DRAGEN 2차 분석 파이프라인 및 앱은 WGS, RNA-seq, 엑솜/인리치먼트, 앰플리콘 등 광범위한 NGS 방법을 지원합니다.
DRAGEN 2차 분석은 광범위한 유전체 분석 기능을 위한 애플리케이션 및 파이프라인을 제공합니다. DRAGEN 앱은 BaseSpace Sequence Hub의 클라우드에서 정확하고 효율적이며 안전한 분석을 제공합니다. DRAGEN 파이프라인은 온프레미스 서버를 통해, Illumina Connected Analytics의 클라우드에서, 또는 NovaSeq X 시리즈인 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템 및 MiSeq i100 시리즈에서 온보드로 실행할 수 있는 데이터 분석 도구입니다.
| 애플리케이션 | DRAGEN On-Premises Server | NovaSeq X 시리즈 | NextSeq 1000/2000 | MiSeq i100 시리즈 | BaseSpace Sequence Hub | Illumina Connected Analytics |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BCL Convert | 체크 표시
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| DRAGEN ORA Compression | 체크 표시
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맞춤형만 해당
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| 전장 유전체 | 생식세포 +체세포 | 생식세포 +체세포 | 생식세포만 해당 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | |
| 인리치먼트(엑솜 포함) | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | |
| RNA | 체크 표시
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| TruSight Oncology 500 포트폴리오 | 체크 표시
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| 앰플리콘 | 체크 표시
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DNA만 해당 | 체크 표시
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| Single-Cell RNA | 체크 표시
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| NanoString GeoMx NGS(공간 전사체학) | 체크 표시
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| 메틸레이션 | 체크 표시
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| 단백질 정량화 | 체크 표시
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| 대치 | 체크 표시
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| PGx Star Allele Caller | 체크 표시
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| Illumina Complete Long Reads | 체크 표시
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| VSP, RVEK, RPIP, UPIP | 체크 표시
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Beta | ||
| COVID, IMAP, IMAP-FLU | 체크 표시
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| 메타지노믹스* | 체크 표시
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| 소형 WGS | 체크 표시
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| Heme WGS† | 체크 표시
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| Solid tumor normal WGS | 체크 표시
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*Kmer 분류기에 의해 활성화된 MetLifenomics 애플리케이션. 더 많은 도구가 곧 제공될 예정입니다.
†DRAGEN Application Manager를 통해 이용 가능
Core DRAGEN 버전은 플랫폼에 따라 다릅니다. 자세한 내용은 현지 담당자에게 문의하세요.
BaseSpace Sequence Hub용 TruSight Oncology 500 포트폴리오: Illumina Connected Analytics 구독 필요
애플리케이션의 전체 목록은 BaseSpace 앱 페이지를 참조하십시오.
| 파이프라인 | 설명 | 변이 유형 검출됨a | 메트릭 제공됨 | 간행물 |
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| DRAGEN Demultiplexing | NGS 분석의 신속한 디멀티플렉싱 수행 | |||
| DRAGEN ORA Compression | FASTQ 파일의 높은 압축 비율에 최적화되었으며 신속한 압축 및 압축 해제와 동시에 데이터 무결성 보존 |
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설계 고려 사항 및 방법론 | |
| DRAGEN Map + Align | 독립형 또는 DRAGEN 파이프라인 제품군의 일부로 런 가능 |
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| DRAGEN Germline | 보인자 선별 검사, PGx 등을 위한 표적 콜러, 모자이크 변이 검출, 다중 영역 공동 검출(MRJD)을 통한 새롭게 나타난 변이 발견, Illumina Expansion Hunter를 통한 반복 확장 검출 및 유전형 분석을 포함한 NGS 분석을 제공합니다. |
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| DRAGEN Somatic | 종양 샘플의 체세포 변이를 검출을 위해 설계된 Tumor-only 및 tumor–normal 모드 포함. 두 모드 모두 배수성을 가정하지 않으므로 저빈도 대립유전자 검출 가능 |
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| DRAGEN 인리치먼트 | DRAGEN 생식세포 및 체세포 콜러를 인리치먼트 샘플 분석을 위해 특이적으로 설계된 하나의 파이프라인으로 결합. 전체 인리치먼트 메트릭 및 보고 제품군을 포함 |
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| DRAGEN RNA | 스플라이스 접합부 발견 및 정렬부터 시작하여 신속한 정렬 및 스플라이스 접합부 매핑 및 정량화에 이르는 전사체 분석 수행. (차등 발현의 경우, Illumina는 BaseSpace Sequence Hub의 DRAGEN Differential Expression 앱 추천). |
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| DRAGEN Single Cell RNA | 디멀티플렉싱, 세포 바코드 및 UMI 오류 수정, 시퀀스 정렬 및 유전자 발현 정량화를 수행 |
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| DRAGEN 유전형 결합 분석 | 여러 유전체 전반에 걸쳐 공동으로 변이를 검출하고 가속화된 속도와 타협하지 않은 정확성으로 대규모 샘플 코호트로 확장 |
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대규모 인간 유전체 연구를 위한 하이브리드 클라우드 시스템 |
| DRAGEN Methylation | 정렬 및 메틸 콜링 수행. 정렬 및 메틸레이션 메트릭 계산 |
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| DRAGEN Reference Builder | FASTA 파일 허용 및 DRAGEN 앱이 사용하는 독점적 참조 구축 | |||
| DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA 분석 소프트웨어 | TruSight Oncology 500 ctDNA를 위한 2차 분석 지원 제공. 로컬 DRAGEN Server(버전 3)에서만 사용 가능 |
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cfDNA assay 검증을 위한 혈액 TMB 참조 물질 개발 |
| DRAGEN Imputation | 사용이 용이한 도구로 확장 가능한 로우 패스 전장 유전체 시퀀싱 분석 지원 |
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변이 검출 성능 강화 |
a. SNV, 단일 염기서열 변이, CNV, 복제수 변이, SV, 작은 변이, TMB, 종양 돌연변이 부담, MSI, 현미부수체 불안정성, HLA, 인간 백혈구 항원
신종 코로나바이러스 돌연변이 식별, 전파 추적, SARS-CoV-2 시퀀싱 데이터 분석, 샘플 추적 간소화, 숙주 반응 연구 수행.
엑솜 시퀀싱을 위한 Illumina DNA Prep with Enrichment와 DRAGEN의 분석 역량을 결합하면 FFPE 종양 샘플의 효율적이며 정확한 변이 분석이 가능합니다.
엑솜 시퀀싱을 위한 Illumina DNA Prep with Enrichment와 DRAGEN의 분석 역량을 결합하면 FFPE 종양 샘플의 효율적이며 정확한 변이 분석이 가능합니다.
NanoString GeoMx DSP와 입증된 Illumina 시퀀싱을 결합하면 높은 plexity의 공간 분석과 유전자 및 단백질 프로파일링에 필요한 조직 구조에 관한 정보를 제공합니다.
DRAGEN 분석 기능에 대한 자세한 내용을 확인하고, 주문하는 방법에 대해 알아보고, 제품 관련 문서를 찾아보세요. 또한 전문가와 상담하여 질문에 대한 답을 얻을 수 있습니다.
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