DRAGEN 2차 분석 온프레미스 서버

견고하고 신뢰할 수 있는 온프레미스 솔루션으로 분석 성과 극대화

포괄적이고 효율적인 로컬 2차 분석

DRAGEN Server는 기존의 CPU 기반 시스템에 비해 아주 짧은 시간 내에 매우 정확하고 포괄적인 2차 분석을 위한 온프레미스 솔루션을 제공합니다.

FPGA(현장 프로그래밍 가능 게이트 어레이) 기술로 구동되어 BCL 전환, 매핑 및 정렬, 분류, 중복 마킹 및 일배체형 변이 검출과 같은 유전체 분석 알고리즘을 가속화합니다.

최적화된 소프트웨어 알고리즘으로 설계된 DRAGEN 파이프라인은 지속적으로 개선되어 기능, 정확성 및 속도를 향상시키며, 긴 컴퓨팅 시간 및 방대한 데이터 볼륨과 같은 일반적인 NGS 분석 문제를 해결합니다.

Illumina DRAGEN server

DRAGEN On-Premises Server 특징

뛰어난 정확성 및 포괄성

  • Precision FDA Truth Challenge v2 벤치마크 데이터를 사용한 99.89%의 정밀도 점수.4
  • 광범위한 실험 유형을 지원하고 최대 30개의 기존 오픈 소스 도구를 대체.2,3
  • Illumina Connected Annotations를 통해 PrimateAI-3D, SpliceAI, COSMIC, OMIM 등 17개의 주요 데이터베이스를 통합하여 포괄적인 유전체 변이 인사이트를 확보.

통제 가능한 보안을 갖춘 로컬 분석

  • 안전한 고품질 분석을 위한 정기적인 업데이트가 제공되는 신뢰할 수 있는 로컬 솔루션.
  • 내장된 데이터 보호를 위한 최첨단 보안 솔루션.*
  • 네트워크 결합 스토리지(NAS)를 통해 여러 시퀀서를 지원하여 네트워크 연결성이 좋지 않은 지역이나 오프라인 환경에서도 안정적인 액세스를 보장.

하드웨어 가속화를 통한 효율성

  • DRAGEN Server는 FPGA 아키텍처를 기반으로 초고속 처리를 제공하며 빠른 총 소요 시간을 지원함(예: 40× 커버리지에서 작은 변이 콜의 경우 약 26분).1
  • DRAGEN 무손실 ORA 압축으로 FASTQ 파일 크기를 최대 1/5로 축소.
  • 에너지 효율성이 뛰어나 30× 전장 유전체 시퀀싱(WGS) 런의 2차 분석에 0.12 kWh 미만을 사용.2

DRAGEN Server로 시퀀싱 워크플로우 최적화

다양한 유형의 검사실에서 규모를 확장하거나 운영 효율성을 개선하기 위해 DRAGEN Server를 통합하고 있습니다. 이 예시의 온프레미스 워크플로우는 기기 연결, 선택적 워크플로우 스케줄러, 분석 및 해석을 간략히 설명합니다.

1
라이브러리 준비

고성능 Library Prep Kit를 사용하여 WGS, WES 및 패널을 포함한 다양한 애플리케이션을 위한 라이브러리를 준비합니다.

2
시퀀싱

원하는 Illumina 시퀀싱 플랫폼을 사용하여 라이브러리를 시퀀싱합니다.

3
2차 분석

DRAGEN 2차 분석은 전장 유전체, 엑솜, 메틸롬 및 전사체를 분석할 수 있습니다.

