표적 인리치먼트(Target Enrichment)를 포함한 SARS-CoV-2, 인플루엔자, 아르보바이러스, 간염을 포함한 200개 이상의 바이러스 및 아형의 전장 유전체 시퀀싱 및 특성 규명.
Assay 시간
수작업 시간
사용량
바이러스 감시 패널 v2 키트를 통해 연구자들은 SARS-CoV-2, 인플루엔자, 아르보바이러스, 간염을 포함한 광범위한 바이러스를 규명할 수 있는 전장 유전체 염기서열분석(whole-genome sequencing, WGS) 자료를 획득할 수 있습니다.
하이브리드 캡처 방법을 통한 표적 인리치먼트(Target Enrichment). 표적 인리치먼트(Target Enrichment)는 샷건 메타지노믹스 시퀀싱에 필요한 높은 리드 깊이 없이 여러 바이러스의 WGS를 가능하게 하여 바이러스 진화 및 광범위한 바이러스 감시 시스템에 대한 인사이트를 제공합니다.1 또한, 앰플리콘 시퀀싱과 같은 다른 표적 재시퀀싱(targeted resequencing) 방법과 비교하여, 하이브리드 캡처는 돌연변이 시퀀스 를 획득하고 식별하는데 더 큰 능력을 제공하여 빠르게 진화하는 바이러스에 대한 발병 감시 시스템에 효과적입니다.
이 포괄적 워크플로우는 라이브러리 준비, 표적 인리치먼트(Target Enrichment), 시퀀싱, 데이터 분석을 통합하여 연구자와 공중 보건 과학자가 하나의 패널/워크플로우로 여러 고위험 바이러스를 모니터링할 수 있도록 합니다.
| Assay 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 시간 |
|---|---|
| 자동화 기능 | 리퀴드 핸들링 로봇 |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 설명 | Illumina RNA Prep with Enrichment가 포함된 Viral Surveillance Panel은 66개의 RNA 및 DNA 바이러스 병원체의 바이러스 발생 검출 및 모니터링을 지원하는 최적화된 워크플로우를 제공합니다. |
| 수작업 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 시간 |
| 사용량 | 10~100 ng |
| 기기 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 |
| 작용 기전 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 전장 유전체 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 |
| 멀티플렉싱 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 |
| 핵산 종류 | DNA, RNA |
| 종 카테고리 | 바이러스 |
| 가닥 특이성 | 비가닥(Non-stranded) |
| 기술 | 시퀀싱 |
전체 키트에는 정제 비드 및 인덱스 어댑터를 포함하여 라이브러리 준비 및 인리치먼트에 필요한 모든 것이 포함되어 있습니다. 최대 384개 샘플의 규모가 큰 런에는 최대 4개의 키트를 사용할 수 있습니다.
Viral Surveillance Panel v2 키트는 200개 이상의 RNA 및 DNA 바이러스에 대한 발생 검출 및 모니터링을 지원하는 최적화된 워크플로우를 제공합니다.
Viral Surveillance Panel v2 키트(세트 A~D)
차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)은 코로나바이러스의 새로운 균주 및 기타 새로운 감염병 제제의 식별을 통해 효과적인 유전체 감시 시스템 전략을 제공합니다.
NGS can identify novel coronavirus variants, track COVID-19 transmission, and more. Compare NGS methods for various coronavirus sequencing goals.
전염병의 지역사회 수준 모니터링, 돌연변이 추적 및 변이 추세 추적을 위한 NGS를 통한 폐수 감시 시스템에 대해 알아보세요.
