SOMAmer(Slow Off-rate Modified Aptamer) 기술

전통적인 항체는 일반적으로 면역 반응을 유발한 단백질 표면(즉, 면역원성 표적)의 3차원 구조에 결합하는 친화력 큰 시약(약 150 kDa)입니다. 이는 단일 단백질 에피토프를 인식하기 위해 세포 배양에서 생산된 단클론 항체 또는 동일한 단백질에서 여러 에피토프를 인식하는 동물에서 생산된 다클론 항체로서 생물학적으로 생산됩니다.

반면 SOMAmer 시약은 3차원 단백질 구조에도 결합하는 화학적으로 변형된 소형 압타머(8~20 kDa)입니다. 완전 합성이므로 배치 간 일관된 성능을 제공합니다. 또한 고유한 chemistry 덕분에 현재 항체에 의해 표적화되지 않은 비면역원성 표적 및 에피토프에 결합할 수 있습니다.

이러한 특징이 결합되어 SOMAmer 시약은 다용도이면서 기존의 항체 기반 도구에 대해 신뢰할 수 있는 대안이 됩니다.

SOMAmer 기반 단백체학은 > 10-log 동적 범위, 펨토몰 민감도 및 확장 가능한 멀티플렉싱으로 고처리량의 비용 효율적인 워크플로우를 가능하게 하며, 이 모든 것은 기존 방법보다 변동성이 더 낮습니다. 이를 통해 워크플로우를 변경할 필요 없이 저풍부도 단백질을 신뢰성 있게 검출할 수 있으며, SOMAmer 기반 단백체학을 대규모로 광범위하고 신뢰할 수 있는 단백질 측정을 수행하는 강력하고 효율적인 접근법으로 만듭니다.

이와 대조적으로, 질량분석법은 일반적으로 저풍부도 단백질의 커버리지를 개선하기 위해 추가 샘플 처리 단계를 필요로 합니다.

항체 기반 접근법과 비교하여, SOMAmer 기반 단백체학은 확장된 assay 멀티플렉싱에서도 강력한 재현성(약 5% CV)을 일관되게 제공합니다.

워크플로우는 샘플에서 분석까지 약 2.5일이 소요되며 수작업 시간은 4시간 미만입니다.

각 SOMAmer 시약은 표적 단백질에 대한 고친화도 결합과 느린 해리 속도의 두 가지 주요 특성을 통해 특이성을 달성합니다. 이러한 특성은 시약의 고유한 화학 구조에서 기인합니다.

SOMAmer 시약을 assay에 사용하기 전에 일차 밸리데이션을 거치며, 여기에는 의도한 표적에 선택적으로 결합하는지 확인하기 위한 풀다운 실험 및 용량-반응 assay가 포함됩니다. 또한 SOMAmer 시약의 70% 이상은 질량분석법과 같은 직교적 검증 기법(orthogonal validation technique)을 사용하여 독립적인 연구자가 생성한 특이성 데이터로 뒷받침됩니다.

SOMAmer 시약은 합성 시약이며 일관되게 재생성될 수 있어 로트 간 일관성이 보장되며 다른 친화성 기반 방법보다 재현성이 높습니다.