Illumina DNA PCR-Free Prep

민감한 시퀀싱 애플리케이션을 위한 매우 정확한 데이터를 산출하는 효율적이고 빠른 통합 라이브러리 준비 워크플로우.

~1.5시간

Assay 시간

약 45분

수작업 시간

25~300 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina DNA PCR-Free Prep은 인간 전장 유전체 염기서열분석(WGS), 미생물 유전체의 de novo 조립, 종양-정상 변이 검출과 같은 민감한 전장 유전체 염기서열분석(Whole-genome sequencing) 애플리케이션에 사용할 라이브러리 프렙의 빠르고 유연한 워크플로우를 제공합니다.

  • 사전 및 사후 라이브러리 정량화 단계를 제거하여 비용 절감

  • 반복적이거나 고르지 않은 유전체 영역에 걸쳐 매우 균일한 커버리지 제공

  • 90분 내에 자동화 지원 워크플로우 제공

검사실 운영 간소화

Illumina DNA PCR-Free Prep 워크플로우는 광범위한 DNA 사용량, 다양한 샘플의 종류, 크고 작은 유전체를 모두 지원합니다. 워크플로우에는 혈액, 타액 또는 건조 혈반(Dried Blood Spots, DBS)에서 DNA를 추출하는 작업이 포함됩니다.

신뢰할 수 있는 결과 획득

온-비드 태그먼트테이션 화학 물질과 PCR-프리 라이브러리 프렙은 PCR 유도 바이어스를 제거하고 오류 발생 기회를 감소시켜 높은 GC 또는 -AT 지역에서 우수하고 균일한 커버리지를 제공합니다. 온-비드 태그먼트테이션에 대해 자세히 알아보십시오.

유연한 처리량 이용

Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets는 최대 384개의 고유한 이중 인덱스를 제공하여 판독을 정확하게 할당하고 플로우 셀을 효율적으로 사용할 수 있습니다.

Illumina DNA Prep 제품군

다양한 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 최적화된 시퀀싱 라이브러리 준비 솔루션을 찾아보세요.


사양

필수 제품

NovaSeq 6000 시스템을 제외한 모든 기기에 대해 Illumina® DNA PCR-Free Sequencing and Indexing Primer(카탈로그 번호 20041797)를 구매해 보세요.

인덱스 어댑터는 선택 사항이지만 멀티플렉싱(multiplexing)에는 권장됩니다. 샘플 처리량에 맞추는 데 필요한 인덱스 수를 선택해 보세요. Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D(20091654, 20091656, 20091658, 20091660)를 주문하는 것이 좋습니다. IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Sets A-D(20027213, 20027214,20042666, 20042667)는 단종 예정입니다.

멀티플렉싱에 대해 자세히 알아보기.

Illumina Lysis Kit는 혈액 샘플 처리에만 필요합니다.

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애플리케이션

Illumina DNA PCR-Free Prep은 약 1.5시간 내에 종양-정상 변이 식별 또는 인간 전장 유전체 시퀀싱(WGS)과 같은 민감한 애플리케이션을 위한 PCR-free 시퀀싱 준비 라이브러리를 제공합니다.

워크플로우 예시


프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NovaSeq 6000 시스템

S1 flow cell: 3 (based on 607M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter)

S2 flow cell: 6 (based on 663M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter)

S4 flow cell: 16 (based on 669M reads, 40× coverage, or > 160 Gb of total data passing filter)

