Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment

고감도 돌연변이 검출을 위한 빠르고 유연하며 확장 가능한 cfDNA 라이브러리 준비 키트입니다.

약 8.5~9.5시간

Assay 시간

약 2.5~3시간

수작업 시간

세포유리 DNA 10~30 ng

사용량

상세한 정보는 사양표를 확인하세요.

개요

Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment는 세포유리 DNA(cfDNA) 샘플에서 풍부도가 낮은 돌연변이를 검출하기 위한 고감도 라이브러리 준비 솔루션입니다. 워크플로우에는 오류 수정 및 위양성(false positive) 감소를 위한 고유한 분자 식별자(UMI)가 포함되어 있어 저빈도 돌연변이를 정확하고 높은 민감도로 검출할 수 있습니다. Illumina의 가장 빠르고, 가장 품질이 우수하며, 가장 견고한 sequencing by synthesis(SBS)인 XLEAP-SBS chemistry를 이제 NextSeq 2000(P4 플로우 셀) 및 NovaSeq X 시스템에서 사용할 수 있습니다.

Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment는 유통 기한이 6개월로 연장되고 변경 사항을 미리 알리는 등 검사실에서 효율성을 높일 수 있도록 제품 속성이 향상되었습니다.

빠른 워크플로우

Illumina cell-free DNA Prep with Enrichment는 향상된 함유물 이동성을 위해 Integrated DNA Technologies(IDT)의 단일 가닥 DNA(ssDNA) 및 Twist Bioscience의 이중 가닥 DNA(dsDNA)를 포함하여 Illumina 또는 타사 공급업체의 별도 구매 인리치먼트 올리고 뉴클레오티드와 호환됩니다. 이 키트는 55-2000Kb(ssDNA) 및 70-2000Kb(dsDNA) 패널 콘텐츠를 수용하여, 유연한 연구 설계를 지원합니다. 시퀀싱 준비가 된 라이브러리는 약 8.5~9.5시간 만에 준비되며, 수작업 시간이 약 2.5~3시간밖에 소요되지 않아 연구자들이 하루 만에 추출된 cfDNA에서 시퀀싱까지 완료할 수 있습니다.

고성능 라이브러리 준비

Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment는 SNV, CNV, 변이로서의 삽입/결실 및 유전자 융합 등 저주파 변이를 검출합니다. 이 키트는 ≥90%의 민감도로 20 ng의 세포유리 DNA만으로 최저 0.2%의 대립유전자 빈도를 통해 작은 변이를 식별합니다.

간소화된 샘플-인사이트 워크플로우

이 키트는 (1) cfDNA로 시작한 후 (2) Illumina 중간 처리량 및 고처리량 시스템에서 시퀀싱, (3) DRAGEN for ILMN cfDNA Prep with Enrichment 앱을 사용한 매우 정확한 변이 검출(variant calling), (4) Illumina Connected Insights를 사용한 자동화된 연구 보고서 초안 생성을 통한 변이체 해석 옵션까지 이어지는 시퀀서에서 인사이트까지 수동 접점이 없는 통합된 워크플로우의 일부입니다.

유연한 콘텐츠 옵션

향상된 콘텐츠 이동성을 위해, Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment는 Integrated DNA Technologies(IDT)의 단일 가닥 DNA(ssDNA) 및 Twist Bioscience의 이중 가닥 DNA(dsDNA)를 포함하여 Illumina 또는 타사 공급업체의 별도 구매 인리치먼트 올리고 뉴클레오티드에 적합합니다. 이 키트는 55~2000 Kb(ssDNA) 및 70~2000 Kb(dsDNA) 패널 콘텐츠를 수용하여, 유연한 연구 설계를 지원합니다.

Illumina Custom Enrichment Panel v2는 동적 피드백을 제공하여 표적 커버리지(coverage)를 최적화하므로 관심 콘텐츠에 맞는 패널을 생성하는 데 권장되는 솔루션입니다. DesignStudio 소프트웨어는 사용자 지정 시퀀싱 패널을 생성하기 위한 무료, 사용이 용이한 웹 기반 assay 설계 도구입니다.

사양

필수 제품

워크플로우를 완료하려면 위에 나열된 인덱스 플레이트가 필요합니다. 수동 및 자동 워크플로우를 위한 특정 SKU가 있습니다. Illumina Custom Enrichment Panel v2는 DesignStudio를 사용하여 설계된 120 bp, 이중 가닥 프로브 패널로, 하이브리드 캡처를 위한 인리치먼트 올리고가 포함되어 있습니다.

