여러 고형암 유형에 걸쳐 FFPE 조직으로부터 83개의 RNA fusion을 표적으로 하는 표적 패널입니다.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel은 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 샘플에서 분리한 RNA를 사용하여 여러 고형암 유형에서 관련된 18개의 드라이버 유전자와 83개의 fusion partner를 조사하도록 설계된 견고한 NGS assay입니다.
이 집중 패널은 FFPE 조직에서 분리한 RNA에서 유전자 재배열을 검출할 수 있습니다.
이 assay는 효율적인 단일 튜브 표적 인리치먼트를 위한 타일링된 앰플리콘 기반 라이브러리 준비 chemistry인 Illumina의 독자적인 Stem Loop Inhibition-Mediated 증폭(SLIMamp) 기술을 사용합니다.
이 워크플로우를 통해 검사실은 모든 NGS 검사실에서 자체적으로 수행 가능한 단일 튜브, 타일링된 증폭 방식으로 샘플과 결과를 직접 관리할 수 있습니다.
| Assay time | 48 hours from sample to report |
|---|---|
| 암 종류 | 전체 고형암, 고형암 |
| Content specifications | 18 driver genes and 83 fusion partners |
| Description | RNA fusion panel interrogating 18 driver genes and 83 fusion partners from FFPE tissue |
| 수작업 시간 | ~3시간 |
| Input quantity | 10–50 ng RNA |
| 기기 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템 |
| 방법 | 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | RNA |
| Number of amplicons | Pool 1: 83 amplicons |
| Number of reactions | 24 reactions per kit |
| 특수 샘플의 종류 | FFPE 조직 |
| 종 카테고리 | 인간 |
| 가닥 특이성 | 비가닥(Non-stranded) |
| Target insert size | 120 bp |
| 기술 | 시퀀싱 |
| 변이 클래스 | 유전자 융합 |
또한 Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel에는 Pillar 인덱스 키트, 시퀀싱 시약 및 DRAGEN Amplicon 또는 PiVAT 2차 분석 소프트웨어를 사용해야 합니다. 추가적인 변이 해석이 필요한 경우 Illumina Connected Insights를 권장합니다.
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel은 FFPE 샘플에서 분리한 RNA를 사용하여 여러 고형암 유형을 9시간 이내에 분석하며, 수작업 시간은 약 3시간입니다.
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel
연구자들은 액체 생검 NGS 분석을 사용하여 암 환자의 혈액에 존재하는 종양 유래 바이오마커를 검출하고 특성을 확인할 수 있습니다.
Illumina의 시퀀싱 및 마이크로어레이 기술은 DNA부터 RNA 분석, 후성유전학 등에 이르기까지 다양한 암 유전체학 연구 애플리케이션을 지원합니다.
암 유전자 발현 및 전사체(transcriptome) 변화를 검출하고 RNA 차세대 시퀀싱(RNA-Seq)으로 새로운 암 전사물(transcript)을 식별합니다.
| Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel | Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel | Pillar oncoReveal Multi-Cancer CNV + RNA Fusion Panel | TruSight RNA Pan-Cancer Panel | |
|---|---|---|---|---|
| Assay time | 48 hours from sample to report | 48 hours from sample to report | 48 hours from sample to report | 2.5일 |
| 암 종류 | 전체 고형암, 고형암 | 전체 고형암, 고형암 | 전체 고형암, 고형암 | 전체 고형암, 혈액학, 고형암 |
| Content specifications | 18 driver genes and 83 fusion partners | 48 genes | 78개 유전자 작은 전체 종양 종양학 패널 | 1,385개의 표적 유전자와 21,043개의 표적 엑손 영역이 포함된 전체 고형암 패널. 암 유전자 융합과 관련된 유전자 507개 포함. |
| Description | RNA fusion panel interrogating 18 driver genes and 83 fusion partners from FFPE tissue | The Pillar oncoReveal Solid Tumor v2 Panel is a robust DNA NGS assay, interrogating 48 genes across multiple solid tumor cancer types. | DNA 및 RNA 함량이 있는 78- 유전자 앰플리콘 기반 패널, 간단한 단일 튜브 워크플로 | 다양한 암 유형의 유전자 융합, 변이 및 유전자 발현 변화에 대한 연구를 지원하는 암 관련 RNA 전사물의 포괄적인 평가를 수행합니다. |
| 수작업 시간 | ~3시간 | ~3시간 | ~3시간 | 11시간 |
| Input quantity | 10–50 ng RNA | 20–80 ng DNA | DNA 5~80 ng, RNA 10~50 ng | Total RNA 10 ng, FFPE RNA 20~100 ng |
| 기기 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), NextSeq 550Dx(Research Mode), MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 500 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 |
| 방법 | 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 | 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱 | 표적 DNA 시퀀싱, 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 | 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트, 커스텀 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | RNA | DNA | DNA, RNA | RNA |
| Number of amplicons | Pool 1: 83 amplicons | Pool 1: 246 amplicons | Pool 1 (DNA): 341 amplicons. Pool 2 (RNA): >80 amplicons plus MET exon 14 skipping | |
| Number of reactions | 24 reactions per kit | 24 reactions per kit | DNA 24개/RNA 24개 | |
| 특수 샘플의 종류 | FFPE 조직 | FFPE 조직 | 혈액, 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 | 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 |
| 종 카테고리 | 인간 | 인간 | 인간 | 인간 |
| 가닥 특이성 | 비가닥(Non-stranded) | |||
| Target insert size | 120 bp | 154 bp | 평균: 120 bp(범위 86~185 bp) | |
| 기술 | 시퀀싱 | 시퀀싱 | 시퀀싱 | 시퀀싱 |
| 변이 클래스 | 유전자 융합 | 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel) | 유전자 융합, 체세포 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) | 유전자 융합, 체세포 변이, 새로운 전사물, 전사물 변이 |
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유전자 목록
Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel은 18개의 드라이버 유전자와 83개의 파트너 유전자를 포함합니다.
패널 사양
FFPE 조직에서 분리한 fusion 전사물(RNA)의 조사를 위한 Pillar oncoReveal Multi-Cancer RNA Fusion v2 Panel 사양입니다.
oncoReveal™ MultiCancer RNA Fusion v2 Pnl 24rxn
HRA-HS-1002-24
18 gene (24 sample) solid tumor RNA panel on SLIMamp™ workflow
List Price:
Discounts:
Indices PI501-8, PI701-4 (32 combinations, 96 reactions)
IDX-PI-1001-96
Indices PI501-8, PI701-4 (32 combinations, 96 reactions)
List Price:
Discounts:
Kit D, indices PI501-8, PI701-12
IDX-PI-1004-192
Kit D, indices PI501-8, PI701-12
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여러 고형암 유형에 걸쳐 48개의 유전자를 조사하는 견고한 DNA NGS assay입니다.
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
여러 고형암 유형에 걸쳐 혈장으로부터 34개의 유전자를 조사하는 견고한 cfDNA 액체 생검 NGS assay입니다.
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