4
3차 분석

사양

DRAGEN server specifications

DRAGEN Server 사양

  • CPU
    Dual Intel Xeon Gold 6226R 2.9 GHz, 16C / 32T
  • 시스템 메모리
    512 GB DDR4
  • 스크래치 드라이브
    2 x 7.68 TB NVMe U.2 SSD
  • OS 드라이브
    2 x 480 GB SSD(RAID 1)
  • 하드웨어 가속
    1x FPGA 카드
  • 폼 팩터
    2U
  • 규격

    넓이 × 깊이 × 높이
    43.8 cm × 76.4 cm × 8.8 cm

    (17.2 in × 29.9 in × 3.5 in)
축소판

용이한 설치 및 보안

설치하기 쉽게 설계된 표준 2U 폼 팩터는 업계 표준 서버 랙과의 호환성을 보장합니다. 독립형 로컬 DRAGEN Server로 보안 및 기관의 정책 준수를 우선시할 수 있습니다. 또한 네트워크 결합 스토리지를 통해 여러 시퀀서의 데이터를 지원할 수 있습니다.

자주 묻는 질문

DRAGEN Server는 DRAGEN 소프트웨어와 함께 제공됩니다. 그러나 초기 설정 중에 https://support.illumina.com/sequencing/sequencing_software/dragen-bio-it-platform/downloads.html에서 제공되는 최신 버전의 DRAGEN 소프트웨어로 업데이트할 수도 있습니다.

각 DRAGEN Server에서 2차 분석을 수행하기 위해서는 연간 소프트웨어 라이선스가 필요합니다. 처리량과 분석할 데이터의 양에 따라 선택할 수 있는 여러 옵션이 있습니다. 1년 동안 DRAGEN Server 100,000 GB의 처리량을 지원하는 레벨 1 라이선스로 시작합니다.

예, 오프라인으로 DRAGEN Server를 실행할 수 있습니다. 다른 컴퓨터에서 소프트웨어 업데이트 및 DRAGEN 소프트웨어 라이선스 파일을 다운로드하여 설치한 후 로컬에서 서버에 로드해야 할 수도 있습니다.

DRAGEN Server에 샘플 데이터를 보관하지 않는 것이 바람직합니다.  이것은 컴퓨팅 노드입니다.  네트워크 결합 스토리지를 장착하는 것이 좋습니다. DRAGEN Server는 스토리지를 장착하기 위한 NFS 및 CIFS 프로토콜을 지원합니다.

예, DRAGEN 2차 분석을 포함하도록 작업 예약 소프트웨어(예: SLURM)를 업데이트할 수 있습니다.

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연구자들이 온프레미스 서버를 통해, 클라우드에서, 또는 기기 내에서 DRAGEN 분석을 이용할 수 있도록 지원하는 유연한 구성에 대해 알아보세요.

주요 DRAGEN 앱 및 가용성

DRAGEN 앱은 WGS, RNA-seq, 엑솜/인리치먼트, 앰플리콘, 16S 메타지노믹스 등 광범위한 NGS 방법을 지원합니다.

모든 바이오인포매틱스 소프트웨어 제품

접근이 용이하고 맞춤화 가능한 Illumina의 바이오인포매틱스 소프트웨어 솔루션은 데이터 요구 사항을 충족하려는 목적으로 딥 시퀀싱 기기 통합 및 효율적인 생산 규모 확장을 위해 구축되었습니다.

더 알아보기 또는 문의하기

DRAGEN 분석 기능에 대한 자세한 내용을 확인하고, 주문하는 방법에 대해 알아보고, 제품 관련 문서를 찾아보세요. 또한 전문가와 상담하여 질문에 대한 답을 얻을 수 있습니다.

* 하드웨어 기반 키 보호로 뒷받침되는 전체 디스크 암호화 사용.

참고 문헌

  1. Illumina data on file, without new specialized callers like MRJD and VNTR available in DRAGEN v4.3
  2. Illumina. Inside DRAGEN and what enables efficient secondary analysis at scale.illumina.com/ko-kr/science/genomics-research/articles/secondary-analysis-at-scale.html
  3. Data calculations on file. Illumina, Inc. 2022
  4. Behera S, Catreux S, Rossi M, et al. Comprehensive and accurate genome analysis at scale using DRAGEN accelerated algorithms. bioRxiv [Preprint]. 2024 Jan 6:2024.01.02.573821. doi: 10.1101/2024.01.02.573821. PMID: 38260545; PMCID: PMC10802302.