확장 가능하고 유연한 단일세포 시퀀싱 워크플로우를 통해 세포 수준의 인사이트를 얻고, 복잡한 생물학을 탐색하고, 새로운 바이오마커를 발견해 보세요.
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Single-Cell RNA 시퀀싱 (scRNA-Seq)은 복잡한 조직 내 유전자 발현에 대한 고해상도 보기를 제공합니다. Illumina의 단일세포 시퀀싱 솔루션은 확장 가능한 미세유체공학이 없는 워크플로우를 통해 이전보다 더 쉽게 이 혁신적인 접근 방식을 이용할 수 있도록 해줍니다. 새로운 PIPseq(입자 템플릿 인스턴트 파티션 시퀀싱) chemistry를 사용하여 Illumina 단일세포 솔루션은 고성능과 사용 편의성을 제공함으로써 더 많은 연구실에 단일세포 시퀀싱 기능을 제공합니다.
PIPseq chemistry는 다른 단일세포 접근법의 예산 또는 기술 제약을 극복하는 확장 가능한 볼텍스 믹서 기반 워크플로우를 제공합니다. 민감도 높은 정밀한 전사물 검출을 가능하게 하는 이 혁신적인 방법은 신규 및 숙련된 단일세포 연구자 모두를 위한 발견 역량을 확장합니다.
이 eBook에서는 Illumina 엔드투엔드 단일세포 솔루션이 더 많은 세포 유형을 포착하고 비용을 절감하며 워크플로우를 간소화하는 데 어떻게 도움이 되는지 알아봅니다.
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Illumina Single Cell 3′ RNA Prep은 미세유체공학 기반 기술을 사용하여 분석하기 어려울 수 있는 고형암 및 뇌와 같은 수초가 풍부한 조직과 같이 취약한 세포 및 복잡한 조직에서 전사물을 민감하게 검출할 수 있게 함으로써 새로운 발견의 문을 열어줍니다.
UCSD의 이 연구는 PIPseq를 사용하여 단일세포 해상도에서 30개 이상의 망막 신경절 세포 유사 뉴런 아형을 분류했으며, 이는 녹내장과 같은 시신경 장애에서 망막 재생을 이해하는 데 매우 중요합니다.
이 UCSF 연구는 PIPseq를 사용하여 단일세포 CRISPR 스크리닝 연구를 수행하고 단일세포 해상도에서 전사체 전반에 걸친 유전자 교란의 영향을 밝혀냈습니다.
이 웨비나에서 Broad Institute의 Sheila Dodge는 연구팀이 Perturb-seq 실험을 확장하기 위해 Illumina Single Cell 3′ RNA Prep을 사용하여 5일 만에 5백만 개 이상의 세포를 처리하고 전장 유전체 CRISPR 인사이트를 얻는 방법에 대해 이야기합니다.
까다로운 신경 세포 샘플에 필요한 단일세포를 대량으로 손쉽게 생성할 수 있게 된 것은 놀라운 일입니다. 검출된 유전자, 더블릿 오류 및 미토콘드리아 오염 수준을 포함한 시퀀싱 품질은 예외적이며 다른 방법과 동등합니다.
PIPseq를 활용하는 이 접근법이 모든 연구자들에게 연구실의 레퍼토리에 영향력 있는 추가 요소가 될 것이라는 점에 의심의 여지가 없습니다.
연구자들이 면역학, 암 연구, 신경생물학, 식물 생물학 등에서 Illumina 단일세포 시퀀싱을 사용하는 방법을 살펴보세요.
UCSF 연구에서는 공동배양한 대식세포 및 섬유아세포에 Illumina Single Cell 3′ RNA Prep을 사용하여 손상 관련 섬유증의 필수 요소인, 이들 세포 간의 중요한 상호작용을 밝혀냈습니다.
UCSF 연구에서는 혼합 표현형 급성 백혈병 샘플에 Illumina Single Cell 3′ RNA Prep을 사용하여 화학요법 내성 부분집합 내에 존재하는 세포의 다양성을 조사했습니다. PIPseq은 표준 면역표현형 분석으로 검출되지 않은 세포 프로파일을 밝혀냈습니다.
NYU의 연구는 대규모 단일세포 연구(샘플당 100,000개 세포)를 위해 Illumina Single Cell 3′ RNA Prep을 사용하여 여러 마우스 종과 유전자형의 뇌 내 염증 유전자를 조사했습니다.
