Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit

A streamlined workflow offering highly sensitive detection and characterization of common respiratory viruses, including SARS-CoV-2 strains.

< 9시간 라이브러리 준비 시간

Assay 시간

< 2시간 라이브러리 준비 시간

수작업 시간

10~100 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

Respiratory Virus Oligos Panel V2(RVOP v2, 카탈로그 번호 20044311)는 이제 Respiratory Virus Oligo Panel V2, library prep and enrichment reagents, and index adapters를 포함하는 포괄적인 키트(세트 A-D)로 판매됩니다. 독립형 RVOP v2 제품 또는 개별 구성품은 MyIllumina를 통해 구입하실 수 있습니다.

Overview

이전에 Respiratory Virus Oligo Panel (RVOP) 제품은 Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit 및 SARS-CoV-2 and influenza A/B와 같은 일반적인 호흡기 바이러스를 검출하는 효과적이고 간소화된 방법을 제공합니다. 

  • Understand variant analysis for viral evolution or viral surveillance1

  • Determine viral transmission patterns and predict resurgence

  • Identify and characterize co-infections and their role in complex diseases

Target enrichment for respiratory virus detection

Target enrichment through the hybrid–capture method allows for highly sensitive detection without requiring the high read depth needed for shotgun metagenomic sequencing. Additionally, this method allows for dramatically larger probe panels for comprehensive profiling compared to amplicon sequencing while producing whole-genome sequencing data for the targeted viruses.

Streamlined solution for viral applications

This comprehensive workflow integrates library preparation, target enrichment, sequencing, and data analysis, giving researchers and public health scientists the ability to monitor multiple viruses and variants with one workflow


Specifications

Required products

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kits contain the Respiratory Virus Oligo Panel (RVOP) v2, Illumina RNA Prep with Enrichment, and one of four available unique dual indexing plates. To run 384 samples at once, order all four sets (A, B, C, and D). Additional Illumina reagents required include an Illumina sequencer and the appropriate sequencing reagents and flow cell(s).
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Applications

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit, Illumina sequencing, and DRAGEN secondary analysis offer a streamlined workflow that enables the detection and characterization of over 40 common human respiratory viruses. 

워크플로우 예시


Project recommendations

기기 권장 샘플 수 리드 길이
NextSeq 550 시스템 High output: 384 samples, 1M clusters and a minimum of 1M single-end reads per sample 1 × 150 bp

Related applications and methods

Documentation

제품 관련 자료

Compare

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit
Assay 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간 < 9시간 라이브러리 준비 시간
자동화 기능 리퀴드 핸들링 로봇 리퀴드 핸들링 로봇
자동화 상세 정보 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기
콘텐츠 사양 SARS-CoV-2, 인플루엔자 A 및 B 바이러스, 아데노바이러스, 리노바이러스, 호흡기 세포융합 바이러스, 기타 흔한 호흡기 바이러스를 포함한 약 40종의 흔한 호흡기 바이러스를 표적으로 하고 특성을 규명한다. 호흡기 병원체 DNA와 RNA를 동시에 검출하고 항균 내성(AMR) 유전자 발현을 동시에 프로파일링합니다.
설명 SARS-CoV-2 및 기타 흔한 호흡기 바이러스를 검출하고 분석하기 위한 간소화된 워크플로우. 독립적 설계는 여러 관심 대상 검체 유형 전반에서 병원성 바이러스의 광범위한 식별을 가능하게 한다. 호흡기 감염 및 동시 감염을 식별하고, 항균제 내성 표지자를 검출하며, 바이러스 진화 및 전파를 연구하기 위해 주요 병원체(SARS-CoV-2 및 Flu A/B 바이러스)의 균주 유형 분석을 실시한다.
수작업 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간 < 2시간 라이브러리 준비 시간
사용량 10~100 ng 용량 기준(농도 의존적 아님)
기기 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템
작용 기전 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계
방법 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
멀티플렉싱 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플
핵산 종류 DNA, RNA DNA, RNA
샘플의 종류 세부 사항 비강 면봉 및 세척, 폐수 등
종 카테고리 인간, 바이러스 진균, 바이러스, 세균
종 세부 사항 최근 인플루엔자 바이러스 균주 및 SARS-CoV-2 등 일반적인 호흡기 바이러스를 검출합니다. 패널에는 품질 기능으로 인간 표적에 대한 프로브가 포함되어 있으므로 분석된 모든 샘플의 인간 표적을 검출합니다. 호흡기 병원체(180+ 세균, 50+ 진균, SARS-CoV-2를 포함한 40+ 바이러스) 및 항균 내성 대립유전자(1200+)를 검출한다.
기술 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 단일 염기 다형성(SNP), 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel)

Selection tools

Figures

호흡기 바이러스 검출을 위한Enrichment workflow

호흡기 바이러스 검출을 위한 간소화된 NGS 워크플로우는 검체 준비, 라이브러리 프렙, 표적 농축, 염기서열 분석, 자료 분석을 통합합니다.

고감도 SARS-CoV-2 검출

정의된 양의 바이러스 복제물을 첨가한 인간 타액 RNA의 적정 실험에서, Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit는 최저 2개의 SARS-CoV-2 바이러스 RNA 복제물로부터 바이러스 판독을 검출했습니다.

Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit에 의해 검출된 바이러스

Respiratory Virus Oligo Panel에는 흔한 호흡기 바이러스, 최근 독감 균주, SARS-CoV-2, 양성 대조물질로 작용하는 인간 프로브를 검출하는 7800개의 프로브가 포함되어 있다. 모든 프로브는 80량체 올리고이며, 매우 가깝게 이격되어 패널의 모든 바이러스에 대한 완전한 게놈 커버리지를 제공합니다.

Human coronavirus 229E Human parainfluenza virus 1 Human bocavirus 4 NI strain HBoV4-NI-385 Influenza A virus (A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9))
Human coronavirus NL63 Human parainfluenza virus 2 KI polyomavirus Stockholm 60 Influenza A virus (A/Hong Kong/1073/99(H9N2))
Human coronavirus OC43 Human parainfluenza virus 3 WU Polyomavirus Influenza A virus (A/Texas/50/2012(H3N2))
Human coronavirus HKU1 Human parainfluenza virus 4a Human parechovirus type 1 PicoBank/HPeV1/a Influenza A virus (A/Michigan/45/2015(H1N1))
SARS-CoV-2 Human metapneumovirus (CAN97-83) Human parechovirus 6 Influenza B virus (B/Lee/1940)
Human adenovirus B1 Respiratory syncytial virus (type A) Human rhinovirus A89 Influenza B virus (B/Wisconsin/01/2010)
Human adenovirus C2 Human Respiratory syncytial virus 9320 (type B) Human rhinovirus C (strain 024) Influenza B virus (B/Brisbane/60/2008)
Human adenovirus E4 Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H1N1)) Human rhinovirus B14 Influenza B virus (B/Colorado/06/2017)
Human bocavirus 1 (Primate bocaparvovirus 1 isolate st2) Influenza A virus (A/Korea/426/1968(H2N2)) Human enterovirus C104 strain: AK11 Influenza B virus (B/Washington/02/2019)
Human bocavirus 2c PK isolate PK-5510 Influenza A virus (A/New York/392/2004(H3N2)) Human enterovirus C109 isolate NICA08-4327 Human control genes
Human bocavirus 3 Influenza A virus (A/goose/Guangdong/1/1996(H5N1))    

Illlumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set A (96 indexes, 96 samples)

20100469

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 하이브리드화 시약, Respiratory Virus Oligos Panel V2, IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set A를 포함한 완전한 하이브리드화 기반 인리치먼트 키트. 각 키트는 하이브리드화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 하이브리드화 반응에서 96개의 샘플에 사용하기에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지의 흔한 인간 호흡기 바이러스의 인리치먼트를 가능하게 하고 각 표적 바이러스에 대한 전장 유전체 시퀀싱을 생성합니다.

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set B (96 indexes, 96 samples)

20100470

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, Respiratory Virus Oligo Panel v2 및 IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set B를 포함한 완전한 혼성화 기반 증균 키트. 각 키트는 혼성화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 혼성화 반응에서 96개의 검체에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지 공통 인간 호흡기 바이러스의 농축을 가능하게 하고 각 표적 바이러스에 대한 전체 유전체 서열을 생성한다.

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set C (96 indexes, 96 samples)

20100471

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, Respiratory Virus Oligo Panel v2, Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set C용 IDT®를 포함한 완전한 혼성화 기반 증균 키트. 각 키트는 혼성화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 혼성화 반응에서 96개의 검체에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지 공통 인간 호흡기 바이러스의 농축을 가능하게 하며 각 표적 바이러스에 대한 전체 유전체 서열을 생성한다.

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Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit Set D (96 indexes, 96 samples)

20100472

Illumina RNA Prep with Enrichment 라이브러리 준비 및 혼성화 시약, Respiratory Virus Oligo Panel v2 및 IDT® for Illumina® DNA/RNA UD Indexes Set D를 포함한 완전한 혼성화 기반 증균 키트. 각 키트는 혼성화 반응당 3개의 라이브러리가 있는 32개의 혼성화 반응에서 96개의 검체에 충분한 시약을 제공합니다. SARS-CoV-2 및 인플루엔자를 포함한 40가지 공통 인간 호흡기 바이러스의 농축을 가능하게 하며 각 표적 바이러스에 대한 전체 유전체 서열을 생성한다.

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선택 품목 요약

제품

수량

단가

FAQs

The Respiratory Virus Enrichment Kit supports a broad range of sample sources, including formalin-fixed, nasal swabs, nasal washes, and wastewater samples.

The Respiratory Virus Enrichment Kit library prep and enrichment protocol takes < 9 hr with < 2 hr of hands-on time.

When used with the MiniSeq Rapid Reagent Kit, MiniSeq Sequencing System, and DRAGEN RNA Pathogen Detection app, the entire process can be completed in < 24 hr. Learn more about the fast detection of respiratory viruses.

Yes, because this kit uses hybridization-based enrichment and contains probes for over 40 different viruses, multiple viruses can be detected. Learn more about the detection and characterization of respiratory viruses using the Illumina RNA Prep with Enrichment.

The Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit includes free usage of the DRAGEN RNA Pathogen Detection app and the DRAGEN Microbial Enrichment Plus, both of which analyze pathogen data and generate consensus sequences.

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발전된 chemistry, 광학, 인포매틱스가 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.

TruSight Oncology 500 v2

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 주요 바이오마커(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

Illumina DNA Prep

광범위한 시퀀싱 애플리케이션에서 사용할 라이브러리를 준비하기 위한 빠르고 통합된 워크플로우입니다.

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