NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학 및 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 인간 전장 엑솜 시퀀싱(WES)을 위한 비용 효율적이고 안정적인 솔루션을 제공합니다. 이 키트는 다음을 제공합니다.
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
종합적인 최신 엑솜 농축 패널을 포함하는 빠르고 신뢰할 수 있는 고성능 인간 전엑솜 염기서열분석 솔루션입니다.
개요
단일 벤더의 간소화된 워크플로우 솔루션
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, 세척/크기 선택 비드 및 인덱스를 포함하는 전장 엑솜 시퀀싱 키트입니다. 키트에는 또한 Illumina Exome 패널보다 작고 공공 데이터베이스에 보고된 변형에 대한 개선된 표적 영역 범위를 갖는 Illumina Exome 2.5 패널용 Twist Bioscience가 포함되어 있습니다. 또한, 스파이크인 패널로 미토콘드리아 유전체 커버리지를 쉽게 추가할 수 있다.
이 제품은 Illumina Advantage(TG) 제품으로도 제공됩니다. Illumina Advantage 대규모 시퀀싱 제품은 로트별 배송 및 검사, 연장된 유통 기한, 더 큰 검사실 효율성을 위한 고급 변경 사항 알림을 특징으로 합니다.
사양
| Assay 시간 | 6.5시간 |
|---|---|
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 |
37.5 Mb 코딩 콘텐츠(≥ 99%의 RefSeq, CCDS, ClinVar 및 ACMG 병원체/병원체일 가능성이 있는 변이, COSMIC 암 유전자 센서스), OMIM |
| 설명 | 비용 효율적이고 안정적인 인간 전장 엑솜 시퀀싱을 위한 최신 엑솜 콘텐츠의 집중 인리치먼트 프로브 패널을 사용하는 인리치먼트 워크플로우가 포함된 빠르고 사용하기 쉬운 라이브러리 준비입니다. |
| 수작업 시간 | ~2시간 |
| 사용량 | 고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인) |
| Instruments | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 작용 기전 | BLT(Bead-Linked Transposome) 및 하이브리드 캡처 chemistry |
| 방법 | Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment |
| 멀티플렉싱 | 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. 키트 구성은 최대 192개 샘플의 멀티플렉싱을 지원합니다. 최대 384개가 가능합니다. |
| Nucleic acid type | DNA |
| 표적적중 리드 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 약 90% |
| 특수 샘플의 종류 | Blood, Saliva |
| Species category | Human |
| Technology | Sequencing |
| 균일성 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 ≥ 91%(5 Gb의 경우 20× 기준 % 커버리지) |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
필수 제품
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 증균 키트에는 라이브러리 준비, 증균, 증균 프로브 패널, 정제 비드 및 인덱스 어댑터 시약이 포함되어 있습니다. 원하는 경우 다른 인덱스 세트를 선택합니다.
직접 혈액을 주입하려면 Flex Lysis Reagent Kit가 필요합니다.
Infinium MIDI 히트블록 인서트는 SciGene HybEx 마이크로히팅 시스템에 적합하며 증균 단계에 필요합니다.
/
결과
애플리케이션
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 빠르고 포괄적인 엔드 투 엔드 전엑솜 시퀀싱 솔루션으로, 샘플부터 보고까지 지원합니다.
예시 워크플로우
준비
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment
프로젝트 권장 사항
| 기기 | Recommended number of samples | Read length |
|---|---|---|
| NextSeq 2000 System | Samples per run (by flow cell type): P2: 19, P3: 57 (based on 50× mean target coverage, 42M reads, 4.2 Gb of data) |
2 × 101 bp |
| NovaSeq 6000 System | Samples per run by flow cell type: SP: 34, S1: 69, S2: 176, S4: 428 based on 50× mean target coverage, 42M reads, 4.2 Gb of data. Note: S4: 428 requires NovaSeq Xp workflow or additional indexes. |
2 × 101 bp |
관련 애플리케이션 및 방법
전장 엑솜 시퀀싱(whole-exome sequencing, WES)은 유전체의 단백질 코딩 영역을 조사하여 질환이나 인구집단 건강 상태에 유전체가 미치는 영향을 밝히는 데 사용됩니다.
Comprehensive array and next-generation sequencing solutions to accelerate research of various genetic complex diseases.
Our sequencing and microarray technologies support a broad range of cancer genomics research applications, from DNA to RNA analysis, epigenetics, and more.
