 | Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx는 8-sample BeadChip에 구축되었으며 > 1.9M 마커를 포함합니다. 이는 약물유전체학(PGx) 연구를 위해 시판되는 가장 포괄적인 유전형 마이크로어레이이며, 질병 및 다양성 연구와 기타 응용 분야를 지원합니다. | The 8-sample Infinium Diversity Array provides targeted coverage of more than 4800 key genes across the genome. Approximately 1.8M markers are included on the BeadChip for high exonic coverage in regions of disease relevance, providing highly accurate copy number variation calls, and an average resolution of 1.5Mb. | Infinium 글로벌 스크리닝 Array-24 키트는 모집단 규모의 유전학, 중개 연구, 변이 스크리닝 연구, 정밀 의학 연구를 위한 경제적인 유전자형 분석 어레이로, 최적화된 다민족 유전체 전체 콘텐츠, 선별된 임상 연구 변이, QC 표지자를 결합합니다. |
| 사용량 | 200 ng | 200 ng | 200 ng |
| 기기 | iScan System | iScan System | iScan System |
| 방법 | 전장 유전체 지노타이핑 어레이 | 전장 유전체 지노타이핑 어레이 | 고처리량 지노타이핑 어레이, 전장 유전체 지노타이핑 어레이 |
| 핵산 종류 | DNA | DNA | DNA |
| 표지자의 수 | 표지자 총 1,933,117개, 맞춤형 추가 용량 175,000개 | 1,825,277 fixed markers. Custom marker add-on capacity: Up to 175K. | 654,027개의 고정 마커. 사용자 지정 마커 추가 용량: 최대 100K . |
| 샘플 수 | 어레이당 8개 샘플 | 8 samples per array | 어레이당 24개 샘플 |
| 샘플 처리량 | 주당 최대 1,728개 샘플 | 1728 samples per week | 주당 약 5,760개 샘플 |
| 특수 샘플의 종류 | 혈액 | 혈액, FFPE 조직, 비강 도말, 타액 | 혈액, FFPE 조직, 비강 도말, 타액 |
| 종 카테고리 | 인간 | 인간 | 인간 |
| 기술 | Microarray | Microarray | Microarray |
| 변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 염색체 이상, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) | 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 염색체 이상, 구조적 변이, 유전자 복제수 변이(CNV) | 단일 염기 다형성(SNP), 구조적 변이, 유전자 복제수 변이(CNV) |
선택 도구:
그림
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx 콘텐츠
내부 파이는 전장 유전체 커버리지, 임상 연구 및 품질 관리(QC)를 위해 선택된 어레이의 비율을 보여줍니다. 외부 링은 1kGP5에 존재하는 고유 변이체에 대한 가중 참조 전역 대립유전자 빈도를 보여줍니다. 1kGP에 없는 변이에는 라벨이 지정되어 있습다. 개수는 고유한 변이의 수를 나타냅니다.
다양한 영역의 약리유전체학 표지자
CPIC 가이드라인 및 PharmGKB 데이터베이스에 기반한 임상 연구 콘텐츠입니다.1,2 PGx 공개 데이터베이스 변이, PharmGKB에 주석이 달린 변이, PharmVar,3 CPIC, 전장 유전체 PGx 커버리지, 확장된 ADME 유전자, 표적 대치(imputation) 태그 SNP 및 CPIC 레벨 A CNV 태그를 포함한 CPIC 레벨 A 유전자가 포함됩니다.
다양한 모집단을 다루는 질병 연구 콘텐츠
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx에는 (A) ClinVar 범주 및 (B) NHGRIGWAS 범주에 기반한 다양한 표현형(phenotype) 및 질병 분류에 대한 광범위한 커버리지가 포함됩니다.
QC 표지자
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx의 QC 변이체는 성별 결정, 대륙 혈통, 인간 식별 등과 같은 다양한 샘플 추적 기능을 지원합니다.
데이터 성능 및 간격
신뢰할 수 있는 Infinium chemistry는 Illumina 유전형 분석(genotyping) 어레이가 10년 넘게 제공한 것과 동일한 고품질의 재현 가능한 데이터를 제공합니다. Infinium assay의 개별 유전형 분석 호출의 높은 신호 대 잡음비는 전장 유전체 복제 CNV 호출에 대한 액세스를 제공합니다.
| 데이터 성능 | 값a | 제품 사양b | |
| 콜 비율 | 99.7% | 평균 > 99.0% | |
| 재현성 | 99.99% | > 99.90% | |
| 간격 | |||
| 간격(kb) | 평균 | 중앙값 | 90번째%c |
| 1.53 | 0.61 | 3.91 | |
a. 값은 유전형 분석(genotyping) 2228 HapMap 참조 샘플에서 파생됩니다.
b. 여성 샘플에 대한 y 염색체 표지자 제외
c. Gentrain 샘플 세트의 결과에 기반
자원
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx-8 v1.0 BeadChip이 약리유전체학 연구 애플리케이션에 어떻게 특별히 적합한지 알아보세요.
기성 콘텐츠 (2)
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx-8 v1.0 Kit (48 Samples)
20044822
48개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 6개의 8-샘플 BeadChip 및 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 200 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.
List Price:
Discounts:
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx-8 v1.0 Kit (384 Samples)
20044823
48개의 8-샘플 BeadChip 및 384개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 입력에 200 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.
