Illumina Protein Prep

이 자동화된 NGS 기반 단백체 솔루션은 SOMAmer 기술과 Illumina 시퀀싱 및 분석을 갖추고 있으며 2.5일 내에 9천5백 개의 인간 단백질을 검출하고 정량화합니다.

개요

Illumina Protein Prep은 NGS 판독을 통한 SOMAmer 기반 단백체 assay를 사용하여 200개 이상의 생물학적 경로에서 인간 단백질을 발견하고 정량화할 수 있습니다. 

주요 기능

  • NovaSeq 시스템에서 NGS 판독과 함께 단일 혈장 또는 혈청 샘플에서 9천5백 개의 고유한 인간 단백질 표적

  • 4시간의 수작업 시간으로 2.5일 이내에 샘플 채취 

  • DRAGEN 2차 분석 및 Illumina 커넥티드 멀티오믹스를 통한 통합 분석

엄격한 검증

Illumina Protein Prep assay에 사용되는 SOMAmer 시약은 형상 특이성 및 다이온 경쟁이 두드러진 특징을 가지고 있으며, 질량 분광법 및 ELISA(효소 결합 면역 흡착 검사)와 같은 방법을 통해 직교적으로 확인할 수 있습니다.

민감하고 역동적이며 정확함

SOMAmer 시약은 약 5.5%*의 CV 및 10로그 이상의 동적 범위에서 펨토몰 민감도로 업계 최고의 재현성을 제공합니다.

*건강한 공여자의 샘플을 사용하여 계산된 예상 CV 중앙값.

대용량 처리 확장성

전체 워크플로우는 단일 플랫폼에서 자동화되어, 최대 340개의 샘플과 주당 44개의 대조군을 처리할 수 있는 엔드 투 엔드 솔루션을 제공하며, 완벽하게 통합된 2차 분석 파이프라인과 포괄적인 3차 분석 솔루션을 제공합니다.

사양

필수 제품

Illumina Protein Prep 자동화 시스템 (카탈로그 번호 20116818).
1회 구매 필수. Illumina Protein Prep 자동화 시스템을 사용하여 assay를 자동화해야 합니다. Illumina Protein Prep 서비스 파트너에 대한 자세한 내용은 현지 Illumina 고객 관리자에게 문의하십시오. 

 

선호하는 입력 샘플의 종류에 따라 혈장 또는 혈청 assay를 선택합니다.

Illumina Protein Prep 9천5백 개의 혈장, 96 개의 반응(카탈로그 번호 20137827) 또는 Illumina Protein Prep 9천 5백 개의 혈청, 96 개의 반응(카탈로그 번호 20137828).

 

96-반응 키트당 색인 플레이트 하나를 선택합니다. 

Illumina DNA/RNA UD 인덱스(96개의 인덱스, 96개의 샘플) 

세트 A(카탈로그 번호: 20141196)

세트 B(카탈로그 번호: 20141197)

세트 C(카탈로그 번호: 20141198)

세트 D(카탈로그 번호: 20141199)

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애플리케이션

Illumina 단백질 라이브러리 준비는 생체표지자 발견 및 집단 유전학 연구를 포함하여 단백체 발견 및 정량화 애플리케이션 분야에서 약 9500개의 고유한 인간 단백질을 검출하기 위한 시퀀싱 준비 라이브러리를 지원합니다. 

워크플로우 예시

1
준비

Illumina Protein Prep

Illumina Protein Prep은 포괄적 NGS 기반 assay를 위해 합성을 통한 시퀀싱(SBS) 화학 반응과 SOMAmer 시약을 결합합니다. 전체 워크플로는 Illumina Protein Prep 자동화 시스템에서 자동화됩니다.

 

2
시퀀싱
3
분석

DRAGEN 단백질 정량화

완전한 표준화 및 단백질 발현 정량화를 위한 시퀀싱 후 통합 2차 분석 파이프라인이 자동으로 개시됩니다.

Illumina Connected Multiomics

대화형 시각 자료 및 통계 분석을 제공하는 고성능 오믹스 분석 소프트웨어를 통해 심층적인 생물학적 인사이트를 얻을 수 있습니다.