문서
제품 관련 자료
비교하기
| Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment | Illumina DNA Prep with Enrichment | |
|---|---|---|
| Assay 시간 | 6.5시간 | ~6.5시간 |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 콘텐츠 사양 |
37.5 Mb 코딩 콘텐츠(≥ 99%의 RefSeq, CCDS, ClinVar 및 ACMG 병원체/병원체일 가능성이 있는 변이, COSMIC 암 유전자 센서스), OMIM |
엑솜: 45 Mb 엑손 콘텐츠(RefSeq, CCDS 및 Ensembl 코딩 콘텐츠의 ≥98%). 맞춤형: 관심 유전체 콘텐츠 0.5~15 Mb. 고정 패널: 콘텐츠는 패널에 따라 다릅니다. |
| 설명 | 비용 효율적이고 안정적인 인간 전장 엑솜 시퀀싱을 위한 최신 엑솜 콘텐츠의 집중 인리치먼트 프로브 패널을 사용하는 인리치먼트 워크플로우가 포함된 빠르고 사용하기 쉬운 라이브러리 준비입니다. |
전체 엑솜, 맞춤형 및 고정 패널 표적 시퀀싱을 포함한 다양한 실험을 위한 시퀀싱 라이브러리를 낮은 DNA 입력 및 다양한 샘플 유형으로부터 약 6.5시간 내에 준비합니다. |
| 수작업 시간 | ~2시간 | ~2시간, ~2시간 |
| 사용량 | 고품질 genomic DNA 50~1,000 ng(직접 혈액 및 타액의 경우, 참조 가이드 확인) | 고품질 genomic DNA 10~1,000 ng, FFPE DNA 50~1,000 ng. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인). |
| Instruments | NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, NextSeq 1000 System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System | MiSeq System, iSeq 100 System, NextSeq 550 System, NextSeq 2000 System, MiSeqDx in Research Mode, MiniSeq System, NextSeq 550Dx in Research Mode, NovaSeq X System, NovaSeq 6000Dx in Research Mode, NovaSeq 6000 System, NovaSeq X Plus System |
| 작용 기전 | BLT(Bead-Linked Transposome) 및 하이브리드 캡처 chemistry | 비드 결합 트랜스포좀 및 하이브리드 캡처 chemistry |
| 방법 | Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment | Custom sequencing, Targeted DNA sequencing, Exome sequencing, Target enrichment |
| 멀티플렉싱 | 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. 키트 구성은 최대 192개 샘플의 멀티플렉싱을 지원합니다. 최대 384개가 가능합니다. | 최대 384개의 사용 가능한 고유한 듀얼 인덱스. 최대 12플렉스의 사전 인리치먼트 풀링이 테스트됩니다. |
| Nucleic acid type | DNA | DNA |
| 표적적중 리드 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 약 90% | 엑솜 패널의 경우 ≥85%(예시 데이터 세트의 결과, 실제 성능은 다를 수 있음) |
| 특수 샘플의 종류 | Blood, Saliva | Blood, Low-Input Samples, FFPE Tissue, Saliva |
| Species category | Human | Other, Human |
| Technology | Sequencing | Sequencing |
| 균일성 | 내부 테스트의 평균 성능을 기준으로 ≥ 91%(5 Gb의 경우 20× 기준 % 커버리지) | ≥90%(4 Gb의 경우 20x 기준 % 커버리지, Exome Panel의 경우) |
| 변이 클래스 | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) | Single nucleotide polymorphisms (SNPs), Loss of heterozygosity (LOH), Somatic variants, Germline variants, Insertions-deletions (indels), Copy number variants (CNVs) |
선택 도구:
Library Prep and Array Kit Selector
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그림 자료
Exome 2.5 패널의 성능 향상
라이브러리를 1.5시간 또는 16시간 혼성화 시간을 갖는 포함된 엑솜 2.5 패널 또는 1.5시간 혼성화 시간을 갖는 Illumina 엑솜 패널(IEP, 20020183) 중 하나를 갖는 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 증균을 사용하여 구성하고 증균시켰다. 농축된 라이브러리를 NovaSeq 6000 시스템에서 시퀀싱하고 DRAGEN 농축 앱을 사용하여 분석하였다.
silico에서 높은 데이터베이스 목표 커버리지 비율
엑솜 2.5 패널 및 엑솜 패널에 대한 베드 파일을 열거된 공개 데이터베이스와 비교하고 중첩 백분율을 결정하여 보고했다.
공공 데이터베이스에서 질병 관련 변이에 대한 탁월한 커버리지
1.5시간(주황색) 또는 16시간(파란색)의 혼성화 시간을 사용한 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment는 공공 데이터베이스의 표적의 ≥ 20×에서 높은 평균 커버리지 백분율을 보여줍니다.
리소스
엑솜 키트 (2)
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set B (96 Samples, 12-plex)
20077595
Illumina DNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 증균 시약, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel, Illumina Purification Beads 및 IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B, 96개 라이브러리의 전장 엑솜 증균을 위한 Tagmentation(8개, 12-plex 증균 반응)을 포함합니다.
List Price:
Discounts:
Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment, (S) Tagmentation Set D (96 Samples, 12-plex)
20077596
Illumina DNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 증균 시약, Twist Bioscience for Illumina Exome 2.0 Plus Panel, Illumina Purification Beads 및 IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set D, 96개 라이브러리의 전장 엑솜 증균을 위한 Tagmentation(8개, 12-plex 증균 반응)이 포함됩니다.
