WGS, RNA-seq, 엑솜/인리치먼트, 앰플리콘, 16S 메타지노믹스 등 광범위한 NGS 방법 지원
DRAGEN 2차 분석은 광범위한 유전체 분석 기능을 위한 애플리케이션 및 파이프라인을 제공합니다. DRAGEN 앱은 BaseSpace Sequence Hub의 클라우드에서 정확하고 효율적이며 안전한 분석을 제공합니다. DRAGEN 파이프라인은 온프레미스 서버를 통해, Illumina Connected Analytics의 클라우드에서, 또는 NextSeq 1000 및 NextSeq 2000 시스템 및 NovaSeq X 시리즈에서 온보드로 실행할 수 있는 데이터 분석 도구입니다.
| 신청 | DRAGEN On-Premises Server | NovaSeq X 시리즈 | NextSeq 1000/2000 | MiSeq i100 시리즈 | BaseSpace Sequence Hub | Illumina Connected Analytics |
|---|---|---|---|---|---|---|
| BCL Convert | checkmark
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맞춤형만 해당
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| DRAGEN ORA Compression | checkmark
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맞춤형만 해당
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| DRAGEN FASTQ + MultiQC | checkmark
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Library QC 앱에서 지원
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| Whole genome | 생식세포 +체세포 | 생식세포 +체세포 | 생식세포만 해당 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | |
| 인리치먼트(엑솜 포함) | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | 생식세포 + 체세포 | |
| DRAGEN Amplicon | checkmark
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DNA만 해당 | checkmark
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| RNA | checkmark
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| Single-Cell RNA | checkmark
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| NanoString GeoMx NGS(공간 전사체학) | checkmark
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| 메틸레이션 | checkmark
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| 메타지노믹스 | checkmark
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| COVID, IMAP, IMAP-FLU | checkmark
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| TruSight Oncology 500 포트폴리오 | checkmark
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| ScATAC-Seq(전위효소 접근 가능 크로마틴에 대한 단일세포 시퀀싱 assay) | checkmark
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| 대치(imputation) | checkmark
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| PGx Star Allele Caller | checkmark
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| Illumina Complete Long Read | checkmark
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| VSP, RVEK, RPIP, UPIP | checkmark
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Beta | ||
| 소형 WGS | checkmark
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*Kmer 분류기에 의해 활성화된 MetLifenomics 애플리케이션. 더 많은 도구가 곧 제공될 예정입니다.
BaseSpace Sequence Hub를 위한 TruSight Oncology 500 포트폴리오: Illumina Connected Analytics 구독 필요
| 파이프라인 | 설명 | 변이 유형 검출됨a | 메트릭 제공됨 | 간행물 |
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| DRAGEN Demultiplexing | NGS 분석의 신속한 디멀티플렉싱 수행 | |||
| DRAGEN ORA Compression | FASTQ 파일의 높은 압축 비율에 최적화되었으며 신속한 압축 및 압축 해제와 동시에 데이터 무결성 보존 |
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설계 고려 사항 및 방법론 | |
| DRAGEN Map + Align | 독립형 또는 일부로 런 가능 |
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| DRAGEN Germline | Illumina Expansion Hunter를 통해 향상된 정확성 및 반복 확장 검출 및 유전형 분석을 위한 고급 오류 모델 교정 등의 NGS 분석 제공 |
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| DRAGEN Somatic | 종양 샘플의 체세포 변이를 검출을 위해 설계된 Tumor-only 및 tumor–normal 모드 포함. 두 모드 모두 배수성을 가정하지 않으므로 저빈도 대립유전자 검출 가능 |
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| DRAGEN Enrichment | DRAGEN 생식세포 및 체세포 콜러를 인리치먼트 샘플 분석을 위해 특이적으로 설계된 하나의 파이프라인으로 결합. 전체 인리치먼트 메트릭 및 보고 제품군을 포함 |
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| DRAGEN RNA | 스플라이스 접합부 발견 및 정렬부터 시작하여 신속한 정렬 및 스플라이스 접합부 매핑 및 정량화에 이르는 전사체 분석 수행. (차등 발현의 경우, Illumina는 BaseSpace Sequence Hub의 DRAGEN Differential Expression 앱 추천). |
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| DRAGEN Single Cell RNA | 디멀티플렉싱, 세포 바코드 및 UMI 오류 수정, 시퀀스 정렬 및 유전자 발현 정량화를 수행 |
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| DRAGEN 유전형 결합 분석 | 여러 유전체 전반에 걸쳐 공동으로 변이를 검출하고 가속화된 속도와 타협하지 않은 정확성으로 대규모 샘플 코호트로 확장 |
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대규모 인간 유전체 연구를 위한 하이브리드 클라우드 시스템 |
| DRAGEN Methylation | 정렬 및 메틸 콜링 수행. 정렬 및 메틸레이션 메트릭 계산 |
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| DRAGEN Reference Builder | FASTA 파일 허용 및 DRAGEN 앱이 사용하는 독점적 참조 구축 | |||
| DRAGEN TruSight Oncology 500 ctDNA 분석 소프트웨어 | TruSight Oncology 500 ctDNA를 위한 2차 분석 지원 제공. 로컬 DRAGEN Server(버전 3)에서만 사용 가능 |
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cfDNA assay 검증을 위한 혈액 TMB 참조 물질 개발 |
| DRAGEN Imputation | 사용이 용이한 도구로 확장 가능한 로우 패스 전장 유전체 시퀀싱 분석 지원 |
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변이 검출 성능 강화 |
a. SNV, 단일 염기서열 변이, CNV, 복제수 변이, SV, 작은 변이, TMB, 종양 돌연변이 부담, MSI, 현미부수체 불안정성, HLA, 인간 백혈구 항원
이 솔루션에서는 돌연변이 검출, 새로운 변이 식별, COVID-19 숙주 반응 연구, 공유 데이터베이스에 결과 제공이 가능합니다.
엑솜 시퀀싱을 위한 Illumina DNA Prep with Enrichment와 DRAGEN의 분석 역량을 결합하면 FFPE 종양 샘플의 효율적이며 정확한 변이 분석이 가능합니다.
엑솜 시퀀싱을 위한 Illumina DNA Prep with Enrichment와 DRAGEN의 분석 역량을 결합하면 FFPE 종양 샘플의 효율적이며 정확한 변이 분석이 가능합니다.
NanoString GeoMx DSP와 입증된 Illumina 시퀀싱을 결합하면 높은 plexity의 공간 분석과 유전자 및 단백질 프로파일링에 필요한 조직 구조에 관한 정보를 제공합니다.
DRAGEN 분석 기능에 대한 자세한 내용을 확인하고, 주문하는 방법에 대해 알아보고, 제품 관련 문서를 찾아보세요. 또한 전문가와 상담하여 질문에 대한 답을 얻을 수 있습니다.
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