Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment

저입력 샘플을 지원하는 빠르고 유연하며 확장 가능한 인간 전장 엑솜 시퀀싱 솔루션.

~10 hr

Assay 시간

~4시간

수작업 시간

40 ng FFPE

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 FFPE(포르말린 고정, 파라핀 포매) 샘플에서 저주파 변이를 검출하기 위한 종양-정상 워크플로우를 제공하는 민감하고 포괄적인 전장 엑솜 시퀀싱 솔루션입니다.

워크플로우에는 오류 수정 및 위양성 감소를 위한 고유한 분자 식별자(UMI)가 포함되어 있어 저빈도 돌연변이를 정확하게 검출할 수 있습니다.

주요 기능

  • 종양-정상 워크플로우를 위한 포괄적인 엑솜 커버리지

  • 자동화를 지원하는 충전량을 갖춘 간소화된 샘플-인사이트 워크플로우

  • 저빈도 돌연변이의 정확한 검출

고성능 라이브러리 준비

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 단일 뉴클레오티드 변이(SNV), 인델 및 복제수 변이(CNV)를 포함한 저주파 변이를 검출합니다. 이 키트는 90%가 넘는 변이 리콜을 통해 단 40 ng FFPE DNA에서 5%의 낮은 대립유전자 빈도로 작은 변이를 식별합니다. Twist Biosciences for Illumina Exome 2.5 Panel 콘텐츠에는 종양 돌연변이 부담(TMB), 현미부수체 불안정성(MSI) 및 상동성 재조합 결핍(HRD)에 대한 생체표지자가 포함됩니다.

간소화된 샘플-인사이트 워크플로우

이 키트는 종양 및 상응하는 정상 샘플의 FFPE DNA로 시작하는 통합된 워크플로우의 일부입니다. Illumina 시퀀싱 후, DRAGEN Somatic 앱을 사용하여 매우 정확한 변이 검출을 획득하세요.

빠르고 확장 가능

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 약 10시간 내에 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하기 위한 빠른 하이브리드 캡처 워크플로우를 제공하며, 수작업 시간은 4시간에 불과합니다. 연구자들은 추출된 FFPE DNA를 하루 안에 시퀀싱할 수 있습니다. 권장 리드 길이(read length)는 2 × 151 bp입니다.

집중적이고 포괄적인 커버리지

이 키트는 시퀀싱 결과를 최대화하여 집중적이고 포괄적이며 최신의 패널을 사용하여 엑솜을 철저히 커버할 수 있습니다.

미토콘드리아 및 맞춤형 스파이크인 인리치먼트 옵션

Illumina custom v2 probes는 최대 10,000개의 프로브가 있는 스파이크인 패널을 사용하여 미토콘드리아 유전체 커버리지 또는 관심 영역을 추가하기 쉽게 만듭니다.

cfDNA 및 FFPE 샘플에 대한 동일한 워크플로우

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 Illumina Cell-Free DNA with Enrichment와 동일한 라이브러리 준비 및 인리치먼트 chemistry가 특징이므로 FFPE 샘플에서 탁월한 성능을 발휘할 수 있습니다.

사양

애플리케이션

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 FFPE DNA를 포함한 저입력 샘플을 지원하는 간소화되고 포괄적인 샘플 대 인사이트 전장 엑솜 시퀀싱 솔루션입니다.

워크플로우 예시

문서

제품 관련 자료

비교하기

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment TruSight Oncology 500 Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment
Assay time ~10 hr 6.5시간 검체에서 결과까지 4~5일 약 8.5~9.5시간
암 종류 고형암 전체 고형암, 고형암
Description A fast and easy-to-use library prep with an enrichment tumor–normal workflow for accurate and comprehensive whole-exome sequencing and reliable detection of low-frequency mutations from FFPE samples. 비용 효율적이고 안정적인 인간 전장 엑솜 시퀀싱을 위한 최신 엑솜 콘텐츠의 집중 인리치먼트 프로브 패널을 사용하는 인리치먼트 워크플로우가 포함된 빠르고 사용하기 쉬운 라이브러리 준비입니다. FFPE 조직에서 종합적인 유전체 프로파일링을 가능하게 하고 NextSeq 550 시스템 또는 NextSeq 550Dx 기기(연구 모드)에서 실행되며 한 번에 최대 8개의 검체를 배치화할 수 있는 분석.
수작업 시간 ~4시간 ~2시간 자동화된 워크플로우의 경우 ~2.5시간.
수동 워크플로의 경우 ~10.5시간.
약 2.5~3시간
Input quantity 40 ng FFPE DNA 고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인) 40 ng DNA 및/또는 40 ng RNA 세포유리 DNA 10~30 ng
기기 NextSeq 2000 시스템, NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NextSeq 500 시스템 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템
방법 엑솜 시퀀싱 표적 DNA 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 커스텀 시퀀싱, 표적 인리치먼트
핵산 종류 DNA DNA DNA, RNA DNA
특수 샘플의 종류 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 혈액, 타액 FFPE 조직 세포유리 DNA
종 카테고리 인간 인간 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 체세포 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 유전자 융합, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV), 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 새로운 전사물, 단일 염기 다형성(SNP), 구조적 변이 유전자 융합, 체세포 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

선택 도구:

필수 제품

Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment에는 라이브러리 준비와 인리치먼트 시약이 포함됩니다. 인리치먼트 프로브 패널과 인덱스 어댑터는 Illumina를 통해 별도로 판매됩니다(아래 참조).