UCSF 및 Memorial Sloan Kettering Cancer Center의 연구자들은 기존 방법을 사용하여 성공적으로 포착하기 어려운 희귀하고 이질적인 골수 모집단인 장기 조혈모세포를 분리하고 특성 규명을 하기 위해 수정된 PIPseq 기반 방법을 사용했습니다.
Max Planck Institute 및 University of Georgia의 과학자들은 다양한 식물 조직의 개별 세포에서 4개의 천연물 계열에 걸쳐 16개의 대사물 농도를 식별하고 정량화하기 위해 Illumina Single Cell 3′ RNA Prep과 질량 분석법을 결합했습니다.
Ramaciotti Centre for Genomics의 책임자인 Martin Smith 박사와 Garvan Institute of Medical Research의 R&&D 과학자인 Keyi Jiang 박사가 PIPseq chemistry가 지원하는 Illumina Single Cell 3' RNA Prep을 사용한 직접 경험을 공유합니다. 이 솔루션이 간단한 워크플로우, 확장 가능한 라이브러리 준비, 저렴한 비용으로 대체 플랫폼과 유사한 고품질 데이터, 그리고 직관적인 분석 도구를 제공하여 연구를 어떻게 변화시켰는지 알아보려면 비디오를 시청하십시오.
DRAGEN 2차 분석 및 Illumina Connected Multiomics를 사용하여 단일세포 데이터를 분석하고 시각화할 수 있습니다. 이러한 고성능 소프트웨어 도구를 통해 연구자들은 단일세포 결과를 생물학적 맥락 위에 놓고 해석함으로써 의미 있는 통찰력을 얻을 수 있습니다.
단일세포 시퀀싱 데이터는 DRAGEN Single Cell RNA pipeline을 사용하여 분석되며, 이 파이프라인은 Illumina Single Cell 3' RNA Prep을 사용하여 생성된 원시 시퀀싱 데이터를 처리하도록 최적화되어 있습니다. 이 고성능 도구는 리드를 참조에 정렬하고 매핑하며 위치 정렬 후 유전자 매칭을 수행합니다. 오류 수정 후, 세포당 고유한 분자 수를 사용하여 세포를 필터링하고 최종 발현 행렬을 생성합니다. 그런 다음 Illumina Connected Multiomics에서 결과를 시각화합니다.
Illumina Connected Multiomics는 단일세포 시퀀싱 데이터를 탐색하기 위한 간소화되고 사용이 용이한 소프트웨어입니다. 필터링, 정규화, 차원 감소, 클러스터, 세포 분류, 차등 발현 및 경로 분석을 위한 내장 도구를 사용하여 단일세포 assay에서 통찰력을 극대화합니다. 표현형 메타데이터로 결과에 주석을 달아 더 풍부한 생물학적 컨텍스트를 제공하고 대화형 2D 및 3D 시각화를 활용하여 비교 분석을 위한 결과를 통합합니다.
액적 기반 시스템과 달리 PIPseq chemistry는 에멀젼 기반 입자 템플릿 인스턴트 파티션(PIP)을 사용하여 개별 세포를 분리하고 바코드를 부여합니다. 이 접근법은 높은 캡처 효율성을 유지하면서 복잡한 미세유체공학 계측장비의 필요성을 제거합니다.
샘플 준비 단계에서 관심 세포 현탁액(cell suspension)이 템플릿 입자 및 오일과 혼합된 후 볼텍싱을 통해 템플릿화된 유화액(emulsion)으로 분리됩니다. 유화액 내 세포가 용해되면, 바코드가 부착된 템플릿이 mRNA를 포획합니다. 포획된 전사물은 cDNA로 역전사되고 단일세포 라이브러리는 Illumina NGS 시스템에서 준비되어 시퀀싱됩니다.
