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TruSight Oncology 500 임상 연구 솔루션

Take cancer from uncertainty to insight

임상 연구를 위해 조직 또는 액체 생검으로부터 포괄적인 유전체 프로파일링을 가능하게 합니다.

Profile image of a female scientist using a single pipette into a tube, two boxes of TruSight Oncology ctDNA v2 Enrichment library prep boxes on the lab bench with other NovaSeq X consumables; two scientists and a NovaSeq X instrument are blurry in the background.

정밀 종양학 연구를 촉진하기 위한 세 가지 assay

TruSight Oncology 500 제품군은 사내 포괄적 유전체 프로파일링(CGP)을 가능하게 하는 전암(pan-cancer) 차세대 시퀀싱을 제공합니다. 하나의 통합 assay로 주요 가이드라인 및 임상시험에서 관련 생체표지자를 식별하여 반복 검사보다 더 적은 샘플로 더 많은 결과를 얻습니다. 

TruSight 종양학 500 제품

TruSight Oncology 500

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전암(pan-cancer) 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

TruSight Oncology 500 High-Throughput

모든 주요 변이 분류와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI)를 다루는 대형 전암 패널을 통해 추가된 확장성으로 CGP를 지원합니다.

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

주요 IO 유전자 시그니처(TMB, MSI)와 혈장 내 ctDNA의 모든 주요 변이 클래스를 검출할 수 있는 전체 고형암 패널로 CGP를 활성화합니다.

주요 기능 및 이점

포괄성

순차적 검사 없이 관련 돌연변이를 식별할 가능성을 높이기 위해 TMB, MSI, HRD*와 같은 광범위한 유전체 시그니처를 포함한 단일 멀티플렉스 assay에서 > 500개의 전암 생체표지자를 평가하세요.

유연성

충분한 조직을 쉽게 이용할 수 없는 경우, 액체 생검에서 얻은 FFPE 샘플 또는 최소 침습적 순환 종양 DNA(ctDNA)를 사용하여 조직 연구를 보완하세요.

신뢰성

견고한 하이브리드 캡처 화학 반응, 입증된 SBS 시퀀싱 및 정교한 바이오인포매틱스로 포트폴리오 전반에 걸쳐 일관된 품질을 달성합니다.

사내

검사실에 정밀 종양학을 제공하여 샘플 손실을 최소화하고, 총 소요 시간을 제어하며, 품질을 모니터링하고, 발견 시 재분석을 위한 데이터를 유지합니다.

시의적절함

통합 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 현지 또는 클라우드에서 사용할 수 있는 바이오인포매틱스 옵션으로 < 5일 내에 결과를 확보하세요.

확장 가능

자동화 옵션으로 수작업 시간을 줄이고 오류를 최소화합니다. TruSight Oncology 및 TruSight Oncology High-Throughput†의 경우 런당 8~192개의 샘플 시퀀스 및 TruSight Oncology 500 ctDNA의 경우 런당 8~48개의 샘플을 시퀀스합니다.

주요 전체 고형암 생체표지자

TruSight Oncology 500 콘텐츠에는 여러 암 유형에 대한 관련 DNA 및 RNA 변이a가 포함됩니다.