2 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

다른 사람들이 이 제품을 사용하는 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

Illumina DNA PCR-Free Prep Illumina DNA Prep TruSeq DNA PCR-Free TruSeq DNA Nano
Assay 시간 ~1.5시간 약 3~4시간(DNA 추출부터 정규화된 라이브러리까지) 총 분석 시간 5시간 약 6시간의 총 분석 시간
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
설명 PCR 유도 바이어스를 동시에 제거하고 총 라이브러리 준비 시간을 90분으로 단축하는 온 비드 태그 부착과 PCR이 없는 화학 물질의 고유한 조합을 사용하여 민감한 응용 분야를 위한 시퀀싱 라이브러리를 준비합니다. 다양한 샘플 유형과 DNA 투입량을 수용하여 인간에서 미생물 전장 유전체 염기서열 분석에 이르기까지 광범위한 응용 분야에 액세스할 수 있는 빠르고 유연한 라이브러리 준비 워크플로우.  유전체의 어려운 영역을 통과해 시퀀싱하는 기능을 갖춘 전장 유전체 시퀀싱 연구를 위한 단순한 전체 포함 PCR-free prep입니다. 높은 유전체 커버리지 품질과 편향 감소 효과를 제공하는 저사용량 연구 방법입니다.
수작업 시간 약 45분 1~1.5시간 4시간 ~4시간
사용량 25~300 ng 작은 게놈(예: 미생물)의 경우 1~500 ng DNA, 또는 큰 게놈(예: 인간)의 경우 100~500 ng DNA. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인). DNA 1 ug genomic DNA 100 ng
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
작용 기전 Bead-linked transposome Bead-linked transposome 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 PCR을 사용하지 않고 겔이 없음. 기계적 DNA 절편화 및 어댑터 라이게이션. 워크플로우는 편향 감소 PCR을 사용하고 겔이 없음.
방법 전장 유전체 시퀀싱, De novo 시퀀싱 앰플리콘 시퀀싱, 전장 유전체 시퀀싱, De novo 시퀀싱, 샷건 시퀀싱 시퀀싱을 통한 지노타이핑, 전장 유전체 시퀀싱, 샷건 시퀀싱 시퀀싱을 통한 지노타이핑, 전장 유전체 시퀀싱, 샷건 시퀀싱
멀티플렉싱 최대 384플렉스 최대 384개의 고유한 듀얼(UD) 조합 및 96개의 조합 듀얼(CD) 조합 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개 싱글 최대 24개, 조합(CD) 듀얼 96개, 고유한 듀얼 24개 및 고유한 듀얼(UD) 조합 96개
핵산 종류 DNA DNA DNA DNA
특수 샘플의 종류 혈액, FFPE 호환 불가, 사용량이 적은 샘플, 타액, FFPE 호환 불가 혈액, FFPE 호환 불가, 타액 FFPE 호환 불가 FFPE 호환 불가, 사용량이 적은 샘플
종 카테고리 모든 종, 인간 초파리, 모든 종, 포유류, 마우스, 효모, 제브라피쉬, 인간, 래트, 식물, 바이러스, 선충, 세균 기타, 포유류, 마우스, 인간, 래트, 식물 기타, 포유류, 마우스, 인간, 래트, 식물
표적 단편 크기 450 bp +/- 75 bp ~350 bp 350 bp 또는 550 bp 350 bp 또는 550 bp
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 짦은 연쇄 반복(STR), 단일 염기 다형성(SNP), 체세포 변이, 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 염색체 이상, 생식세포 변이, 구조적 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

선택 도구:

그림 자료

Illumina DNA PCR-Free Prep chemistry

하나의 신속한 반응에 온비드·태그멘테이션과 PCR-free 워크플로우의 고유한 조합.

GC가 풍부한 영역의 리드 커버리지 비교

Illumina DNA PCR-Free Prep Kit는 TruSeq DNA PCR-Free 및 TruSeq DNA Nano Library Prep Kit에 비해 인간 RNPEPL1 유전자의 GC가 풍부한 프로모터 영역 전체에 걸쳐 탁월한 리드 커버리지(read coverage)를 제공합니다.

Illumina DNA PCR-Free Prep 커버리지 균일성

Illumina DNA PCR-Free Prep은 인간 유전체의 다양한 GC 함량에 걸쳐 균일한 커버리지를 제공합니다.

