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AmpliSeq for Illumina
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AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Research Panel

이 시퀀싱 패널은 SARS-CoV-2 바이러스를 연구하는 빠르고 정확하며 비용 효과적인 방법을 제공합니다.

개요

이 연구 패널에는 SARS-CoV-2 유전체를 표적으로 하는 2개의 풀에 247개의 앰플리콘이 포함되어 있습니다. 패널은 코로나바이러스 유전체(약 30 kb)의 >99%를 커버리지하고 모든 잠재적 혈청형을 포함합니다.

커뮤니티 패널 기능

AmpliSeq for Illumina Community Panel은 주문 제작됩니다. Illumina는 사용자의 편의를 위해 설계를 제공합니다. 그러나 관련 성능 지표는 없습니다. 사전 설계되고 검사된 콘텐츠의 경우, AmpliSeq for Illumina Ready-to-Use Panel 제품군를 보시기 바랍니다.

AmpliSeq for Illumina Community Panel에는 선도적인 질병 연구자들의 의견을 바탕으로 선정하고 설계한 콘텐츠가 포함되어 있습니다. 이 커뮤니티 패널을 있는 그대로 주문하거나 유전자와 앰플리콘을 추가 또는 제거하기 위한 Illumina Concierge를 사용하여 패널을 필요에 맞게 맞춤 제작하실 수 있습니다.

추가 정보

Ampliseq for Illumina에 대해 더 알아보기

사양

사용량 1~100 ng(풀당 10 ng 권장)
방법 앰플리콘 시퀀싱
핵산 종류 RNA
앰플리콘 수 총 247개. 풀 2개. (풀 1: 125개 앰플리콘. 풀 2: 122개 앰플리콘).
종 카테고리 바이러스
종 세부 사항 SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3)
기술 시퀀싱

필수 제품

커뮤니티 패널에 더해, AmpliSeq Library PLUS 키트와 인덱스 어댑터도 필요할 것입니다.

Library PLUS, Adapters, cDNA Synthesis 주문

/ 건

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제품 관련 자료
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비교하기

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 Research Panel Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit COVIDSeq 시험 (RUO 버전)
사용량 1~100 ng(풀당 10 ng 권장) 10~100 ng 용량 기준(농도 의존적 아님)
방법 앰플리콘 시퀀싱 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 앰플리콘 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱
핵산 종류 RNA DNA, RNA DNA, RNA RNA
앰플리콘 수 총 247개. 풀 2개. (풀 1: 125개 앰플리콘. 풀 2: 122개 앰플리콘).
종 카테고리 바이러스 인간, 바이러스 진균, 바이러스, 세균 바이러스
종 세부 사항 SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3) 최근 인플루엔자 바이러스 균주 및 SARS-CoV-2 등 일반적인 호흡기 바이러스를 검출합니다. 패널에는 품질 기능으로 인간 표적에 대한 프로브가 포함되어 있으므로 분석된 모든 샘플의 인간 표적을 검출합니다. 호흡기 병원체(180+ 세균, 50+ 진균, SARS-CoV-2를 포함한 40+ 바이러스) 및 항균 내성 대립유전자(1200+)를 검출한다. SARS-CoV-2(SARS-CoV-2_ MN908947v3)
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱

패널 (1)

AmpliSeq™ SARS-CoV-2 Research Panel for Illumina®

20020496

Targeted custom amplicon panel optimized for specific targets or genomic content of interest. Library PLUS and index adapters sold separately.

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FAQ

AmpliSeq for Illumina 라이브러리 준비, 인덱스 및 액세서리와 함께 AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 커뮤니티 패널은 SARS-CoV-2 바이러스의 역학 연구를 위한 표적 RNA/cDNA 앰플리콘 assay입니다(연구 전용). 패널은 바이러스 유전체의 >99%와 바이러스의 모든 잠재적 혈청형을 포함하는 길이 125~275 bps 범위의 247개 앰플리콘/프라이머 페어(242개의 고유한 앰플리콘(풀 1: 125개의 앰플리콘, 풀 2: 122개의 앰플리콘): 237개의 바이러스 특이 SARS-CoV-2 표적 및 5개의 인간 유전자 발현 대조물질)을 포함하는 2개 풀 설계입니다.

이 패널은 연구 전용(RUO) 애플리케이션만을 위한 것이며 진단 절차에 사용하기 위한 것이 아닙니다. 패널이 감염 진단, 예방 또는 관리에 사용될 수 있음을 나타내는 정보를 제공하기 위한 것임을 주장하거나 진술하기 위한 것이 아닙니다.

고객이 바이러스 RNA를 분리할 수 있는 시중에서 구할 수 있는 추출 키트를 평가할 것을 권장합니다. QIAGEN QIAmp Viral RNA Mini Kit(PN 52904)는 차세대 시퀀싱 라이브러리 준비 및 기타 내부 검사 방법에 사용하기에 적합한 것으로 나타났습니다. 이월 주문의 경우, 다른 회사의 시중에서 구할 수 있는 추출 키트도 호환되어야 합니다.

더 자세한 내용은 다음 리소스를 참조하세요.

AmpliSeq for Illumina SARS-CoV-2 커뮤니티 패널용 라이브러리 준비는 AmpliSeq for Illumina Custom and Community Panels Reference Guide를 따릅니다. 3장 RNA 패널 프로토콜(https://support.illumina.com/downloads/ampliseq-for-illumina-custom-and-community-panels-reference-guide-1000000036408.html).

“cDNA 표적 증폭”에서 다음을 진행합니다.

  • AMP_RNA 프로그램을 위한 2개의 프라이머 풀
  • 표 7: 18 사이클 및 4분에서 풀당 97~192개의 프라이머 페어
    • 풀 1: 125개의 앰플리콘/프라이머 페어 , 풀 2: 122개의 앰플리콘/프라이머 페어
  • 표 8: 샘플 품질 및 샘플 사용량에 따라 조정할 수 있습니다.

AmpliSeq Library PLUS for Illumina를 사용한 라이브러리 준비는 모든 AmpliSeq CD 또는 UD Index Sets for Illumina 와 호환됩니다.

리드 뎁스: 250,000회 샘플당 리드.

리드 길이: 2 x 151 bp.

플랫폼: AmpliSeq for Illumina 라이브러리는 iSeq 100, MiSeq, MiniSeq 및 NextSeq 시스템과 호환됩니다.

MyIllumina 장바구니에 패널을 추가하고 체크아웃하면 패널 주문을 받게 됩니다. 패널은 솔루션 ID를 명시해야 합니다. IAACY126664577_100.

샘플 처리량에 따라 고객은 다음을 주문해야 합니다.

라이브러리 준비
인덱스 어댑터
액세서리 제품

주문 1건에는 2250개의 샘플을 준비하기에 충분한 올리고가 들어 있습니다.

주문 1건 = 미화 $2223로 2,250개의 샘플 준비에 충분합니다(앰플리콘당 약 $9). 여기에는 AmpliSeq Library PLUS for Illumina, Ampliseq cDNA Synthesis for Illumina 또는 AmpliSeq CD 또는 UD Indexes for Illumina는 포함되지 않습니다.

BaseSpace Sequence Hub DNA Amplicon 또는 DRAGEN Metagenomics Pipeline 앱을 데이터 분석에 사용할 수 있습니다.

추가 질문은  techsupport@illumina.com으로 문의하시기 바랍니다.

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