전암 유전자: BRAF NTRK1 NTRK2 NTRK3 RET MSI TMB

유의성이 있는 생체표지자가 포함된 유전자b 잠재적 유의성이 있는
생체표지자가 포함된 유전자c
  유방 BRCA1 BRCA2 ERBB2d ESR1 PALB2 PIK3CA 180
  대장 ERBB2d KRAS NRAS       166
  뼈 EGFR ERG ETV1 ETV4 EWSR1 FEV 140
FLI1 FUS H3F3A HEY1 IGH1 MDM2
ERBB2d NCOA2 SMARCB1      
  폐 ALKd EGFR ERBB2d KRAS METd NUTM1c 223
ROS1d          
  흑색종 KIT NRAS ROS1c       172
  난소 BRCA1 BRCA2 FOXL2       149
  CNSe APC ATRX CDKN2A CDKN2B EGFR H3F3A 140
HIST1H3B HIST1H3C IDH1 IDH2 MYCN PTCH1
RELA TERT TP53      
  전립선 AR ATM BARD1 BRCA1 BRCA2 BRIP1 151
CDK12 CHEK1 CHEK2 FANCL FGFR2 FGFR3
PALB2 RAD51B RAD51C RAD51D RAD54L  
  갑상선 HRAS KRAS NRAS RET TERT   165
  자궁 및 경부 BRCA2 EPC1 ERBB2c ESR1 FOXO1 GREB1 138
JAZF1 NCOA2 NCOA3 NUTM2A NUTM2B PAX3
PAX7 PHF1 POLE SMARCA4 SUZ12 TP53
YWHAE          
  기타 고형암 ALK APC ARID1A ASPSCR1 ATF1 ATIC 152
BAP1 BCOR BRCA1 BRCA2 CAMTA1 CARS
CCNB2 CDK4 CDKN2A CIC CITED2 CLTC
COL1A1 COL6A3 CREB1 CREB3L1 CREB3L2 CSF1
CTNNB1 DDIT3 DDX3X DNAJB1 DUX4 EED
EGFR ERBB2d ERG ETV1 ETV4 ETV6
EWSR1 FEV FGFR2 FGFR3 FLI1 FOXL2
FOXO1 FOXO4 FUS GLI1 HEY1 HGF
HMGA2 IDH1 KRAS LEUTX MAML3 MDM2
MYB MYOD1 NAB2 NCOA2 NF1 NFATC2
NFIB NR4A3 NRAS NUTMI NUTM2A NUTM2B
PALB2 PATZ1 PAX3 PAX7 PDGFB PDGFRA
PRKACA PRKD1 RANBP2 ROS1 SDHA SDHB
SDHC SDHD SMARCB1 SS18 SSX1 SSX2
SSX4 STAT6 SUZ12 TAF15 TCF12 TERT
TFE3 TFEB TFG TP53 TPM3 TPM4
TRAF7 TSPAN31 VGLL2 WT1 WWTR1 YAP1
YWHAE ZC3H7B        

이 표에 나열된 유전자와 생체표지자는 패널에 포함된 모든 유전자의 부분집합입니다. 전체 유전자 목록을 보려면 해당 제품 페이지의 제품 설명서에서 제공되는 제품 데이터시트를 참조하시기 바랍니다.

  1. RNA 변이는 TruSight Oncology 500 및 TruSight Oncology 500 High-Throughput 조직 기반 assay에만 포함됩니다.
  2. 현행 약물 라벨 또는 지침과 연결된 유의한 생체표지자가 포함된 유전자.
  3. 임상시험에서의 존재에 기반하여 잠재적으로 유의한 생체표지자가 포함된 유전자.
  4. 작은 DNA 변이만.
  5. CNS, 중추신경계.