 

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NovaSeq 6000 시스템

S4 35c에서 플로우 셀당 192건의 반응

4천만 리드, 1 x 15

NovaSeq X 시스템

100억 100c에서 플로우 셀당 192건의 반응
250억 100c에서 플로우 셀당 384건의 반응

4천만 리드, 1 x 15

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

그림

Overview of the Illumina Protein Prep solution

Illumina Protein Prep 솔루션 개요

인간 혈청 또는 혈장 샘플은 SomaScan assay에 대한 입력으로 사용되며, 이어서 Illumina Protein Prep 자동화 시스템에서 자동화되고 NovaSeq 시스템에서 시퀀싱되는 Illumina 라이브러리 프렙으로 이어집니다.

Protein-capture using the SOMAScan assay

SOMAScan assay를 이용한 단백질 포획

SOMAmer 시약(파란색)에는 광분할성 링커와 바이오틴이 함유되어 있습니다. 스트렙타비딘 비드와 결합되어 특정 단백질을 포획하고 바이오틴(노란색)과 태그합니다. UV 광은 링커를 파괴하여 SOMAmer-단백질 복합체를 방출하며, 이는 새로운 비드에 포획되고 NGS를 사용하여 정량화를 위해 용출됩니다.

lllumina Protein Prep NGS conversion chemistry

lllumina Protein Prep NGS 전환 화학 반응

SomaScan assay 후, 혼성화 기반 접근법을 사용하여 SOMAmer 시약 풍부도를 바코드 시퀀싱 준비 라이브러리로 변환합니다.

자원

축소판

Illumina Protein Prep 솔루션: 단백체학의 새로운 표준

NGS 기반 Illumina Protein Prep 솔루션으로 단백체학의 다음 시대를 열어보세요. NovaSeq 6000 및 NovaSeq X 시스템으로 탁월한 효율성의 발견 역량, 시장 최고의 성능 및 통합 분석을 활용하여 차세대 단백체학 혁신을 가속화하세요.

라이브러리 프렙 (2)

Illumina Protein Prep 9.5K, Plasma, 96-Reactions

20137827

Illumina Protein Prep 9.5K, Plasma, 96-Reactions

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Illumina Protein Prep 9.5K, Serum, 96-Reactions

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Illumina Protein Prep 9.5K, Serum, 96-Reactions

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자동화 (1)

Illumina Protein Prep Automation System

20116818

This package supports customers who wants to automate their Illumina Protein Prep Assay. It includes a Tecan Fluent OEM automation system equipped to run Illumina Protein Prep Assay protocols, robotic accessories, and the control software to run the assay.

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인덱스 어댑터 (4)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set A, Auto (96 Indexes 96 samples)

20141196

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set A for labeling 96 samples sufficient for automation

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set B, Auto (96 Indexes 96 samples)

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Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set B for labeling 96 samples sufficient for automation

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set C, Auto (96 Indexes 96 samples)

20141198

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set C for labeling 96 samples sufficient for automation

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes v3, Set D, Auto (96 Indexes 96 samples)

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Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set D for labeling 96 samples sufficient for automation

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

단백질 포획에는 SOMAmer 기술(aptamer 기반)이 사용됩니다. 이 페이지의 그림 탭에서 SOMAScan assay를 사용한 단백질 포획을 참조하세요.

인간 혈장 및 혈청 샘플.

Illumina Protein Prep 9.5K assay는 약 9500개의 고유의 인간 단백질을 검출합니다. 이 패널은 종양학, 신경학, 염증, 심장학에 관여하는 단백질을 포함한 주요 생물학적 경로에서 단백질을 검출하는 데 사용할 수 있습니다.

2차 분석은 단백질 정량화 파일(ADAT)과 DRAGEN QC 보고서를 생성합니다.

2차 분석에 대한 자세한 내용은 데이터 표준화 기술서를 참조하십시오.

예, Illumina Protein Prep 자동화 시스템을 사용하여 해당 assay를 자동화해야 합니다.

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

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NovaSeq X 시리즈용 시약 키트에는 시약 카트리지, 버퍼 카트리지, 플로우 셀, Lyo insert, 사전 로드 버퍼 및 라이브러리 튜브 스트립이 포함되어 있습니다.

NovaSeq 6000 시스템 주문

지금 바로 NovaSeq 6000 시스템을 주문하세요. 가격, 가용성 등에 대한 정보는 담당자에게 문의해 주세요.

NovaSeq 6000 Reagent Kits

즉시 사용 가능한 사전 충전 시약 카트리지와 플로우 셀로 구성된 NovaSeq 6000 System용 시약 키트입니다.

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