TruSight Oncology 500 ctDNA v2

주요 IO 유전자 시그니처(TMB, MSI)와 혈장 내 ctDNA의 모든 주요 변이 클래스를 검출할 수 있는 전체 고형암 패널로 CGP를 활성화합니다.

이 제품은 일부 지역에서만 제공됩니다. 제공 여부를 확인하시려면 이 제품을 배송받기를 원하시는 지역을 선택 해 주세요.

개요

TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 연구를 위해 혈액 혈장 내 순환 종양 DNA(ctDNA)의 사내 종합 유전체 프로파일링(CGP)을 가능하게 하는 범암 NGS 분석입니다. 

  • 최소 침습적 혈액 샘플에서 낮은 세포유리 DNA 사용량(20 ng)을 활용하여 UMI 기반 하이브리드 캡처 라이브러리 준비 및 딥 시퀀싱을 통해 민감하고 정확한 검출(SNV의 경우 0.2% VAF)을 달성해 보세요.

  • 523개 유전자를 표적으로 하여 주요 변이 클래스(SNV, MNV, 삽입/결실, CNV 및 유전자 재배열) 전반에 걸친 DNA 변이 및 주요 면역 종양학 유전자 시그니처(TMB, MSI)를 평가해 보세요.

  • NovaSeq X 시리즈 확장을 통해 혁신적인 경제성, 40%에 가까운 더 빠른 시퀀싱 런 타임 및 더 넓은 배치 크기(4~48개 샘플)를 제공합니다.

  • 고급 chemistry 및 자동화를 지원하는 키트와 방법을 사용한 간소화된 워크플로우로 1일 라이브러리 준비와 인리치먼트 및 3~4일의 총 소요 시간을 달성할 수 있습니다.

  • DRAGEN 2차 분석은 온프레미스로 또는 Illumina Connected Analytics로 클라우드에서 신속한 변이 검출 알고리즘을 지원합니다. Illumina Connected Insights* 또는 Velsera로 통합 보고를 사용하여 인사이트에 액세스해 보세요.

*일부 국가에서는 판매하지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 출처에 API 콜을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.

포괄적인 포트폴리오로 CGP 지원

TruSight Oncology 500 제품군으로 실행 가능한 변경을 식별할 가능성을 극대화해 보세요.

TruSight Oncology 500과 유사한 DNA 패널 함량으로 혈장 내 순환 종양 DNA(ctDNA)를 분석합니다.

 

HRD는 TruSight Oncology 500 HRD Kit를 TruSight Oncology 500 Kit에 추가하는 경우에만 사용할 수 있습니다. 일본에서는 판매되지 않습니다.

사양

필수 제품

TruSight Oncology 500 ctDNA v2를 실행하려면 다음이 필요합니다.

DRAGEN 파이프라인으로 분석하려면 다음이 필요합니다.

최종 변형 보고서를 생성하려면 다음이 필요합니다.

* 일부 국가에서는 지원되지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 소스에 대한 API 호출을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.

 벨세라는 이전에 Pierian으로 알려졌습니다. 기타 상업적 옵션을 이용할 수 있습니다.

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애플리케이션

워크플로우 예시

*NovaSeq 6000Dx(RUO 모드) 온보드 호환성이 곧 제공될 예정입니다.

일부 국가에서는 판매하지 않습니다. Illumina Connected Insights는 제3자 지식 출처에 API 콜을 통해 사용자 정의 3차 분석을 지원합니다.