| Viral Surveillance Panel | Illumina Respiratory Virus Enrichment Kit | Respiratory Pathogen ID/AMR Enrichment Panel Kit | |
|---|---|---|---|
| Assay 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 시간 | < 9시간 라이브러리 준비 시간 |
| 자동화 기능 | 리퀴드 핸들링 로봇 | 리퀴드 핸들링 로봇 | 리퀴드 핸들링 로봇 |
| 자동화 상세 정보 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 | 사용 가능한 자동화 방법 살펴보기 |
| 설명 | Illumina RNA Prep with Enrichment가 포함된 Viral Surveillance Panel은 66개의 RNA 및 DNA 바이러스 병원체의 바이러스 발생 검출 및 모니터링을 지원하는 최적화된 워크플로우를 제공합니다. | SARS-CoV-2 및 기타 흔한 호흡기 바이러스를 검출하고 분석하기 위한 간소화된 워크플로우. 독립적 설계는 여러 관심 대상 검체 유형 전반에서 병원성 바이러스의 광범위한 식별을 가능하게 한다. | 호흡기 감염 및 동시 감염을 식별하고, 항균제 내성 표지자를 검출하며, 바이러스 진화 및 전파를 연구하기 위해 주요 병원체(SARS-CoV-2 및 Flu A/B 바이러스)의 균주 유형 분석을 실시한다. |
| 수작업 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 시간 | < 2시간 라이브러리 준비 시간 |
| 사용량 | 10~100 ng | 10~100 ng | 용량 기준(농도 의존적 아님) |
| 기기 | MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 | MiSeq 시스템, NextSeq 550 시스템, MiniSeq 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템, MiSeq i100 시스템 |
| 작용 기전 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 | 온비드·태그멘테이션(on-bead tagmentation) 후 단일 혼성화 단계 |
| 방법 | 표적 DNA 시퀀싱, 전장 유전체 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 | 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 | 표적 DNA 시퀀싱, 표적 RNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 |
| 멀티플렉싱 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 | 고유한 듀얼 인덱스(unique dual index)를 사용하여 한 번의 런으로 최대 384개 샘플 |
| 핵산 종류 | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA, RNA |
| 종 카테고리 | 바이러스 | 인간, 바이러스 | 진균, 바이러스, 세균 |
| 가닥 특이성 | 비가닥(Non-stranded) | ||
| 기술 | 시퀀싱 | 시퀀싱 | 시퀀싱 |
Library Prep and Array Kit Selector
Find the right sequencing library preparation kit or microarray for your needs. Filter by method, species, and more. Compare, share, and order kits.
모든 RNA/DNA가 시퀀싱되는 샷건 메타지노믹스 시퀀싱과 비교하여, 표적 하이브리드 캡처는 숙주 및 비표적 미생물에 대한 불필요한 시퀀싱을 줄여 줍니다.
Viral Surveillance Panel v2 키트의 표적 인리치먼트 프로브는 전체 바이러스 유전체에 대한 균일한 커버리지를 제공합니다. 바이러스 대조군은 알려진 복제수의 바이러스 대조군을 10 ng 인간 RNA/DNA 혼합물과 혼합하여 제조했습니다. 라이브러리는 Viral Surveillance Panel v2 키트 워크플로우에 따라 준비되고 시퀀싱되었습니다.
Viral Surveillance Panel v2 키트 또는 샷건 시퀀싱을 사용하여 폐수에서 검출된 바이러스.a 바이러스 농도가 낮은 샘플은 Viral Surveillance Panel v2 키트를 사용하면 손쉽게 검출할 수 있습니다.
검출된 바이러스의 전체 목록은 데이터 시트 또는 바이러스 목록 스프레드시트를 참조하세요.
