제품

Pillar oncoReveal Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel

A pan-cancer panel with combined DNA/RNA content, utilizing the single-tube SLIMamp workflow for fast library prep and turnaround time.

샘플에서 보고까지 48시간

Assay 시간

약 3시간

수작업 시간

DNA 5~80 ng, RNA 10~50 ng

사용량

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Overview

The oncoReveal Multi-Cancer with CNV and RNA Fusion Panel is a combined DNA/RNA multi-cancer panel. The assay combines the DNA-based oncoReveal Multi-Cancer v4 with CNV Panel with the oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel allowing for joint sequencing. The assay uses proprietary Stem Loop Inhibition-Mediated amplification (SLIMamp) technology, a tiled amplicon-based library prep chemistry for efficient single-tube target enrichment.

  • Maintain control of samples and results with single-tube, tiled amplification that can be performed in-house by any NGS lab

  • Achieve variant detection as low as 1% VAF without UIDs, even with limited DNA input or poor sample quality

  • Improve lab efficiency and reduce “no calls,” repeat testing and difficult interpretation decisions

  • In under 8 hours from DNA to sequencer and under 9–10 hours from RNA to sequencer

Specifications

Assay 시간 샘플에서 보고까지 48시간
암 종류 전체 고형암, 고형암
콘텐츠 사양 78개 유전자 작은 전체 종양 종양학 패널
설명 DNA 및 RNA 함량이 있는 78- 유전자 앰플리콘 기반 패널, 간단한 단일 튜브 워크플로
수작업 시간 약 3시간
사용량 DNA 5~80 ng, RNA 10~50 ng
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템
작용 기전 타일링된 앰플리콘을 사용하는 Multiplex PCR
방법 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱
핵산 종류 DNA, RNA
Number of amplicons Pool 1 (DNA): 341 amplicons. Pool 2 (RNA): >80 amplicons plus MET exon 14 skipping
반응 수 DNA 24개/RNA 24개
표적적중 리드 99.5% ± 0.1%
특수 샘플의 종류 혈액, 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직
종 카테고리 인간
표적 단편 크기 평균: 120 bp(범위 86~185 bp)
기술 시퀀싱
균일성 98.2% ± 0.7%
변이 클래스 유전자 융합, 체세포 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

Required products

Pillar oncoReveal panels require the use of a Pillar index kit.

 

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/ 건

Applications

Example workflow

1
Prep

Pillar oncoReveal Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel

2
Sequence
3
Analyze

Documentation

제품 관련 자료
Support documentation

Figures

Gene list

Pillar oncoReveal Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel interrogates variants across 60 genes from DNA and 18 driver genes from RNA.

Panel specifications

Pillar oncoReveal Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel specifications for interrogation of DNA and RNA from tissue biopsy.

Pillar® oncoReveal™ Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel (24 reactions)

HNA-HS-1001-48

oncoReveal™ Multi-Cancer CNV + Fusion

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Indices PI501-8, PI701-4 (32 combinations, 96 reactions)

IDX-PI-1001-96

인덱스 PI501-8, PI701-4(조합 32개, 반응 96개)

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Kit D, indices PI501-8, PI701-12

IDX-PI-1004-192

Kit D, indices PI501-8, PI701-12

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