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TruSight Oncology 500 임상 연구 솔루션

암을 불확실성에서 인사이트로 전환하기

임상 연구를 위해 조직 또는 액체 생검으로부터 포괄적인 유전체 프로파일링을 가능하게 합니다.

Profile image of a female scientist using a single pipette into a tube, two boxes of TruSight Oncology ctDNA v2 Enrichment library prep boxes on the lab bench with other NovaSeq X consumables; two scientists and a NovaSeq X instrument are blurry in the background.

정밀 종양학 연구를 가속화하는 간소화된 assay

TruSight Oncology 500 제품군은 사내 포괄적 유전체 프로파일링(CGP)을 가능하게 하는 전암(pan-cancer) 차세대 시퀀싱을 제공합니다. 하나의 통합 assay로 주요 가이드라인 및 임상시험에서 관련 생체표지자를 식별하여 반복 검사보다 더 적은 샘플로 더 많은 결과를 얻습니다. 

TruSight 종양학 500 제품

TruSight Oncology 500 v2*

모든 주요 변이 클래스 및 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 포괄적인 범암 패널을 사용하여 보다 효율적인 워크플로우로 FFPE 조직에서 더 빠르게 CGP 결과를 얻을 수 있습니다.

TruSight Oncology 500 ctDNA v2

주요 IO 유전자 시그니처(TMB, MSI)와 혈장 내 ctDNA의 모든 주요 변이 클래스를 검출할 수 있는 전체 고형암 패널로 CGP를 활성화합니다.

주요 기능 및 이점

포괄성

순차적 검사 없이 관련 돌연변이를 식별할 가능성을 높이기 위해 TMB, MSI, HRD*와 같은 광범위한 유전체 시그니처를 포함한 단일 멀티플렉스 assay에서 > 500개의 전암 생체표지자를 평가하세요.

유연성

충분한 조직을 쉽게 이용할 수 없는 경우, 액체 생검에서 얻은 FFPE 샘플 또는 최소 침습적 순환 종양 DNA(ctDNA)를 사용하여 조직 연구를 보완하세요.

신뢰성

견고한 하이브리드 캡처 화학 반응, 입증된 SBS 시퀀싱 및 정교한 바이오인포매틱스로 포트폴리오 전반에 걸쳐 일관된 품질을 달성합니다.

사내

검사실에 정밀 종양학을 제공하여 샘플 손실을 최소화하고, 총 소요 시간을 제어하며, 품질을 모니터링하고, 발견 시 재분석을 위한 데이터를 유지합니다.

시의적절함

로컬 또는 클라우드에서 사용 가능한 통합 라이브러리 준비, 시퀀싱 및 바이오인포매틱스 옵션으로 3~4일 이내에 결과를 얻으세요.

확장 가능

자동화 옵션으로 수작업 시간을 줄이고 오류를 최소화합니다. TruSight Oncology v2의 경우 런당 8~960개의 샘플을 시퀀싱하고 TruSight Oncology 500 ctDNA의 경우 런당 8~48개의 샘플을 시퀀싱합니다.

주요 생체표지자

여러 암 유형에 대한 유전체 종양 프로파일링 생체표지자 부분집합

Pan-cancer: BRAF, NTRK1, NTRK2, NTRK3, RET, TMB, MSI

유의한 생체표지자가 있는 유전자a
  유방 AKT1 BRCA1 BRCA2 ESR1 PIK3CA PTEN
  대장 KRAS NRAS POLD1 POLE    
  폐 ALK BRAF EGFR ERBB2 KRAS MET
RET ROS1        
  흑색종 KIT NRAS        
  난소 BRCA1 BRCA2 HRD      
  전립선 ATM ATR BARD1 BRCA1 BRCA2 BRIP1
CDK12 CHEK1 CHEK2 FANCL MRE11A NBN
PALB2 RAD51B RAD51C RAD51D RAD54L  
  자궁 POLE          

이 표에 나열된 유전자와 생체표지자는 패널에 포함된 모든 유전자의 부분집합입니다. 전체 유전자 목록을 보려면 해당 제품 페이지의 제품 설명서에서 제공되는 제품 데이터시트를 참조하시기 바랍니다.

  1. 주요 가이드라인과 관련된 유의성 있는 생체표지자가 있는 유전자.