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애플리케이션

워크플로우 예시

관련 애플리케이션 및 방법

문서

제품 관련 자료

비교하기

Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment Illumina DNA Prep with Enrichment TruSight Oncology 500 ctDNA v2
Analytical sensitivity Analytical sensitivity at 20ng: ≥ 90% (SNVs ≥0.2% and indels ≥0.5%) ≥ 95%(작은 변이, ≥ 0.5% VAF)
Analytical specificity Analytical specificity at 20ng: ≥ 99.98% (SNVs ≥0.2% and indels ≥0.5%) ≥ 99.995%(작은 변이, ≥ 0.5% VAF)
Assay 시간 약 8.5~9.5시간 ~6.5시간 정제된 핵산에서 변이체 보고까지 <4일
수작업 시간 약 2.5~3시간 ~2시간, ~2시간 라이브러리 준비 및 증균의 경우 ~2.5시간
사용량 세포유리 DNA 10~30 ng 고품질 genomic DNA 10~1,000 ng, FFPE DNA 50~1,000 ng. (혈액 및 타액의 경우 참조 가이드 확인). 세포유리 DNA 20 ng(혈장 4 ml)
기기 NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템 MiSeq 시스템, iSeq 100 시스템, NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, MiSeqDx(Research Mode), MiniSeq 시스템, NextSeq 550Dx(Research Mode), NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 NovaSeq X 시스템, NovaSeq 6000Dx(Research Mode), NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템
방법 커스텀 시퀀싱, 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트 커스텀 시퀀싱, 표적 DNA 시퀀싱, 엑솜 시퀀싱, 표적 인리치먼트 표적 DNA 시퀀싱, 표적 인리치먼트
핵산 종류 DNA DNA DNA
특수 샘플의 종류 세포유리 DNA 혈액, 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직, 타액 순환 종양 DNA, 혈액
종 카테고리 인간 기타, 인간 인간
기술 시퀀싱 시퀀싱 시퀀싱
변이 클래스 유전자 융합, 체세포 변이, 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 단일 염기 다형성(SNP), 이형접합성 소실(LOH), 체세포 변이, 생식세포 변이, 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV) 단일 염기서열 변이(SNV), 삽입 결실(Indel), 유전자 복제수 변이(CNV)

*시스템 적합성: P4 및 P3 플로우 셀 테스트됨

자원

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액체 생검 샘플의 멀티오믹스 분석
Cell-free DNA Prep with Enrichment library prep kit
전이성 전립선암의 cfDNA 전장 엑솜 시퀀싱 – 고객용 프레젠테이션

Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment: A custom enrichment assay that provides high sensitivity for somatic variants detection

DNA 입력 요구 사항을 줄이고 수작업 시간을 단축하여 작은 뉴클레오티드 변이에 대한 민감도 향상

High sensitivity somatic variant detection from formalin-fixed, paraffin-embedded samples using a versatile custom enrichment cell-free DNA (cfDNA) Library Preparation assay

Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment의 민감한 변이 검출

webinar image

다중 분석물질 액체 생검은 전립선암의 치료 내성 분석을 가능하게 합니다.

Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (16 Samples)

20104105

Includes ligation-based library prep for preparation of 16 libraries with Illumina Qualified Automation Methods, or 24 libraries manually. Enrichment reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment App on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Ligation (96 Samples)

20104106

Includes ligation-based library prep for preparation of 96 libraries with Illumina Qualified Automation Methods, or 120 libraries manually. Enrichment reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment App on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep, Enrichment (16 Reactions)

20104107

Includes fast enrichment reagents for enrichment of Illumina Cell-Free and FFPE DNA Prep libraries for a total of 16 reactions with Illumina Qualified Automation Methods, or 24 reactions manually. Library preparation reagents and enrichment panel not included. UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Cell-Free DNA: 1-4 samples per reaction during enrichment. Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charge. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: 4 samples per Whole Exome enrichment. Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), Cloud Analysis

20104103

Includes ligation based library prep and fast enrichment reagents for preparation of 192 libraries using Illumina Qualified Automation Methods, or 240 libraries manually, using 4-plex enrichment (pooling of 4 libraries in a single enrichment reaction). UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Enrichment panel not included.  Please note regarding data analysis: Cell-Free DNA: Analyze data on DRAGEN for ILMN Cell-Free DNA Prep with Enrichment on Illumina Connected Analytics or BaseSpace Sequence Hub at no additional charges. Basic subscription to Cloud platform required. Data storage not included. FFPE DNA: Analysis on DRAGEN Enrichment and Somatic not included.