DRAGEN Enrichment 및 Somatic에 대한 2차 데이터를 분석하려면 다음이 필요합니다.

  • 로컬 분석을 위한 DRAGEN 서버 라이선스, 또는
  • 클라우드 분석을 위한 Illumina Connected Analytics 및 iCredit 구독, 또는
  • 클라우드 분석을 위한 BaseSpace Sequence Hub 및 iCredits 구독
  • Illumina UMI DNA/RNA UD v3 인덱스 세트 A 및 B

Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel은 전장 Exome Panel입니다.

Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel은 미토콘드리아 DNA 변이의 인리치먼트 및 시퀀싱을 가능하게 하는 선택적 고정 함량 스파이크인 패널입니다.

Illumina Custom Enrichment Panel v2는 DesignStudio Assay Design Tool을 사용하거나 Illumina Concierge 디자인 팀과 함께 스파이크인 패널로 사용할 수 있습니다.

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라이브러리 프렙 (5)

Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (16 Samples)

20104105

Includes ligation-based library prep for preparation of 16 libraries with Illumina Qualified Automation Methods, or 24 libraries manually. Enrichment reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment App on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (96 Samples)

20104106

Includes ligation-based library prep for preparation of 96 libraries with Illumina Qualified Automation Methods, or 120 libraries manually. Enrichment reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment App on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Enrichment (16 Reactions)

20104107

Includes fast enrichment reagents for enrichment of Illumina Cell-Free and FFPE DNA Prep libraries for a total of 16 reactions with Illumina Qualified Automation Methods, or 24 reactions manually. Library preparation reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Cell-Free DNA: 1-4 samples per reaction during enrichment. Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charge. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: 4 samples per Whole Exome enrichment. Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), Cloud Analysis

20104103

Includes ligation based library prep and fast enrichment reagents for preparation of 192 libraries using Illumina Qualified Automation Methods, or 240 libraries manually, using 4-plex enrichment (pooling of 4 libraries in a single enrichment reaction). UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Enrichment panel not included.  Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), On-premises

20104104

Includes ligation based library prep and fast enrichment reagents for preparation of 192 libraries using Illumina Qualified Automation Methods, or 240 libraries manually, using 4-plex enrichment (pooling of 4 libraries in a single enrichment reaction). UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Enrichment panel not included.10,000 Gb, 1 yr DRAGEN Server License included. Illumina DRAGEN v4 Server required for Cell- free DNA analysis.

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패널 (5)

Twist Bioscience® for Illumina Exome 2.5 Panel

20076914

Twist Bioscience for Illumina Exome 2.5 Panel provides 68 µl of material. When paired with Illumina FFPE DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, this volume is sufficient for 20 enrichment reactions at 4- plex for manual workflow. Available by quote only, panel must be sold with library prep reagents. Request pricing for more details.

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Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel

20093180

Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel, 96개 샘플에 대한 시약 32 ul(8개의 하이브리드화 반응과 반응당 12개 샘플)가 포함되어 있습니다. 이 패널은 인간 엑솜과 전장 유전체 라이브러리의 미토콘드리아 DNA를 결합하여 인리치먼트하기 위해 Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment Kit의 Exome 2.0 Plus Panel과 함께 사용할 수 있습니다. Mitochondrial Panel은 Exome 2.0 Plus Panel 제품의 액세서리로 판매됩니다.

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Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)

20073953

Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 32 µl of material (sufficient for 8 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.

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Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)

20073952

Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 384 µl of material (sufficient for 96 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.

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Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)

20111339

Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 1536 µl of material (sufficient for 384 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.

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액세서리 제품 (6)

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034701

UMI DNA 인덱스 앵커(플레이트 = 20031416, 박스 = 20032620) + Nextera 호환 고유 이중 인덱스 A(판매 키트 = 20027213, 플레이트 = 20025019, 박스 = 20026121)

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IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034702

Illumina UMI DNA 인덱스 앵커 세트 B용 IDT

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IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation

20066404

Illumina - UMI DNA/RNA UD 인덱스용 96 IDT 상자 1개 96개 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 자동화용 세트 A 및 Illumina - UMI DNA 인덱스 앵커용 96 IDT 상자 1개가 포함됩니다.

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IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation

20063213

Illumina - UMI DNA/RNA UD 인덱스용 96 IDT 1박스 자동화용 세트 B는 96개 샘플에 라벨을 부착하기에 충분하며 Illumina - UMI DNA 인덱스 앵커용 96 IDT 1박스가 포함되어 있습니다.

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Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set A, Ligation (96 indexes, 96 Samples)

20126235

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set A sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.

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Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set B, Ligation (96 indexes, 96 Samples)

20126237

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set B sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.

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선택 품목 요약

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

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