제품 비교

  TruSight Oncology 500 TruSight Oncology 500 High-Throughput TruSight Oncology 500 ctDNA
Assay 소요 시간 샘플부터 결과까지 4~5일 샘플부터 결과까지 4~5일 정제 핵산부터 변이 보고서까지 3~4일
자동화 기능 액체 취급 로봇 액체 취급 로봇 액체 취급 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
암 유형 전암, 고형암 전암, 고형암 전암, 고형암
콘텐츠 사양 523개 유전자의 DNA, 55개 유전자의 RNA에 대한 표적 선택, 총 1.94 Mb의 패널 크기. MSI 및 TMB 측정 포함. 옵션 TruSight Oncology 500 HRD 키트(일본에서는 판매하지 않음) 구성품에는 Myriad Genetics에 기반한 포괄적인 유전체 불안정성 점수(LOH+TAI+LST)를 통해 상동 재조합 결핍을 평가하기 위한 약 2만5천 개의 SNP 커버리지가 포함됩니다. 523개 관심 유전자의 DNA, 55개 유전자의 RNA에 대한 표적 시퀀싱, 총 1.94 Mb의 패널 크기. MSI 및 TMB 측정 포함. 총 1.94 Mb의 패널을 위해 523개 유전자(전체 코딩 서열)에 대한 표적화된 선발.
  • 면역종양학 생체표지자 커버리지: TMB 및 MSI
  • 가이드라인 커버리지: 다양한 고형암 유형에 대한 주요 가이드라인의 광범위한 커버리지
  • 임상시험 커버리지: 600건 이상의 임상시험(2023년 2월 기준 Velsera 지식베이스 기반)
설명 FFPE 조직으로부터 추출한 포괄적인 유전체 프로파일링을 지원하고 NextSeq 550 시스템 또는 NextSeq 550Dx 기기(연구 모드)에서 실행되며 한 번에 최대 8개의 샘플까지 일괄로 처리하는 assay입니다. NextSeq 1000, NextSeq 2000, NovaSeq 6000, NovaSeq 6000Dx(연구 모드) 또는 NovaSeq X 시리즈를 사용하여 간소화된 워크플로우에서 가이드라인 및 >1,000건의 임상시험에서 주요 생체표지자를 식별하기 위한 고처리량 포괄적 NGS assay입니다. 면역종양학 생체표지자 TMB 및 MSI의 커버리지를 포함합니다. 액체 생검 샘플(혈장의 ctDNA)의 포괄적 유전체 프로파일링을 위한 비침습적 연구 방법을 제공합니다. 이 액체 생검 접근법은 조직 기반 CGP를 보완하기 위한 최소 침습적 샘플 채취 접근법을 이용하여 종양 내 및 종양 간 비균질성에 대한 통찰력을 제공합니다.
수작업 시간 자동 워크플로우의 경우 약 2.5시간
수동 워크플로우의 경우 약 10.5시간		 자동 워크플로우의 경우 약 2.5시간
수동 워크플로우의 경우 약 10.5시간		 자동 워크플로우의 경우 약 2.5시간
수동 워크플로우의 경우 약 10.5시간
입력량 DNA 40 ng 및/또는 RNA 40 ng DNA 40 ng 및/또는 RNA 40~80 ng 세포유리 DNA 20 ng(혈장 4 ml)
기기 NextSeq 550 시스템, NextSeq 550Dx 연구 모드 NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq X 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, NovaSeq 6000Dx 연구 모드, NovaSeq 6000 시스템 NovaSeq X 시스템 연구 모드, NovaSeq X Plus 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq 6000Dx
방법 표적 인리치먼트, 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 표적 인리치먼트, 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱 표적 인리치먼트, 표적 DNA 시퀀싱
멀티플렉싱 최대 8플렉스

NextSeq 1000 및 2000: P2 플로우 셀 8 샘플, P3 플로우 셀 24 샘플, P4 플로우 셀 36 샘플.
NovaSeq 6000/Dx: SP 플로우 셀 16 샘플, S1 플로우 셀 32 샘플, S2 플로우 셀 72 샘플, S4 플로우 셀 192 샘플.

NovaSeq X 시리즈*: 1.5B 카트리지 32개 샘플, 10B 카트리지 192개 샘플, 25B 480개 샘플.

 NovaSeq X 시리즈: 1.5B 플로우 셀에서 4개 샘플, 10B 플로우 셀에서 24개 샘플, NovaSeq 6000 시스템: S2 플로우 셀에서 8개 샘플, S4 플로우 셀에서 24개 샘플, 최대 인덱스 192개
핵산 유형 DNA, RNA DNA, RNA DNA
샘플 처리량 8개 샘플/런 NextSeq 1000 및 2000: 8~36개 샘플/런, NovaSeq 6000/Dx: 16~192개 샘플/런, NovaSeq X: 32~480개 샘플/런, NovaSeq X Plus: 32~960개 샘플/런 4~48개 샘플/런
특수 검체 유형 FFPE 조직 FFPE 조직 순환 종양 DNA, 혈액
종 범주 인간 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 분류 유전자 융합, 전사물 변이, 단일 연기서열 변이(SNV), 삽입-결실(insertion/deletion), 복제수 변이(CNV), 이형접합성 상실(LOH), 체세포 변이, 신규 전사물, 단일 염기 다형성(SNP), 구조적 변이 유전자 융합, 체세포 변이, 새로운 전사물, 구조적 변이, 전사물 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입-결실(insertion/deletion), 복제수 변이(CNV) 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입-결실(insertion/deletion), 복제수 변이(CNV)