Viral Surveillance Panel v2 바이러스 목록 스프레드시트 다운로드
a. Colorado State University의 연구진이 샘플을 채취하고, 정제된 총 핵산을 Illumina로 배송하여 검사를 실시하도록 했습니다. 라이브러리를 준비하고 100 ng의 총 핵산을 사용하여 시퀀싱했습니다
패널은 세계보건기구(WHO)가 공중 보건에 대한 중요한 위험으로 확인한 66개 바이러스를 포함하여 200개 이상의 바이러스와 아형을 검출합니다.2
| Viral Surveillance Panel에 포함되어 있음 | ||||
| Adeno-associated virus 2 | Human adenoviruses(A~G종) | Mamastrovirus | "Rotaviruses(A, B, C, H종) | |
| Aichi virus 1 | Human bocavirus | Marburg virus | Rubella virus | |
| Aigai virus | Human coronaviruses(4종) | Mayaro virus | Sabia virus | |
| Bombali virus | Human cytomegalovirus | Measles virus | Salivirus A | |
| Bourbon virus | Human immunodeficiency viruses(1 및 2) | Menangle virus | Sandfly fever Sicilian virus | |
| Cache Valley virus | Human metapneumovirus | MERS-CoV | Sapovirus | |
| California encephalitis virus | Human papillomaviruses(28가지 유형) | Mpox virus | SARS-CoV | |
| Chapare virus | Human parainfluenza viruses(1~4형) | Mumps virus | SARS-CoV-2 | |
| Chikungunya virus | Human parechovirus | Murray Valley encephalitis virus | Semliki Forest virus | |
| Colorado tick fever virus | Human parvovirus B19 | Nipah virus | Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus | |
| Coxsackieviruses(A 및 B) | Influenza A virus(20가지 아형) | Norovirus | Sindbis virus | |
| Crimean-Congo hemorrhagic fever virus | Influenza B virus(두 계통 모두) | Omsk hemorrhagic fever virus | Snowshoe hare virus | |
| Dengue viruses(4가지 유형) | Influenza C virus | Onyong-nyong virus | Sosuga virus | |
| Ebola viruses(6종) | Jamestown Canyon virus | Oropouche virus | St. Louis encephalitis virus | |
| Echovirus | Japanese encephalitis virus | Poliovirus | Tacheng tick virus 2 | |
| Enteroviruses(A~D) | Junin virus | Polyomavirus(13종) | Tahyna virus | |
| Epstein-Barr virus | Kyasanur Forest disease virus | Powassan virus | Tick-borne encephalitis virus | |
| Equine encephalitis viruses(3종) | La Crosse virus | Punta Toro virus | Torque teno virus (Anelloviruses) | |
| Guanarito virus | Lassa virus | Rabies virus | Toscana virus | |
| Hantaviruses(22종) | Lloviu virus | Ravn virus | Usutu virus | |
| Heartland virus | Lujo virus | Respiratory syncytial virus(A형 및 B형) | Varicella-zoster virus | |
| Hendra virus | Lymphocytic choriomeningitis virus | Rhinoviruses(A~C종) | Variola virus | |
| Hepatitis viruses(A~E) | Lyssavirus | Rift Valley fever virus | West Nile virus | |
| Herpes simplex viruses(1 및 2) | Machupo virus | Ross River virus | Yellow fever virus | |
| Zika virus | ||||
Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set A (96 samples)
20108081
Viral Surveillance Panel V2 Kit (VSP V2) is a hybrid capture enrichment kit that provides whole genome sequencing of over 200 viruses and subtypes of public health concern.
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Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set B (96 samples)
20108082
Viral Surveillance Panel V2 Kit (VSP V2) is a hybrid capture enrichment kit that provides whole genome sequencing of over 200 viruses and subtypes of public health concern.
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Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set C (96 samples)
20108083
Viral Surveillance Panel V2 Kit (VSP V2) is a hybrid capture enrichment kit that provides whole genome sequencing of over 200 viruses and subtypes of public health concern.
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Illumina Viral Surveillance Panel v2 Kit, Set D (96 samples)
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Viral Surveillance Panel V2 Kit (VSP V2) is a hybrid capture enrichment kit that provides whole genome sequencing of over 200 viruses and subtypes of public health concern.
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단가
Viral Surveillance Panel v1은 공중 보건 우려 대상이 되는 66개 바이러스에 대한 결과를 제공합니다. Viral Surveillance Panel v2는 이 표적 목록을 200개 이상의 바이러스 및 아형으로 확장합니다. Viral Surveillance Panel v2에는 Viral Surveillance Panel v1에 포함되지 않은 Illumina 정제 비드가 포함되어 있습니다.
양호한 품질의 샘플인 경우, 리드 깊이는 150 bp의 리드 길이를 갖고 샘플 당 최소 2M 개의 페어드 엔드 리드(paired-end·reads)를 가지는 경우입니다. 폐수와 같은 보다 복잡한 샘플의 경우, 샘플당 최소 8M 개의 페어드 엔드 리드(paired-end·reads)가 권장됩니다.
예, dsRNA, ssRNA, dsDNA, 및 ssDNA 바이러스가 검출됩니다.
여기에서 VSPv2의 바이러스 및 아형의 전체 목록을 다운로드하세요.
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클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
고도로 민감하고 포괄적인 호흡기 병원체 식별 및 항균제 내성 인사이트를 제공하는 라이브러리 준비 및 강화 키트.
다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.
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