프로젝트 권장 사항

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NovaSeq 6000 시스템

런당 샘플 수 24개(S4 Flow Cell), 8억개의 페어드 엔드 리드, 35,000배 커버리지

2 × 150 bp

NovaSeq 6000 시스템

런당 샘플 수 8개(S2 Flow Cell), 8억개의 페어드 엔드 리드, 35,000배 커버리지

2 × 150 bp

NovaSeq X 시스템

NovaSeq X 시리즈, 런당 샘플 수 4개(15억개의 플로우 셀), 8억개의 페어드 엔드 리드, 35,000배 커버리지

2 × 150 bp

NovaSeq X 시스템

NovaSeq X 시리즈, 런당 샘플 수 24개(100억개의 플로우 셀), 8억개의 페어드 엔드 리드, 35,000배 커버리지

2 × 150 bp

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

TruSight Oncology 500 ctDNA v2
Analytical sensitivity ≥ 95% (small variants, ≥ 0.5% VAF)
Analytical specificity ≥ 99.995% (small variants, ≥ 0.5% VAF)
Assay time 2.5–4 days from purified nucleic acid to variant results
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇
Automation details Explore available automation methods
암 종류 전체 고형암, 고형암
Content specifications Targeted sequencing of DNA for a total of 1.94 Mb panel size: 523 genes for small variants, 59 genes for CNVs, 23 genes for gene rearrangements, bMSI (> 2300 loci), bTMB (1.94 Mb).
Description Provides a noninvasive research method for comprehensive genomic profiling of liquid biopsy samples (ctDNA from blood plasma). This liquid biopsy approach provides insights about intra- and inter-tumor heterogeneity using a minimally invasive sample collection approach to complement tissue-based CGP.
Hands-on time ~1.5 hr for automated workflow
~2.5 hr for manual workflow
Input quantity 20 ng cfDNA (4 ml of plasma)
기기 NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
Mechanism of action Hybrid-capture chemistry
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
Multiplexing NextSeq 2000 System: 4 samples on P4 flow cell.
NovaSeq 6000 System: 4 samples on S1 flow cell, 8 samples on S2 flow cell, 24 samples on S4 flow cell.
NovaSeq X Series: 4 samples on 1.5B flow cell, 24 samples on 10B flow cell, 64 samples on 25B flow cell.

핵산 종류 DNA
Sample throughput 4-48 samples/run
특수 샘플의 종류 순환 종양 DNA, 혈액
종 카테고리 인간
기술 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV), 유전자 재배열

* Pierian Knowledgebase에 따름, 2023년 2월 현재.

* NovaSeq 6000Dx Instrument(연구 모드)는 2차 분석을 위해 별도의 독립형 DRAGEN Server가 필요합니다. NovaSeq 6000Dx Instrument(연구 모드)의 온보드 호환성이 곧 제공될 예정입니다.

그림

낮은 VAF에서의 SNV 검출

각각의 단일 염기서열 변이(SNV)에 대한 대립유전자 빈도(VAF)가 알려진 합성 대조군 샘플은 0.20%~0.50% VAF의 다양한 값으로 희석되고 TruSight Oncology 500 ctDNA v2로 분석되었습니다.

 

낮은 VAF에서 삽입/결실 검출

각 삽입 또는 결실에 대해 VAF가 알려진 합성 대조 샘플들이 0.20%~0.50%의 VAF 범위의 값으로 희석되었고, TruSight Oncology 500 ctDNA v2로 분석되었습니다.

 

종양 정상 검출과 비교하여 높은 TMB 상관성

생식세포 및 CH 변이 필터링에 대한 고급 바이오인포매틱스를 활용하는 TSO 500 ctDNA v2의 Tumor-only 워크플로우는 종양 정상 워크플로우에 비해 일치성이 높은 bTMB를 생성합니다.

 

면역 종양학 연구를 위한 민감한 MSI 검출

현미부수체 불안정성(MSI)은 알려진 MSI-High 상태의 3개의 세포주 (샘플 1~3)에서 평가되었으며, 약 2300개의 동종중합체 부위를 평가하여 종양 분획이 0.3%까지 검출되었습니다.

 

CNV의 분석 성능, 증폭에 대한 LOD가 ≥1.3배이며 결실에 대한 LOD는 ≤0.6입니다

시작 복사본이 적기 때문에 검출 한계에 빠르게 접근하여 상대적으로 MYC 검출이 더 낮았습니다.  Illumina data on file, 2023.

 

LOD(0.5%)로 검출하는 유전자 재배열에 대한 분석 성능

VAF는 근거 리드의 총 수를 절단점의 두 측면의 뎁스 중 더 높은 뎁스로 나누어 계산합니다. Illumina data on file, 2023.

 

자원

축소판

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 비디오

Illumina는 TruSight Oncology ctDNA 500 v2로 순환 종양의 분석을 개선했습니다. 비디오에서 새로운 기능과 이점에 대해 알아보세요.

 

TruSight Oncology 500 제품 포트폴리오에 대해 자세히 알아보세요.

수동 프렙 키트 (15)

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples)

20105899

TSO 500 ctDNA v2 Manual Kit

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

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Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Manual Kit

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

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Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Manual Kit

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples) plus Velsera Interpretation Report

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TSO 500 ctDNA v2 Manual Kit + Velsera Interpretation Report

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

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Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Manual Kit + Velsera Interpretation Report

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

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Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Manual Kit + Velsera Interpretation Report

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48 samples)

20039252

TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (Includes DNA library prep and enrichment reagents. Does not include NovaSeq core reagents)

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit plus Velsera Interpretation Report (16 indexes, 48 Samples) 

20043410

Includes library prep and enrichment reagents, plus data interpretation reports (through Velsera Clinical Genomics Workspace software). Does not include NovaSeq System Core Reagents.

