암 후성유전학 연구 방법으로 종양 형성 경로 및 암 진행에 대한 인사이트 제공
암은 유전체와 관련된 질병이지만 유전자 돌연변이는 그 중 하나의 요인에 불과합니다. 비유전적 변화도 표현형에 영향을 미칩니다. 암의 후성유전학 환경을 이해하는 것은 암의 시작, 진행 및 치료 반응을 모델링하는 데 점점 더 중요해지고 있습니다. 암 후성유전학 연구는 세포가 DNA 메틸화와 같은 과정을 통해 유전자 활동을 조절하는 방법을 밝혀낼 수 있습니다.
후성유전체학 기술은 암 유전자 또는 약물 내성의 조절과 관련된 세포 바이오마커를 식별할 수 있습니다.
메틸화 시퀀싱은 암의 후성유전적 변화를 연구하기 위한 강력한 접근 방식을 제공하며, 유전자 조절 및 종양 진행에 영향을 미치는 DNA 메틸화 패턴의 단일 염기 해상도를 제공합니다. 차세대 시퀀싱(NGS)을 사용하여 연구자가 종양 발생과 관련된 메틸화 이벤트를 프로파일링할 수 있습니다. 특정 방법은 단일 워크플로우에서 유전적 변이와 메틸화 패턴을 모두 검출할 수 있으므로, 체세포 돌연변이 및 비정상적인 메틸화 시그니처를 식별하는 데 중요한 유전체 및 후성유전체 인사이트를 동시에 확보하는 것이 가능합니다.
다음 사항에 대해 더 알아보세요.
전장 유전체 메틸화 시퀀싱을 통해 유전체 전체의 시토신 메틸화를 검출합니다.
인핸서 및 전사 인자 결합 부위를 포함하여 새롭게 떠오르는 관심 영역을 포착합니다.
최소한의 DNA 투입만 필요하므로 액체 생검과 같은 암 샘플에 적합합니다.
비침습적 암 검출 및 모니터링 연구를 위한 세포유리 DNA(cfDNA) 샘플 분석을 가능하게 합니다.
메틸화 어레이를 통해 연구자은 단일 사이트 해상도에서 암세포의 후성유전체 전반에 걸친 메틸화를 정량적으로 조사할 수 있습니다. 어레이 기반 메틸화 프로파일링은 CpG 섬, 선택된 CHH 사이트, 인핸서, 열린 크로마틴 영역 및 전사 인자 결합 부위에 대한 매우 정확하고 표적화된 조사를 제공합니다.* 대용량 연구 방법으로서 어레이는 대안에 비해 샘플당 비용이 낮습니다.
메틸화 어레이 프로토콜은 > 98%의 assay 재현성과 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 샘플을 지원하는 사용이 용이하고 간소화된 워크플로우를 갖추고 있어, 바이오뱅킹 조직에 대한 메틸화 어레이의 적용 가능성을 높입니다.
*CpG: 시토신 바로 뒤에 구아닌이 오는 유전체 영역; CHH: 메틸화가 발생할 수 있는 기타 유전체 영역으로, 시토신 바로 뒤에 구아닌 이외의 뉴클레오타이드가 오는 것으로 정의됨(H = A, T 또는 C)
비용 효과적인 메틸화 프로파일링 제공
표적 부위에서 매우 정밀한 메틸화 측정치를 제공합니다.
확장성이 뛰어난 샘플 처리를 가능하게 합니다.
낮은 계산 부담으로 간단한 데이터 분석을 제공합니다.
암 연구자가 시퀀싱을 이용한 트랜스포사제 접근 가능 크로마틴(ATAC-Seq) assay를 사용하여 조절 요소에 대한 사전 지식 없이 유전체 전반에 걸친 후성유전적 특징을 연구할 수 있습니다. ATAC-Seq는 genomic DNA를 열린 크로마틴 부위에 우선적으로 삽입하고 시퀀싱 프라이머를 첨가하는 고활성 전위효소인 Tn5에 노출시킵니다. 유전체 또는 전사체 프로파일링을 포함할 수 있는 후속 NGS 분석은 유전체 전반의 크로마틴 접근성에 대한 인사이트를 제공합니다.
편향되지 않은 발견을 위해 사전 정의된 타겟 없이 유전체 전반에 걸쳐 열린 크로마틴을 밝혀냅니다.
FAIRE-Seq 및 DNase-Seq보다 낮은 샘플 투입으로 귀중한 암 샘플을 조사합니다.
간소화된 워크플로우로 신속한 결과를 도출합니다.
열린 크로마틴 영역이 발현되고 있는지 직접 확인할 수 있는 RNA-Seq 연구를 보완합니다.
chromatin immunoprecipitation sequencing(ChIP-Seq)은 전사 인자 및 기타 단백질에 대한 유전체 전반의 DNA 결합 부위를 식별하는 강력한 방법입니다. 이 방법으로 일부 암의 발생과 진행에 중요한 역할을 하는 유전자 조절 사건 및 생물학적 경로에 대한 인사이트를 도출할 수 있습니다. Illumina는 ChIP-Seq를 사용하여 유전자 조절에 대한 유전체 전반의 조사를 가능하게 하는 효율적인 워크플로우 솔루션을 제공합니다.
유전체 전반에 걸쳐 전사 인자 또는 히스톤 변형에 대한 DNA 타겟을 포착합니다.
전사 인자 결합 부위 정의
RNA-Seq 및 메틸화 분석과 결합될 때 유전자 조절 네트워크를 드러냅니다.
다양한 사용량 DNA 샘플과의 호환성 제공
Cancer Research Methods Guide
이 방법 가이드에서 Illumina 시퀀싱에 대한 개요와 인기 있는 암 연구 방법에 대한 워크플로우 제안을 확인하세요.
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5-base 분석으로 복잡한 경로를 디코딩하여 멀티오믹스 인사이트 확보
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CpG 섬, 유전자, 인핸서(enhancer) 등 폭넓은 커버리지를 제공하는 강력한 메틸레이션 프로파일링 마이크로어레이(microarray)입니다. 유전 및 희귀 질환 연구, 암 연구 및 분류에 이상적입니다.
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