자주 묻는 질문

TruSight Oncology 500, TruSight Oncology 500 HT 및 TruSight Oncology 500 ctDNA는 DNA 및 RNA 변이 전반의 523개의 암 관련 유전자를 커버합니다. (RNA 변이는 TruSight Oncology 500 및 TruSight Oncology 500 High-Throughput 조직 기반 assay에만 포함됩니다.) 유전자는 여러 고형 종양 유형 전반에서 가이드라인, 약제 라벨 및 임상시험에 맞도록 선발되었습니다.  자세한 내용과 전체 유전자 목록은 TruSight Oncology 500 및 TruSight Oncology 500 HT, 그리고 TruSight Oncology 500 ctDNA 데이터 시트를 참조하십시오.

HRD는 세포가 이중 가닥(double-stranded) DNA 손상을 상동성 재조합 복구(homologous recombination repair, HRR) 경로를 사용하여 복구할 수 없는 상태와 관련된 유전체 시그니처입니다. HRR 경로가 손상된 경우, 이러한 파괴는 대체 경로를 사용하여 복구되거나 복구되지 않아 유전체 불안정성 및 종양 형성을 초래합니다.2 TruSight Oncology 500 HRD는 TruSight Oncology 500에 대한 추가적인 것으로서 난소암, 유방암, 췌장암, 전립선암과 관련된 종양 인사이트를 얻는 데 도움이 되는 유전체 불안정성(GIS)을 평가합니다.3

TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 TruSight Oncology 500 HT와 유사한 콘텐츠를 포함하고 있지만, 유전자 융합은 단 23개 유전자의 DNA로만 이루어집니다(조직의 경우 55개와 비교됨). 또한, TruSight Oncology 500 ctDNA v2에는 HRD 평가가 포함되지 않습니다.

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리소스

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TruSight Oncology 500 HRD at Oncopole Toulouse

상동 재조합 결핍(HRD)은 난소암에서 중요한 생체표지자입니다. 프랑스 Oncopole Toulouse 검사실의 Guillaume Bataillon 박사로부터 TSO 500 HRD의 assay 성능에 대해 들어 보세요.

전문가와 상담하기

TruSight Oncology 500 제품에 대해 더 알아보고 귀하의 필요에 맞는 assay를 찾으려면 Illumina 담당자에게 연락하세요.

*HRD는 유전체 불안정성 점수(GIS)를 평가하기 위한 액세서리 키트를 통해 이용할 수 있습니다. HRD는 TruSight Oncology 500 HRD Kit를 TruSight Oncology 500에 추가한 경우에만 사용 가능합니다. 일본에서는 판매되지 않습니다. 
†TruSight Oncology 500의 경우 런당 8개 샘플, TruSight Oncology 500 HRD의 경우 런당 8~16개 샘플; TruSight Oncology 500 High-Throughput의 경우 런당 16~192개 샘플.

 

참고 문헌

  1. ontent analysis provided by Pierian Knowledgebase v8.5, February 2023.
  2. O'Connor MJ. Targeting the DNA damage response in cancer. Mol Cell. 2015;60(4):547-560. doi:10.1016/j.molcel.2015.10.040 
  3. Yamamoto H, Hirasawa A. Homologous recombination deficiencies and hereditary tumors. Int J Mol Sci. 2021;23(1):348. doi:10.3390/ijms23010348