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S2 (48 samples)

20101995

Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S2 Core consumables

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit, for use with NovaSeq 6000 S4 (48 samples)

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Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S4 Core consumables

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S2 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

20102000

Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S2 Core consumables + Velsera report

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TruSight Oncology 500 ctDNA Kit for use with NovaSeq 6000 S4 plus Velsera interpretation report (16 indexes, 48 samples)

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Combination SKU for TSO500 ctDNA and the NovaSeq 6000 S4 Core consumables + Velsera report

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 (24 samples) plus Illumina Connected Insights Software

20105911

TSO 500 ctDNA v2 Manual Kit + Illumina Connected Insights Software

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Illumina Connected Insights Software, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (24 samples)

20105913

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Manual Kit+ Illumina Connected Insights Software

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Illumina Connected Insights Software, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

20105914

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 plus Illumina Connected Insights Software, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (24 samples)

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인덱스 어댑터 (4)

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034701

UMI DNA Index Anchors (Plate = 20027219, Box = 20032119) + Nextera Compatible Unique Dual Index A (Sales Kit = 20027213, Plate = 20025019, Box = 20026121)

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IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034702

UMI DNA Index Anchors (Plate = 20027219, Box = 20032119) + Nextera Compatible Unique Dual Index B (Sales Kit = 20027214, Plate = 20025080, Box = 20026930)

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IDT for Illumina UMI DNA/RNA Index Anchors Set A for Automation

20066404

Includes one box of 96 IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set A for Automation sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation.

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IDT for Illumina UMI DNA/RNA Index Anchors Set B for Automation

20063213

Includes one box of 96 IDT for Illumina - UMI DNA/RNA UD Indexes Set B for Automation sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina - UMI DNA Index Anchors for Automation.

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시약 (4)

NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028314

Includes one S2 flow cell, one buffer cartridge, one cluster cartridge, and one sequencing cartridge to support a 300-cycle run on the NovaSeq 6000 System.

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NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300 cycles)

20028312

Includes one S4 flow cell, one buffer cartridge, one cluster cartridge, and one sequencing cartridge to support a 300-cycle run on the NovaSeq 6000 System.

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NovaSeq™ X Series 1.5B Reagent Kit (300 Cyc)

20104705

This reagent kit provides one NovaSeq X Series 1.5B flow cell (with 2- lanes) and reagent consumables to support a single flow cell 300 cycles run on the NovaSeq X and NovaSeq X Plus systems.

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NovaSeq X Series 10B Reagent Kit (300 Cycle)

20085594

This reagent kit provides one NovaSeq X Series 10B flow cell (with 8- lanes) and reagent consumables to support a single flow cell 300 cycles run on the NovaSeq X and NovaSeq X Plus systems.

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소프트웨어 및 정보학 (15)

Illumina DRAGEN Server v4

20051343

Includes Advance Exchange support for the first year. Requires purchase of annual DRAGEN license.

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ICA Basic Annual Subscription

20044874

Illumina Connected Analytics (ICA) Basic Annual Subscription. This product includes 1 year of access to ICA Basic, including sequencing instrument connectivity, data management capabilities, and access to pre-packaged analysis tools.

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ICA Professional Annual Subscription

20044876

Illumina Connected Analytics (ICA) Professional Annual Subscription. This product includes 1 year of access to ICA, including sequencing instrument connectivity, data management capabilities, access to pre- packaged tools, and the ability to create customized workflows composed of tools, pipelines, data warehouses, and notebooks.

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ICA Enterprise Annual Subscription

20038994

Illumina Connected Analytics (ICA) Enterprise Annual Subscription. This product includes 1 year of access to ICA Enterprise, including sequencing instrument connectivity, data management capabilities, custom and pre-packaged analysis tools, and the Base module for data warehousing and mining. ICA Enterprise also includes optional HIPAA BAA (US-only), single sign-on (SSO), and a service level agreement (SLA).

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ICA Enterprise Srvc & Compliance Add-on

20066830

Illumina Connected Analytics (ICA) Compliance enables single sign-on (SSO), multi-factor authentication (MFA), HIPAA BAA (US-only), and a Service Level Agreement (SLA) for an ICA Basic Annual Subscription.

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Illumina Analytics - 1 iCredit

20042038

iCredits are used for data storage and analysis on either BaseSpace Sequence Hub or Illumina Connected Analytics.

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Illumina Analytics  Starter Pack - 1,000 iCredits

20042039

iCredits are used for data storage and analysis on either BaseSpace Sequence Hub or Illumina Connected Analytics.

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Illumina Analytics  - 5,000 iCredits

20042040

iCredits are used for data storage and analysis on either BaseSpace Sequence Hub or Illumina Connected Analytics.

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Illumina Analytics  - 50,000 iCredits

20042041

iCredits are used for data storage and analysis on either BaseSpace Sequence Hub or Illumina Connected Analytics.

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Illumina Analytics - 100,000 iCredits

20042042

iCredits are used for data storage and analysis on either BaseSpace Sequence Hub or Illumina Connected Analytics.

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Insights - Annual Subscription

20090137

Annual subscription to Illumina Connected Insights platform.

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Illumina Connected Insights – Trial Subscription

20112516

Free trial subscription for Illumina Connected Insights - for oncology.