다양한 DNA 사용량에 대한 Illumina DNA PCR-Free Prep 성능

다양한 DNA 사용량으로 준비한 Illumina DNA PCR-Free Prep 라이브러리는 (A) 모든 DNA 사용량에 대한 품질 사양을 통과했으며 (B) 동등한 검출 성능을 보여줍니다.

추가 비드 정제로 단편(insert) 크기 증가

추가 비드 정제 라운드는 미변형 프로토콜(파란색 및 주황색 선)과 비교하여 단편 크기(회색 및 황색 선)를 증가시킵니다.

자원

축소판

이 웨비나에서는 라이브러리 준비 워크플로우와 시퀀싱 고려 사항에 대해 논의하고 성공적인 차세대 시퀀싱 프로젝트를 위한 팁을 제공합니다.

라이브러리 프렙 (2)

Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (24 Samples)

20041794

24개의 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 Illumina 정제 비드가 포함되어 있습니다. 인덱스 어댑터를 별도로 구매하십시오.

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Illumina® DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples)

20041795

96개 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 Illumina 정제 비드가 포함되어 있습니다. 색인 어댑터를 별도로 구입하십시오.

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인덱스 어댑터 (8)

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091654

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091656

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091658

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20091660

Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)에는 96개 샘플을 라벨링하는 데 충분한 96개의 10 bp 인덱스가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027213

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042666

96개의 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 96, 10 bp 인덱스 포함. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20042667

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples)

20027214

96개의 검체 라벨링에 충분한 96, 10 bp 지수를 포함한다. 라이브러리 준비 및 인리치먼트 시약과 프로브 패널을 별도로 구매해 보세요.

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서비스 (1)

Illumina DNA PCR-Free Prep Training

20046010

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액세서리 제품 (2)

Illumina® DNA PCR-Free Sequencing and Indexing Primer

20041797

iSeq VP10, MiniSeq, NextSeq 500/550, NextSeq 1000/2000 및 HiSeq 3000/4000 시스템에 사용하기 위한 VP10 맞춤형 판독 1 프라이머 튜브 2개 및 VP14 맞춤형 인덱스 2 프라이머 튜브 2개 포함.

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Illumina® Lysis Kit

20042221

Illumina DNA PCR-Free Prep으로 혈액 샘플을 처리하기 위한 용해 키트 1개가 포함되어 있습니다. 라이브러리 준비 및 색인 어댑터를 별도로 구입합니다.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

PCR-free 라이브러리 준비는 PCR 증폭을 사용하지 않고 DNA 라이브러리를 구성하는 것입니다. Illumina DNA PCR-Free chemistry는 PCR 유도 편향을 제거하고 민감한 애플리케이션에 매우 정확한 시퀀스 정보를 제공합니다.

PCR-free 라이브러리 준비는 bead-linked transposome 복합체를 사용하여 신속 단일 반응 단계에서 어댑터 태그 서열을 절편화하고 추가함으로써 유전체 DNA를 태그합니다. 단일 반응 단계를 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation)이라고 합니다. Bead-linked transposome이 DNA로 포화된 후, 추가적인 태그멘테이션이 일어나지 않아 일관된 라이브러리 수율 및 단편 크기를 제공합니다.  온비드·태그멘테이션에 대해 더 알아보기

 

PCR-free 시퀀싱은 PCR 증폭 단계를 없애 일반적인 PCR 유도 편향 및 불균일한 증폭을 크게 줄입니다.

Illumina DNA PCR-Free Prep 워크플로우는 온비드·태그멘테이션을 이용하여 DNA 사용량 또는 유전체 크기와 관계없이 신속 단일 반응에서 일관된 단편 크기, 균일한 커버리지 및 향상된 성능을 가능하게 합니다. 온비드·태그멘테이션은 PCR 증폭 단계의 필요성을 없애 편향된 염기 구성과 오류 가능성을 최소화하므로 이 키트는 민감한 시퀀싱 애플리케이션에 이상적입니다.

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NovaSeq X 시리즈 주문

발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

MiSeq Reagent Kit v3

클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.

TruSight Oncology 500

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.

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