3′ RNA 시퀀싱을 통해Illumina Single Cell Prep (ISCP) T100 kits는 선도적인 단일세포 대체 3'RNA 키트(LSCA)와 동일한 가격으로단일 반응에서 5X 더 많은 세포를 처리할 수 있으므로 연구자들이더 낮은 비용으로 더 고유한 세포 유형을 식별할 수 있습니다.1
Illumina Single Cell 3' RNA Prep은 복잡한 워크플로우나 미세유체공학 기술 없이 단일세포 mRNA 포획, 바코딩, 라이브러리 준비를 가능하게 합니다. Illumina의 시퀀싱 및 인포매틱스 솔루션이 결합되어 있는 Illumina Single Cell 3' RNA Prep은 더 많은 연구실에서 고성능 단일세포 RNA 시퀀싱을 이용할 수 있도록 유연하고 확장 가능한 워크플로우를 제공합니다.
볼텍스 믹서를 사용하여 템플릿화된 유화액을 생성해 단일세포 mRNA를 포획하고 바코드화합니다.
cDNA를 생성하고 시퀀싱을 위한 단일 세포 라이브러리를 준비합니다.
연구 규모에 맞춰 NGS 시스템에서 시퀀스를 구성합니다.
단일세포 데이터를 분석하고 시각화합니다.
조직 준비부터 데이터 분석까지 하나의 리소스에서 전체 단일세포 시퀀싱 워크플로우를 살펴봅니다. 이 33페이지짜리 eBook에는 기술 팁, 워크플로우 인사이트 및 실제 권장 사항이 포함되어 있어 안심하고 계획을 세울 수 있습니다.
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단일세포 시퀀싱 혁신
eBook을 다운로드하여 Illumina Single Cell 3′ RNA Prep chemistry를 살펴보세요. 어떻게 비용을 절감하고 워크플로우를 간소화하며 고품질 라이브러리를 제공하여 조직을 보다 완벽하게 볼 수 있는지 알아보세요.
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Illumina Connected Multiomics로 단일세포 연구 가속화
전단지를 다운로드하여 Illumina Connected Multiomics가 단일세포 연구를 어떻게 확장하는지 알아보세요. Illumina 도구 및 DRAGEN 분석을 통해 멀티오믹스 데이터를 통합하고 세포 관계를 시각화하고 발견을 가속화하세요.
이 온디맨드 웨비나에서 단일세포 바이오인포매틱스의 힘을 살펴보세요. 주요 분석 단계, 세포 타이핑 및 tSNE 및 UMAP와 같은 시각화를 해석하는 방법을 알아보세요.
고처리량 단일세포 CRISPR 프렙으로 유전자 편집이 현실이 되다
AGBT 2025에서 Illumina 과학자들은 개별 세포의 유전자 발현을 조사하기 위한 획기적인 방법을 제시합니다.
정밀도 구현: scRNA-Seq에서 PIPseq V의 힘
이 온디맨드 웨비나는 PIPseq V가 정확하고 접근하기 쉬운 인사이트로 단일세포 시퀀싱을 어떻게 발전시키는지 보여줍니다. 발표자들은 유전체 연구에서 실제 데이터와 새로운 가능성을 공유합니다.
단일세포 RNA-Seq을 사용하면 벌크 샘플링으로 종종 가려지는 세포 차이를 연구할 수 있습니다. 고처리량 및 저처리량 단일세포 시퀀싱 방법에 대해 살펴보세요.
NGS 기술을 사용하는 단일세포 시퀀싱은 개별 암세포의 유전체 또는 전사체를 검사하여 세포 간 변이에 대한 고해상도 보기를 제공합니다.
Illumina 공간 전사체학은 온전한 조직 절편에서 고해상도의 시퀀싱 기반 전장 전사체 분석을 가능하게 합니다.
유전체학, 전사체학, 후성유전학 및 단백체학의 데이터를 결합하여 유전자형과 표현형을 더 잘 연결합니다.
RNA-Seq 라이브러리 프렙 기술의 발전은 전사체 연구에 혁신을 일으키고 있습니다. Illumina의 향상된 RNA 시퀀싱 라이브러리 프렙 포트폴리오는 다양한 시퀀싱 연구에 적용 가능합니다. 이러한 솔루션은 소요 시간을 줄여주고, 다양한 연구에 유연하게 적용할 수 있으며, 규모에 따라 시퀀싱을 조정할 수 있게 해 줍니다.
PIPseq chemistry와 Illumina Single Cell 3' RNA Prep이 어떻게 연구를 가속화할 수 있는지 알아보세요. 전문가와 상담하여 자신의 애플리케이션에 가장 적합한 옵션을 찾아보세요.
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