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Illumina Connected Insights – Oncology Genome Equivalent Sample - VCF

20090138

Illumina Connected Insights pre-paid oncology samples on per genome equivalent basis starting from VCF: one genome is equivalent to 2 exomes, 3 large and 6 small panel samples. Any unused samples will automatically roll over provided that the annual subscription to Illumina Connected Insights (20090137) is renewed on an annual basis. Access to a set of oncology knowledge bases is included.

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Connected Insights Training - Remote

20092376

Illumina Connected Insights Training - Remote includes five (5) hours of product training delivered virtually.

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Informatics Professional Services - Remote

20071787

Professional services for Illumina informatics products and solutions including software implementations, pipelines and workflow development, integration, networking, migration, data ingestion projects and other informatics consultative, project-based services, performed remotely, and defined by a statement of work.

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자동화 (9)

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Automation (48 samples)

20105900

TSO 500 ctDNA v2 AutomatedKit

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Automation Kit, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (48 samples)

20105903

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Automated Kit

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Automation Kit, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (48 samples)

20105904

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Automated Kit

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Automation (48 samples) plus Velsera Interpretation Report

20105906

TSO 500 ctDNA v2 AutomatedKit + Velsera Interpretation Report

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Automation Kit plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (48 samples)

20105909

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Automated Kit + Velsera Interpretation Report

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Automation Kit plus Velsera Interpretation Report, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (48 samples)

20105910

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Automated Kit + Velsera Interpretation Report

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 for Automation (48 samples) plus Illumina Connected Insights Software

20105912

TSO 500 ctDNA v2 AutomatedKit+ Illumina Connected Insights Software

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Automation Kit plus Illumina Connected Insights Software, for Use with NovaSeq 6000 S2 Flow Cell (48 samples)

20105915

Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S2 FC Automated Kit+ Illumina Connected Insights Software

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TruSight Oncology 500 ctDNA v2 Automation Kit plus Illumina Connected Insights Software, for Use with NovaSeq 6000 S4 Flow Cell (48 samples)

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Mixed Workflow TSO 500 ctDNA v2 + S4 FC Automated Kit+ Illumina Connected Insights Software

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서비스 (2)

Informatics Professional Services - Remote

20071787

Professional services for Illumina informatics products and solutions including software implementations, pipelines and workflow development, integration, networking, migration, data ingestion projects and other informatics consultative, project-based services, performed remotely, and defined by a statement of work.

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Connected Insights Training - Remote

20092376

Illumina Connected Insights Training - Remote includes five (5) hours of product training delivered virtually.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

자주 묻는 질문

TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 <4일 만에 혈장 샘플을 통한 CGP를 가능하게 하는, 매우 민감하고 최적화된 액체 생검 assay입니다. TruSight Oncology 500 ctDNA v2는 기존 TruSight Oncology 500 ctDNA assay에 비해 더 낮은 세포유리 DNA 사용량, 더 빠른 총 소요 시간, 그리고 보다 최적화된 워크플로우를 사용하여 개선된 민감도를 제공합니다. TruSight Oncology 500TruSight Oncology 500 High-Throughput을 사용하면 조직 샘플에서 CGP를 추출할 수 있습니다. 다른 차이점은 이 페이지에 있는 비교표를 참조하세요.

TruSight Oncology 500 ctDNA v2 분석 워크플로우는 DRAGEN v4 또는 v3 서버 또는 Illumina Connected Analytics 플랫폼에서 실행되는 기기 외 소프트웨어를 사용하여 간략한 샘플 지표, 검출된 변이, TMB 및 MSI 점수 등 샘플 데이터 아웃풋을 생성합니다. 3차 분석은 Illumina Connected Insights 또는 Velsera CGW로 지원됩니다.

또한 BaseSpace Sequence Hub 평가 앱을 평가 전용으로 사용할 수 있습니다. Illumina는 이 앱을 위한 기술 지원을 제공할 의무가 없습니다. 액세스는 30일로 제한됩니다.

 호환되는 분석 소프트웨어 제품에 대해 더 알아보세요.

DRAGEN Server에서의 분석은 24개의 라이브러리를 사용하는 S4 런의 경우 20~24시간, 8개의 라이브러리를 사용하는 S2 런의 경우 약 9~12시간이 소요됩니다.

그렇습니다. 자체 소프트웨어로 분석을 수행하실 수 있습니다. 하지만 Illumina는 이 경우 직접적으로 기술 지원을 제공할 수 없습니다.

>90% 민감도 및 >95% 특이도로 SNV의 ~0.2% VAF 검출을 달성하기 위해 대략 20 ng의 cfDNA를 사용하길 권장합니다. 그러나, 이 assay는 10~30 ng의 cfDNA 사용량 범위를 허용할 수 있습니다.

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