List Price:
Discounts:
애드온 콘텐츠 (2)
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx-8+ v1.0 Kit (48 Samples)
20048347
6개의 8-샘플 BeadChip 및 48개의 DNA 샘플을 증폭, 파편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. DesignStudio를 사용하여 추가 ≤ 175K 마커로 콘텐츠를 사용자 지정하거나 부스터로 사용할 수 있는 추가 콘텐츠 목록에서 선택합니다. 입력에 200 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx-8+ v1.0 Kit (384 Samples)
20048348
48개의 8-샘플 BeadChip 및 384개의 DNA 샘플을 증폭, 단편화, 혼성화, 라벨링 및 검출하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. DesignStudio를 사용하여 추가 ≤ 175K 마커로 콘텐츠를 사용자 지정하거나 부스터로 사용할 수 있는 추가 콘텐츠 목록에서 선택합니다. 입력에 200 ng DNA가 필요합니다. 각 키트는 단일 배치로 처리됩니다.
소프트웨어 & 인포매틱스 옵션 (4)
DRAGEN Array Cloud – star allele annotation
20109886
분석 비용은 샘플별로 계산합니다.
List Price:
Discounts:
DRAGEN Array Local – star allele annotation
20109885
분석 비용은 샘플별로 계산합니다.
List Price:
Discounts:
ICA Basic Annual Subscription
20044874
Illumina Connected Analytics(ICA) 기본 연간 구독. 이 제품에는 시퀀싱 장비 연결, 데이터 관리 기능, 사전 패키지 도구에 대한 액세스 등 TSO500 고객을 위한 ICA 무료 액세스 1년이 포함됩니다.
Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.
List Price:
Discounts:
서비스 (1)
Infinium® Assay: An Introduction – Customer Site
20015273
사용자가 Infinium 프로토콜의 필수 단계를 숙지할 수 있도록 3일간의 고객 현장 실습 지침 제공. 이 과정은 샘플 및 BeadChip 준비, iScan 시스템을 사용한 샘플 스캐닝, 배열 분석 소프트웨어를 사용한 일차 데이터 평가 및 분석에 대한 실습 교육을 제공합니다.
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자주 묻는 질문
GDA with Enhanced PGx는 PGx 연구, 다유전성 위험도 개발, 유전병 연구, 혈통 결정 등에 관심이 있는 임상 및 중개 연구자에게 이상적입니다. PGx 연구는 의사들이 약물 대체 또는 용량 증량을 통해 치료를 맞춤화하고 잠재적 위험을 감소시켜 의료 비용 절감, 입원 기간 단축, 약물 안전성 및 유효성 개선을 가능하게 하는 것을 목표로 합니다.
GDA with Enhanced PGx는 GDA의 전장 유전체 ADME 표지자 ~31,000개와 비교하여 CYP2D6과 같은 중요한 PGx 유전자를 포함하여 > 44,000개의 ADME 표지자의 전장 유전체 커버리지를 제공합니다. 또한 CYP2D6, CYP2B6, TPMT와 같은 중요 유전자의 정확한 유전형 분석을 위한 표적 유전자 증폭 단계도 포함되어 있습니다. 여기에는 PharmGKB, CPIC, ClinVar, PharmVar 등 세계적으로 인정받는 PGx 데이터베이스의 > 6천 개의 변이도 포함되어 있습니다.
GDA with Enhanced PGx 워크플로우에는 위유전자를 명확히 하기 위한 표적 유전자 증폭(TGA)을 위한 추가 단계가 포함되어 있습니다. 프로토콜의 1일차에는 열 순환기가 필요합니다. 2일차에 TGA 반응 산물을 전장 유전체 증폭(WGA) 반응 산물에 첨가하고, 나머지 워크플로우 단계는 절편화로 시작하여 표준 GDA와 같이 진행합니다. 전체 워크플로우 시간은 두 assay 모두에서 유사합니다.
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건
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
TruSight Oncology 500
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
Illumina DNA Prep
다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.
Infinium Global Diversity Array-8 Kit
임상 연구 변이체에 대한 탁월한 커버리지(coverage)와 유전형 선별(genotype screening)을 위해 최적화된 다민족, 전장 유전체 콘텐츠를 결합하는 BeadChip입니다.
Infinium Global Screening Array-24 Kit
집단 유전학, 약리유전체학 연구, 정밀의학 연구를 위한 확장 가능하고 비용 효율적인 솔루션을 제공하는 유전형 분석 어레이.
Infinium FFPE QC & DNA Restoration Kits
Infinium 어레이 기반 assay에 사용하기 위해 샘플 품질을 평가하고 분해된 FFPE DNA 샘플을 복구합니다.
참고 문헌
1. PharmGKB, The Pharmacogenomics Knowledgebase. pharmgkb.org. 2020년 1월 23일 접속.
2. Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC). cpicpgx.org. 2020년 1월 23일 접속.
3. PharmVar, Pharmacogene Variation Consortium. pharmvar.org. 2020년 1월 23일 접속.
4. ClinVar Database. ncbi.nlm.nih.gov/clinvar. 2020년 1월 23일 접속.
5. European Bioinformatics Institute. 1000 genomes.org. 2021년 1월 23일 접속.
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