
Infinium Global Diversity Array with Enhanced PGx
Infinium Global Diversity Array (GDA) with Enhanced PGx는 약리유전체학 연구를 위한 시중에서 가장 포괄적인 유전형 분석 마이크로어레이입니다.
DRAGEN Array는 Infinium 마이크로어레이를 위한 정확하고 포괄적이며 효율적인 2차 분석을 제공합니다.
DRAGEN(Dynamic Read Analysis for GENomics) 어레이 2차 분석은 Infinium 어레이 기반 assay를 위한 고성능 바이오인포매틱스 소프트웨어입니다. DRAGEN Array는 최첨단 데이터 분석 도구를 사용하여 정확하고 포괄적이며 매우 효율적인 2차 분석을 제공하여 유전체 인사이트을 극대화하고 연구 요구 사항을 충족합니다.
유전형 분석, 약물유전체학(PGx) 분석 및 메틸화 QC를 포함한 다양한 애플리케이션에서 고품질의 빠른 결과를 제공합니다.
DRAGEN 어레이는 포괄적인 Infinium 마이크로어레이 솔루션의 일부입니다. 전문적으로 설계된 콘텐츠가 포함된 맞춤형, 반 맞춤형 또는 기성형 마이크로어레이 중에서 선택한 다음, 신속한 DNA에서 데이터로의 워크플로우로 데이터를 처리, 스캔 및 분석합니다.
DRAGEN Array는 로컬 명령줄 패키지(전문 FPGA(Field Programmable Gate Array) 서버나 하드웨어가 필요하지 않음)와 직관적인 그래픽 사용자 인터페이스(GUI)를 갖춘 클라우드 기반 패키지를 제공합니다.
DRAGEN Array는 로컬 명령줄 패키지(전문 FPGA(Field Programmable Gate Array) 서버나 하드웨어가 필요하지 않음)와 직관적인 그래픽 사용자 인터페이스(GUI)를 갖춘 클라우드 기반 패키지를 제공합니다.
기기 | iScan System |
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방법 | 메틸레이션 어레이, 고처리량 지노타이핑 어레이, 전장 유전체 지노타이핑 어레이, 표적 지노타이핑 어레이 |
핵산 종류 | DNA |
종 카테고리 | 인간 |
기술 | Microarray |
변이 클래스 | 단일 염기 다형성(SNP), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) |
DRAGEN Array는 Infinium 마이크로어레이를 위한 정확하고 포괄적이며 효율적인 2차 분석을 제공합니다.
설명 | 변이 유형 검출됨 | 로컬 분석 | 클라우드 분석 | |
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유전형 분석 | 모든 인간 Infinium 유전형 분석(genotyping) 어레이1에 대해 99.5% 이상의 유전형 분석 정확도를 제공합니다. | SNV 삽입/결실 |
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PGx – CNV 콜 | 95% 이상의 PGx CNV 정확도 제공2. 9개 표적 영역에 걸쳐 6개 표적 유전자에 대한 PGx CNV 커버리지. | SNV 삽입/결실 CNV |
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PGx – 스타 대립유전자 어노테이션 | 50개 이상의 유전자에 대해 1700개 이상의 표적에 걸쳐 PGx 스타 대립유전자 및 변이 커버리지를 제공합니다. 98%를 초과하는 콜 비율로 파악하기 어려운 CYP2D6을 포함하여 식별이 어려운 PGx 유전자를 평가합니다3. | SNV 삽입/결실 CNV 스타 대립유전자 디플로타입 |
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메틸레이션 QC | 고처리량 정량 메틸레이션 품질 관리를 제공합니다. | 메틸레이션 지표 | checkmark
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자세한 내용 보기: https://help.dragenarray.illumina.com/overview/our-features
DRAGEN Array
Understanding chromosome aberrations through cytogenetic analysis is an integral part of current genomic medicine, playing a role in research into both constitutional disorders and cancer.
Polygenic risk scores represent the total number of genetic variants an individual has that increase their risk of developing a particular disease.
메틸레이션 어레이를 사용하면 단일 뉴클레오티드 해상도로 유전체 전반의 메틸레이션 영역에 대한 고처리량 정량적 조사를 수행할 수 있습니다.
DRAGEN Array 클라우드 분석, 1단계
'Runs – Microarray Analysis Setup'(런 - 마이크로어레이 분석 설정)으로 이동하여 분석 시작.
DRAGEN Array 클라우드 분석, 2단계
분석 구성 설정.
DRAGEN Array 클라우드 분석, 3단계
샘플 시트 가져오기, BeadChip 선택 또는 IDAT 파일 가져오기를 사용하여 분석할 샘플 선택.
DRAGEN Array 클라우드 분석, 4단계
결과 보기.
효율적인 PGx 분석
여러 출력 옵션을 생성하는 단일 플랫폼에서 유전형 분석, PGx CNV 검출 및 스타 대립유전자 어노테이션을 생성합니다.
스타 대립유전자 어노테이션
다운스트림 처리에 사용되는 스타 대립유전자 어노테이션 JSON 파일의 예. 지원 변이, 누락 변이 및 테스트한 대립유전자를 제공합니다.
조정 가능한 임계값을 사용한 메틸화 QC
21개의 제어 지표는 출력 품질을 평가합니다. 조절 가능한 합격/불합격 임계값은 스캐너 차이, 샘플 유형 차이 또는 연구 설계 선호도를 수용합니다.
DRAGEN Array Local – star allele annotation
20109885
분석 비용은 샘플별로 계산합니다.
List Price:
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DRAGEN Array Cloud – star allele annotation
20109886
분석 비용은 샘플별로 계산합니다.
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Illumina Analytics - 1 iCredit
20042038
iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.
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Illumina Analytics Starter Pack - 1,000 iCredits
20042039
iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.
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Illumina Analytics - 5,000 iCredits
20042040
iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.
List Price:
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Illumina Analytics - 50,000 iCredits
20042041
iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.
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Illumina Analytics - 100,000 iCredits
20042042
iCredit은 BaseSpace Sequence Hub 또는 Illumina Connected Analytics에서 데이터 보관 및 분석에 사용됩니다.
List Price:
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ICA Basic Annual Subscription
20044874
Illumina Connected Analytics(ICA) 기본 연간 구독. 이 제품에는 시퀀싱 장비 연결, 데이터 관리 기능, 사전 패키지 도구에 대한 액세스 등 TSO500 고객을 위한 ICA 무료 액세스 1년이 포함됩니다.
ICA Professional Annual Subscription
20044876
Illumina Connected Analytics(ICA) Professional Annual Subscription. 이 제품에는 시퀀싱 기기 연결, 데이터 관리 기능, 사전 패키지된 도구에 대한 액세스, 도구, 파이프라인, 데이터 웨어하우스 및 노트북으로 구성된 맞춤형 워크플로우를 생성하는 기능 등 1년 동안 ICA에 대한 액세스가 포함됩니다.
ICA Enterprise Annual Subscription
20038994
Illumina Connected Analytics(ICA) Enterprise Annual Subscription. 이 제품에는 시퀀싱 기기 연결, 데이터 관리 기능, 맞춤형 및 사전 패키지 분석 도구, 데이터 웨어하우징 및 마이닝을 위한 기본 모듈을 포함한 ICA Enterprise에 대한 1년 액세스가 포함됩니다. ICA Enterprise에는 옵션인 HIPPAA BAA(미국만 해당), 싱글 사인온(SSO) 및 서비스 수준 계약(SLA)도 포함됩니다.
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참고 문헌
1,2,3 - Illumina data on file, 2023. 더 읽어 보기
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