제품 비교

  TruSight Oncology 500 v2* TruSight Oncology 500 ctDNA v2
Assay 소요 시간 샘플 투입부터 최종 결과까지 3~4일 정제된 핵산부터 변이 보고서까지 3~4일
자동화 기능 액체 취급 로봇 액체 취급 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
암 유형 전암, 고형암 전암, 고형암
콘텐츠 사양
  • 523개 유전자의 DNA, 55개 유전자의 RNA에 대한 표적 선택, 총 1.94 Mb의 패널 크기. MSI 및 TMB 측정 포함. 
  • 포함된 HRD(상동 재조합 결핍) 패널에는 Myriad Genetics가 제공하는 포괄적인 유전체 불안정성 점수(LOH+TAI+LST)를 통해 HRD를 평가하기 위한 약 25K SNP의 커버리지가 포함됩니다.
  • 면역종양학 바이오마커 커버리지: TMB 및 MSI
  • 가이드라인 커버리지: 다양한 고형암 유형에 대해 주요 가이드라인의 광범위한 커버리지
  • 임상시험 커버리지: 600건 이상의 임상시험(2023년 2월 기준 Velsera 임상 지식베이스 기반).
설명 FFPE 조직의 DNA 및 RNA를 사용하여 고형암의 포괄적인 유전체 프로파일링을 가능하게 합니다. 광범위한 종양 특성 규명을 위해 단일 샘플에서 변이 검출 및 생체표지자 평가를 제공합니다. 액체 생검 샘플(혈장의 ctDNA)의 포괄적 유전체 프로파일링을 위한 비침습적 연구 방법을 제공합니다. 이 액체 생검 접근법은 조직 기반 CGP를 보완하기 위한 최소 침습적 샘플 채취 접근법을 이용하여 종양 내 및 종양 간 비균질성에 대한 통찰력을 제공합니다.
수작업 시간 수동 워크플로우의 경우 약 7시간 자동 워크플로우의 경우 약 1.5시간
수동 워크플로우의 경우 약 2.5시간
입력량 DNA 30 ng(최저 10 ng), RNA 40 ng(최저 20 ng) 세포유리 DNA 20 ng(혈장 4 ml)
기기 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, 연구 모드의 NextSeq 550Dx, NovaSeq X 시스템, 연구 모드의 NovaSeq 6000Dx, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 NovaSeq X 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, NovaSeq 6000 시스템, 연구 모드의 NovaSeq 6000Dx
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 인리치먼트, 표적 DNA 시퀀싱
멀티플렉싱 NextSeq 550/Dx: 런당 샘플 8개.
NexSeq 1000 및 2000: P2 플로우 셀 8개 샘플, P3 플로우 셀 24개 샘플, P4 플로우 셀 36개 샘플.
NovaSeq 6000/Dx: SP Flow Cell 16개 샘플, S1 플로우 셀 32개 샘플, S2 Flow Cell 72개 샘플, S4 Flow Cell 192개 샘플.
NovaSeq X/X+: 1.5 B 32개 샘플, 10B 192개 샘플, 25B 480개 샘플.		 NovaSeq X 시리즈: 1.5B 플로우 셀에서 샘플 4개, 10B 플로우 셀에서 샘플 24개
NovaSeq 6000 시스템: S2 Flow Cell에서 샘플 8개, S4 S4 Flow Cell에서 샘플 24개, 최대 인덱스 192개
핵산 종류 DNA, RNA DNA
샘플 처리량 런당 8~960개 샘플 4~48개 샘플/런
특수 샘플 유형 FFPE 조직 순환 종양 DNA, 혈액
종 범주 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 분류 유전자 융합, 이형접합성 상실(LOH), 체세포 변이, 전사 변이, 단일 뉴클레오티드 변이(SNV), 삽입-결실(인델), 복제수 변이(CNV), 유전체 불안정성 점수(GIS), 현미부수체 불안정성(MSI), 종양 돌연변이 부담(TMB), 새로운 전사물, 단일 뉴클레오티드 다형성(SNP), 구조적 변이 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입-결실(insertion/deletion), 복제수 변이(CNV)

자주 묻는 질문

TruSight Oncology 500 v2 및 TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 DNA 및 RNA 변이 전반에서 523개의 암 관련 유전자를 다룹니다. (RNA 변이는 TruSight Oncology 500 v2 조직 기반 assay에만 포함됩니다.) 유전자는 여러 고형암 유형에 대한 지침, 약물 라벨 및 임상시험에 따라 선택되었습니다. 자세한 내용과 전체 유전자 목록은 TruSight Oncology 500 v2 및 TruSight Oncology 500 ctDNA  v2 Data Sheet 참조하십시오.

TruSight Oncology 500 v2 assay에는 검사실이 유전체 불안정성(GIS)을 평가하고 난소암, 유방암, 췌장암 및 전립선암과 관련된 종양 인사이트를 얻는 데 도움이 되는 프로브가 포함됩니다.3

TruSight Oncology 500 ctDNA v2에는 TruSight Oncology 500 v2와 유사한 콘텐츠가 포함되지만, 유전자 융합은 DNA에서 23개의 유전자(조직의 경우 55개에 비해)에 걸쳐서만 호출됩니다. 또한, TruSight Oncology 500 ctDNA v2에는 HRD 평가가 포함되지 않습니다.

/ 건

자원

축소판

Catalan Institute of Oncology에서 TSO 500 v2로 암 연구 발전

Catalan Institute of Oncology의 연구자들이 TruSight Oncology 500 v2를 사용하여 워크플로우를 간소화하고 연구를 가속화하는 방법을 알아보세요. 이 비디오에서 연구소의 과학자들은 개선된 assay에 대해 이야기하고 결과가 발견을 촉진하는 데 얼마나 빠른지 공유합니다.

전문가와 상담하기

TruSight Oncology 500 제품에 대해 더 알아보고 귀하의 필요에 맞는 assay를 찾으려면 Illumina 담당자에게 연락하세요.

*TruSight Oncology v2는 일본에서 판매되지 않습니다.

 

참고 문헌

  1. Pierian 지식베이스 v8.5, 2023년 2월에 제공된 콘텐츠 분석.
  2. O'Connor MJ. 암의 DNA 손상 반응을 표적으로 삼기. Mol Cell. 2015;60(4):547-560. doi:10.1016/j.molcel.2015.10.040 
  3. Yamamoto H, Hirasawa A. 상동 재조합 결핍증과 유전성 종양. Int J Mol Sci. 2021;23(1):348. doi:10.3390/ijms23010348