List Price:
Discounts:
패널 (1)
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel
20093180
Twist Bioscience for Illumina Mitochondrial Panel, 96개 샘플에 대한 시약 32 ul(8개의 하이브리드화 반응과 반응당 12개 샘플)가 포함되어 있습니다. 이 패널은 인간 엑솜과 전장 유전체 라이브러리의 미토콘드리아 DNA를 결합하여 인리치먼트하기 위해 Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment Kit의 Exome 2.0 Plus Panel과 함께 사용할 수 있습니다. Mitochondrial Panel은 Exome 2.0 Plus Panel 제품의 액세서리로 판매됩니다.
List Price:
Discounts:
액세서리 제품 (8)
Flex Lysis Reagent Kit (96 reactions)
20018706
Illumina DNA Prep 및 Illumina DNA Prep with Enrichment로 혈액 검체를 처리하기 위한 시약이 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비, 증균, 증균 프로브 패널 및 인덱스 어댑터 시약을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091654
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091656
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091658
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)
20091660
Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.
List Price:
Discounts:
Infinium MIDI Heatblock Insert
BD-60-601
Nextera Flex for Enrichment 하이브리드 단계에 필요한 SciGene Hybex Microheating 시스템용 Heatblock 단편(insert).
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 100mL
20060057
라이브러리 정리 및 크기 선택을 위한 비드 100ml 컨테이너 1개가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약, 프로브 패널 및 색인을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
Illumina Purification Bead, 400mL
20060058
라이브러리 정리 및 크기 선택을 위한 비드 100ml 컨테이너 4개가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 증균 시약, 프로브 패널 및 색인을 별도로 구입합니다.
List Price:
Discounts:
표시 /
선택 품목 요약
제품
수량
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요약
제품
카탈로그 ID
수량
단가
-
카탈로그 ID:수량:
FAQ
예, 10~49 ng의 gDNA 입력을 사용할 수 있습니다. 그러나, 본 프로토콜은 최종 사전-증균 라이브러리 수율을 < 50 ng으로 정규화하지 않으며, 따라서 농축 전과 후에 라이브러리의 정량화 및 정규화가 요구된다.
이 프로토콜은 EDTA 채취 튜브에 채취한 신선 혈액으로 검증되었습니다. 다른 항응고제를 사용할 수 있지만 이 키트를 사용할 때 보장되지는 않습니다.
본 프로토콜은 Oragene DNA 타액 채취 튜브에만 채취된 타액에 대해 검증되었습니다.
Illumina 미토콘드리아 패널용 Twist Bioscience는 미토콘드리아 유전체(chrM)의 16,659개 염기쌍(bp)과 37개 유전자를 덮도록 설계된 선택적 고정 콘텐츠 패널로, 미토콘드리아 DNA(mtDNA) 변이체의 농축과 염기서열분석을 가능하게 한다. Exome 2.5 Enrichment 프로토콜에서 이 패널을 스파이크 인 패널로 사용하고 실험에 ChrM 범위를 추가합니다.
이전에 Illumina DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment라고 알려진 제품을 이제 Illumina DNA Prep with Exome 2.5 Enrichment(카탈로그 번호 20077595 및 20077596)라는 이름으로 선보입니다. 엑솜 패널 올리고는 변경되지 않았지만 포함된 인덱스가 Illumina DNA/RNA UD 인덱스로 업데이트되었습니다.
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결과
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수를 개선하는 최적화된 시약 키트.
TruSight Oncology 500
FFPE 조직의 모든 주요 변이 계열과 유전자 시그니처(TMB, MSI, HRD)를 포함하는 대형 범암 패널로 CGP를 활성화합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우.
Nextera XT DNA Library Preparation Kit
DNA 투입 요구량이 적은 작은 유전체, PCR 앰플리콘, 플라스미드 및 cDNA 염기서열 분석을 위한 DNA 라이브러리를 준비하는 90분 워크플로우를 제공합니다.
Illumina DNA Prep
광범위한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우.
Illumina DNA Prep with Enrichment
광범위한 표적 염기서열 분석 애플리케이션을 위한 염기서열 분석용 DNA 라이브러리를 제공하는 빠른 통합 워크플로우.
Illumina UD Indexes
고유한 듀얼(UD) 인덱스를 사용하면 처리량을 늘리고 비용 절감의 이점을 위해 다중화할 수 있는 고품질 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
Viral Surveillance Panel
표적 인리치먼트(Target Enrichment)를 포함한 SARS-CoV-2, 인플루엔자, 소아마비를 포함한 66가지 바이러스의 전장 유전체 시퀀싱 및 특성 규명.
Illumina RNA Prep with Enrichment
광범위한 샘플 유형 및 RNA 입력량에서 강화되고 색인된 시퀀싱 라이브러리를 생산하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우.
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