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Illumina® Cell-Free and FFPE DNA Prep with Enrichment, Ligation (192 Samples, 4-plex), On-premises

20104104

Includes ligation based library prep and fast enrichment reagents for preparation of 192 libraries using Illumina Qualified Automation Methods, or 240 libraries manually, using 4-plex enrichment (pooling of 4 libraries in a single enrichment reaction). UMI Index Adapters are purchased separately and required for library preparation. Choose based on prep method. Enrichment panel not included.10,000 Gb, 1 yr DRAGEN Server License included. Illumina DRAGEN v4 Server required for Cell- free DNA analysis.

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패널 (3)

Illumina Custom Enrichment Panel V2 (32 µl, 120 bp)

20073953

Illumina Custom Enrichment Panel V2는 DesignStudio 또는 컨시어지 서비스를 사용하여 100개부터 최대 1,000,000개의 프로브까지 120 bp 이중 가닥 맞춤형 패널 설계를 지원하며 32 µl의 재료(Illumina DNA Prep with Enrichment와 페어링했을 때 8회의 인리치먼트 반응에 충분한 양)를 제공합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Illumina Custom Enrichment Panel V2 (384 µl, 120 bp)

20073952

Illumina Custom Enrichment Panel V2는 DesignStudio 또는 컨시어지 서비스를 사용하여 100개부터 최대 1,000,000개의 프로브까지 120 bp 이중 가닥 맞춤형 패널 설계를 지원하며 384 µl의 재료(Illumina DNA Prep with Enrichment와 페어링했을 때 96회의 인리치먼트 반응에 충분한 양)를 제공합니다. 라이브러리 준비, 인리치먼트 및 인덱스 어댑터 시약은 별도로 주문해야 합니다.

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Illumina Custom Enrichment Panel V2 (1536 µl, 120 bp)

20111339

Illumina Custom Enrichment Panel V2 enables 120 bp double-stranded custom panel design from 100 up to 1,000,000 probes using DesignStudio or Concierge Services and provides 1536 µl of material (sufficient for 384 enrichment reactions when paired with Illumina DNA Prep with Enrichment). Library prep, enrichment, and index adapter reagents need to be ordered separately.

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액세서리 제품 (6)

IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034701

UMI DNA 인덱스 앵커(플레이트 = 20031416, 박스 = 20032620) + Nextera 호환 고유 이중 인덱스 A(판매 키트 = 20027213, 플레이트 = 20025019, 박스 = 20026121)

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IDT® for Illumina® UMI DNA/RNA UD Indexes Set B, Ligation (96 Indexes, 96 Samples)

20034702

Illumina UMI DNA 인덱스 앵커 세트 B용 IDT

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IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set A for Automation

20066404

Illumina - UMI DNA/RNA UD 인덱스용 96 IDT 상자 1개 96개 샘플에 라벨을 부착하기에 충분한 자동화용 세트 A 및 Illumina - UMI DNA 인덱스 앵커용 96 IDT 상자 1개가 포함됩니다.

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IDT for Illumina UMI DNA/DNA Index Anchors Set B for Automation

20063213

Illumina - UMI DNA/RNA UD 인덱스용 96 IDT 1박스 자동화용 세트 B는 96개 샘플에 라벨을 부착하기에 충분하며 Illumina - UMI DNA 인덱스 앵커용 96 IDT 1박스가 포함되어 있습니다.

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Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set A, Ligation (96 indexes, 96 Samples)

20126235

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set A sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.

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Illumina UMI DNA/RNA UD v3 indexes Set B, Ligation (96 indexes, 96 Samples)

20126237

Includes one box of 96 Illumina DNA/RNA UD v3 Indexes Set B sufficient for labeling 96 samples and one box of 96 IDT for Illumina UMI DNA Index Anchors.

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서비스 (1)

Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment Training

20122119

This 2-day introductory course is designed to familiarize new users with the Illumina cfDNA Prep with Enrichment workflow through detailed hands- on instruction. Participants will learn all essential steps in the workflow, including manual library preparation, enrichment, sequencing, and data analysis.

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NovaSeq 6000 Reagent Kits

즉시 사용 가능한 사전 충전 시약 카트리지와 플로우 셀로 구성된 NovaSeq 6000 System용 시약 키트입니다.

TruSight Oncology 500

모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.

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